RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557673.5

NEK9-211, Transcript of NIMA related kinase 9, humanhuman

TSL 3

Gene NEK9, Length 657 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK9-211ENST00000557673 SLIT3O75094 1523 aa23.63■■□□□ 1.37
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NEK9-211ENST00000557673 NUP188Q5SRE5 1749 aa23.62■■□□□ 1.37
NEK9-211ENST00000557673 WDR17Q8IZU2 1322 aa23.6■■□□□ 1.37
NEK9-211ENST00000557673 KCNQ2O43526 872 aa23.6■■□□□ 1.37
NEK9-211ENST00000557673 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
NEK9-211ENST00000557673 DCAF8L1A6NGE4 600 aa23.59■■□□□ 1.37
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NEK9-211ENST00000557673 TTC21AQ8NDW8 1320 aa23.58■■□□□ 1.36
NEK9-211ENST00000557673 ARHGEF25Q86VW2 580 aa23.57■■□□□ 1.36
NEK9-211ENST00000557673 AXIN2Q9Y2T1 843 aa23.57■■□□□ 1.36
NEK9-211ENST00000557673 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
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NEK9-211ENST00000557673 PEAK1Q9H792 1746 aa23.55■■□□□ 1.36
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NEK9-211ENST00000557673 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
NEK9-211ENST00000557673 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa23.53■■□□□ 1.36
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NEK9-211ENST00000557673 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
NEK9-211ENST00000557673 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.53■■□□□ 1.36
NEK9-211ENST00000557673 EXOC5O00471 708 aa23.52■■□□□ 1.36
NEK9-211ENST00000557673 YY1P25490 414 aa23.52■■□□□ 1.36
NEK9-211ENST00000557673 COL18A1P39060 1754 aa23.52■■□□□ 1.36
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NEK9-211ENST00000557673 CCDC7Q96M83 1385 aa23.49■■□□□ 1.35
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NEK9-211ENST00000557673 PROM2Q8N271 834 aa23.46■■□□□ 1.35
NEK9-211ENST00000557673 ABCC6O95255 1503 aa23.45■■□□□ 1.34
NEK9-211ENST00000557673 STK32BQ9NY57 414 aa23.45■■□□□ 1.34
NEK9-211ENST00000557673 AKAP12Q02952 1782 aa23.44■■□□□ 1.34
NEK9-211ENST00000557673 WNK3Q9BYP7 1800 aa23.43■■□□□ 1.34
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NEK9-211ENST00000557673 NFAT5O94916 1531 aa23.43■■□□□ 1.34
NEK9-211ENST00000557673 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa23.42■■□□□ 1.34
NEK9-211ENST00000557673 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP23.42■■□□□ 1.34
NEK9-211ENST00000557673 USP31Q70CQ4 1352 aa23.41■■□□□ 1.34
NEK9-211ENST00000557673 ZBTB7AO95365 584 aa23.4■■□□□ 1.34
NEK9-211ENST00000557673 SLC15A2Q16348 729 aa23.4■■□□□ 1.34
NEK9-211ENST00000557673 NLRP2Q9NX02 1062 aa23.4■■□□□ 1.34
NEK9-211ENST00000557673 TNS2Q63HR2 1409 aa23.4■■□□□ 1.34
NEK9-211ENST00000557673 RGPD5Q99666 1765 aa23.4■■□□□ 1.34
NEK9-211ENST00000557673 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
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NEK9-211ENST00000557673 TMC1Q8TDI8 760 aa23.37■■□□□ 1.33
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NEK9-211ENST00000557673 MTFR1LQ9H019 292 aa23.35■■□□□ 1.33
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NEK9-211ENST00000557673 MON2Q7Z3U7 1717 aa23.34■■□□□ 1.33
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NEK9-211ENST00000557673 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa23.31■■□□□ 1.32
NEK9-211ENST00000557673 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa23.3■■□□□ 1.32
NEK9-211ENST00000557673 CD163L1Q9NR16 1453 aa23.3■■□□□ 1.32
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NEK9-211ENST00000557673 USP54Q70EL1 1684 aa23.29■■□□□ 1.32
NEK9-211ENST00000557673 TESK2Q96S53 571 aa23.29■■□□□ 1.32
NEK9-211ENST00000557673 SYT17Q9BSW7 474 aa23.28■■□□□ 1.32
NEK9-211ENST00000557673 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
NEK9-211ENST00000557673 SLC24A1O60721 1099 aa23.27■■□□□ 1.32
NEK9-211ENST00000557673 USP47Q96K76 1375 aa23.27■■□□□ 1.31
NEK9-211ENST00000557673 IP6K1Q92551 441 aa23.26■■□□□ 1.31
NEK9-211ENST00000557673 MYOM1P52179 1685 aa23.25■■□□□ 1.31
NEK9-211ENST00000557673 SGIP1Q9BQI5 828 aa23.25■■□□□ 1.31
NEK9-211ENST00000557673 LTN1O94822 1766 aa23.24■■□□□ 1.31
NEK9-211ENST00000557673 ARXQ96QS3 562 aa23.24■■□□□ 1.31
NEK9-211ENST00000557673 A0A1W2PP64 1363 aa23.24■■□□□ 1.31
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NEK9-211ENST00000557673 KAT6BQ8WYB5 2073 aa23.2■■□□□ 1.3
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NEK9-211ENST00000557673 MAP3K5Q99683 1374 aa23.19■■□□□ 1.3
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NEK9-211ENST00000557673 LRRC4BQ9NT99 713 aa23.19■■□□□ 1.3
NEK9-211ENST00000557673 BTAF1O14981 1849 aa23.19■■□□□ 1.3
NEK9-211ENST00000557673 ZNF827Q17R98 1081 aa23.18■■□□□ 1.3
NEK9-211ENST00000557673 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
NEK9-211ENST00000557673 PAPPAQ13219 1627 aa23.18■■□□□ 1.3
NEK9-211ENST00000557673 AMPHP49418 695 aa23.17■■□□□ 1.3
NEK9-211ENST00000557673 POLD1P28340 1107 aa23.16■■□□□ 1.3
NEK9-211ENST00000557673 AKT1S1Q96B36 256 aa23.16■■□□□ 1.3
NEK9-211ENST00000557673 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
NEK9-211ENST00000557673 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
NEK9-211ENST00000557673 MAP3K19Q56UN5 1328 aa23.14■■□□□ 1.3
NEK9-211ENST00000557673 HOXC9P31274 260 aa23.14■■□□□ 1.29
NEK9-211ENST00000557673 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa23.14■■□□□ 1.29
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