RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557415.5

PRMT5-225, Transcript of protein arginine methyltransferase 5, human

TSL 2

Gene PRMT5, Length 584 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRMT5-225	ENST00000557415	USP54	Q70EL1	1684 aa		32.4	■■■□□ 2.78
PRMT5-225	ENST00000557415	PEAK1	Q9H792	1746 aa		32.4	■■■□□ 2.78
PRMT5-225	ENST00000557415	APBA3	O96018	575 aa		32.4	■■■□□ 2.78
PRMT5-225	ENST00000557415	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		32.4	■■■□□ 2.78
PRMT5-225	ENST00000557415	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		32.4	■■■□□ 2.78
PRMT5-225	ENST00000557415	RGPD5	Q99666	1765 aa		32.4	■■■□□ 2.78
PRMT5-225	ENST00000557415	ABCC6	O95255	1503 aa		32.39	■■■□□ 2.78
PRMT5-225	ENST00000557415	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		32.38	■■■□□ 2.77
PRMT5-225	ENST00000557415	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		32.37	■■■□□ 2.77
PRMT5-225	ENST00000557415	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		32.35	■■■□□ 2.77
PRMT5-225	ENST00000557415	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		32.35	■■■□□ 2.77
PRMT5-225	ENST00000557415	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		32.35	■■■□□ 2.77
PRMT5-225	ENST00000557415	USP31	Q70CQ4	1352 aa		32.35	■■■□□ 2.77
PRMT5-225	ENST00000557415	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	32.35	■■■□□ 2.77
PRMT5-225	ENST00000557415	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		32.34	■■■□□ 2.77
PRMT5-225	ENST00000557415	SBF2	Q86WG5	1849 aa		32.34	■■■□□ 2.77
PRMT5-225	ENST00000557415	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	32.32	■■■□□ 2.76
PRMT5-225	ENST00000557415	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	32.32	■■■□□ 2.76
PRMT5-225	ENST00000557415	DDB1	Q16531	1140 aa		32.31	■■■□□ 2.76
PRMT5-225	ENST00000557415	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		32.3	■■■□□ 2.76
PRMT5-225	ENST00000557415	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	32.3	■■■□□ 2.76
PRMT5-225	ENST00000557415	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		32.3	■■■□□ 2.76
PRMT5-225	ENST00000557415	SOX12	O15370	315 aa		32.29	■■■□□ 2.76
PRMT5-225	ENST00000557415	BCL9	O00512	1426 aa		32.27	■■■□□ 2.76
PRMT5-225	ENST00000557415	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	32.27	■■■□□ 2.76
PRMT5-225	ENST00000557415	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	32.26	■■■□□ 2.76
PRMT5-225	ENST00000557415	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	32.26	■■■□□ 2.75
PRMT5-225	ENST00000557415	TMC1	Q8TDI8	760 aa		32.25	■■■□□ 2.75
PRMT5-225	ENST00000557415	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		32.25	■■■□□ 2.75
PRMT5-225	ENST00000557415	NME9	Q86XW9	330 aa		32.24	■■■□□ 2.75
PRMT5-225	ENST00000557415	LTN1	O94822	1766 aa		32.24	■■■□□ 2.75
PRMT5-225	ENST00000557415	CCDC7	Q96M83	1385 aa		32.23	■■■□□ 2.75
PRMT5-225	ENST00000557415	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		32.23	■■■□□ 2.75
PRMT5-225	ENST00000557415		A0A1W2PP64	1363 aa		32.22	■■■□□ 2.75
PRMT5-225	ENST00000557415	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		32.22	■■■□□ 2.75
PRMT5-225	ENST00000557415	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	32.21	■■■□□ 2.75
PRMT5-225	ENST00000557415	TESK2	Q96S53	571 aa		32.21	■■■□□ 2.75
PRMT5-225	ENST00000557415	NBPF14	Q5TI25	921 aa		32.2	■■■□□ 2.75
PRMT5-225	ENST00000557415	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		32.19	■■■□□ 2.74
PRMT5-225	ENST00000557415	PLSCR1	O15162	318 aa		32.19	■■■□□ 2.74
PRMT5-225	ENST00000557415	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	32.19	■■■□□ 2.74
PRMT5-225	ENST00000557415	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	32.18	■■■□□ 2.74
PRMT5-225	ENST00000557415	ERBB3	P21860	1342 aa		32.18	■■■□□ 2.74
PRMT5-225	ENST00000557415	SLC24A1	O60721	1099 aa		32.17	■■■□□ 2.74
PRMT5-225	ENST00000557415	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		32.15	■■■□□ 2.74
PRMT5-225	ENST00000557415	TNS2	Q63HR2	1409 aa		32.15	■■■□□ 2.74
PRMT5-225	ENST00000557415	EXOC5	O00471	708 aa		32.13	■■■□□ 2.73
PRMT5-225	ENST00000557415	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		32.12	■■■□□ 2.73
PRMT5-225	ENST00000557415	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		32.07	■■■□□ 2.72
PRMT5-225	ENST00000557415	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		32.06	■■■□□ 2.72
PRMT5-225	ENST00000557415	NHS	Q6T4R5	1651 aa		32.05	■■■□□ 2.72
PRMT5-225	ENST00000557415	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	32.05	■■■□□ 2.72
PRMT5-225	ENST00000557415	IL2RB	P14784	551 aa		32.04	■■■□□ 2.72
PRMT5-225	ENST00000557415	PROM2	Q8N271	834 aa		32.04	■■■□□ 2.72
PRMT5-225	ENST00000557415	IP6K1	Q92551	441 aa		32.03	■■■□□ 2.72
PRMT5-225	ENST00000557415	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		32.03	■■■□□ 2.72
PRMT5-225	ENST00000557415	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	32.01	■■■□□ 2.71
PRMT5-225	ENST00000557415	USP47	Q96K76	1375 aa		32.01	■■■□□ 2.71
PRMT5-225	ENST00000557415	CASZ1	Q86V15	1759 aa		32	■■■□□ 2.71
PRMT5-225	ENST00000557415	COG3	Q96JB2	828 aa		31.99	■■■□□ 2.71
PRMT5-225	ENST00000557415	SPON1	Q9HCB6	807 aa		31.98	■■■□□ 2.71
PRMT5-225	ENST00000557415	KCNQ2	O43526	872 aa		31.97	■■■□□ 2.71
PRMT5-225	ENST00000557415	TMF1	P82094	1093 aa		31.97	■■■□□ 2.71
PRMT5-225	ENST00000557415	TXNRD1	Q16881	649 aa		31.96	■■■□□ 2.71
PRMT5-225	ENST00000557415	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		31.95	■■■□□ 2.7
PRMT5-225	ENST00000557415	BTAF1	O14981	1849 aa		31.92	■■■□□ 2.7
PRMT5-225	ENST00000557415	HOXC9	P31274	260 aa		31.91	■■■□□ 2.7
PRMT5-225	ENST00000557415	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		31.89	■■■□□ 2.7
PRMT5-225	ENST00000557415	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		31.89	■■■□□ 2.7
PRMT5-225	ENST00000557415	RTL1	A6NKG5	1358 aa		31.89	■■■□□ 2.7
PRMT5-225	ENST00000557415	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		31.88	■■■□□ 2.69
PRMT5-225	ENST00000557415	FYB1	O15117	783 aa		31.88	■■■□□ 2.69
PRMT5-225	ENST00000557415	CDCA8	Q53HL2	280 aa		31.88	■■■□□ 2.69
PRMT5-225	ENST00000557415	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		31.87	■■■□□ 2.69
PRMT5-225	ENST00000557415	AMPH	P49418	695 aa		31.87	■■■□□ 2.69
PRMT5-225	ENST00000557415	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	31.87	■■■□□ 2.69
PRMT5-225	ENST00000557415	PAPPA	Q13219	1627 aa		31.86	■■■□□ 2.69
PRMT5-225	ENST00000557415	FBLN1	P23142	703 aa		31.86	■■■□□ 2.69
PRMT5-225	ENST00000557415	STK32B	Q9NY57	414 aa		31.86	■■■□□ 2.69
PRMT5-225	ENST00000557415	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		31.85	■■■□□ 2.69
PRMT5-225	ENST00000557415	SLC15A2	Q16348	729 aa		31.85	■■■□□ 2.69
PRMT5-225	ENST00000557415	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	31.85	■■■□□ 2.69
PRMT5-225	ENST00000557415	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	31.85	■■■□□ 2.69
PRMT5-225	ENST00000557415	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		31.83	■■■□□ 2.69
PRMT5-225	ENST00000557415	MYOM1	P52179	1685 aa		31.83	■■■□□ 2.69
PRMT5-225	ENST00000557415	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		31.82	■■■□□ 2.68
PRMT5-225	ENST00000557415	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		31.82	■■■□□ 2.68
PRMT5-225	ENST00000557415	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	31.79	■■■□□ 2.68
PRMT5-225	ENST00000557415	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	31.79	■■■□□ 2.68
PRMT5-225	ENST00000557415	MEGF6	O75095	1541 aa		31.78	■■■□□ 2.68
PRMT5-225	ENST00000557415	ZBTB7A	O95365	584 aa		31.77	■■■□□ 2.68
PRMT5-225	ENST00000557415	PTGER2	P43116	358 aa		31.76	■■■□□ 2.67
PRMT5-225	ENST00000557415	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		31.76	■■■□□ 2.67
PRMT5-225	ENST00000557415	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		31.75	■■■□□ 2.67
PRMT5-225	ENST00000557415	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		31.74	■■■□□ 2.67
PRMT5-225	ENST00000557415	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	31.74	■■■□□ 2.67
PRMT5-225	ENST00000557415	NBPF4	Q96M43	638 aa		31.74	■■■□□ 2.67
PRMT5-225	ENST00000557415	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	31.74	■■■□□ 2.67
PRMT5-225	ENST00000557415	INSR	P06213	1382 aa		31.73	■■■□□ 2.67
PRMT5-225	ENST00000557415	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		31.73	■■■□□ 2.67

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