RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557207.1

GPATCH2L-211, Transcript of G-patch domain containing 2 like, humanhuman

TSL 2

Gene GPATCH2L, Length 529 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPATCH2L-211ENST00000557207 WDR17Q8IZU2 1322 aa22.86■■□□□ 1.25
GPATCH2L-211ENST00000557207 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
GPATCH2L-211ENST00000557207 SOX12O15370 315 aa22.86■■□□□ 1.25
GPATCH2L-211ENST00000557207 ARHGEF25Q86VW2 580 aa22.86■■□□□ 1.25
GPATCH2L-211ENST00000557207 NUP188Q5SRE5 1749 aa22.85■■□□□ 1.25
GPATCH2L-211ENST00000557207 PEAK1Q9H792 1746 aa22.85■■□□□ 1.25
GPATCH2L-211ENST00000557207 DDB1Q16531 1140 aa22.84■■□□□ 1.25
GPATCH2L-211ENST00000557207 CARD11Q9BXL7 1154 aa22.84■■□□□ 1.25
GPATCH2L-211ENST00000557207 NFAT5O94916 1531 aa22.83■■□□□ 1.25
GPATCH2L-211ENST00000557207 MON2Q7Z3U7 1717 aa22.82■■□□□ 1.24
GPATCH2L-211ENST00000557207 WNK3Q9BYP7 1800 aa22.82■■□□□ 1.24
GPATCH2L-211ENST00000557207 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa22.81■■□□□ 1.24
GPATCH2L-211ENST00000557207 NBPF14Q5TI25 921 aa22.8■■□□□ 1.24
GPATCH2L-211ENST00000557207 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
GPATCH2L-211ENST00000557207 TONSLQ96HA7 1378 aa22.79■■□□□ 1.24
GPATCH2L-211ENST00000557207 ABCC6O95255 1503 aa22.79■■□□□ 1.24
GPATCH2L-211ENST00000557207 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP22.78■■□□□ 1.24
GPATCH2L-211ENST00000557207 CARD10Q9BWT7 1032 aa22.78■■□□□ 1.24
GPATCH2L-211ENST00000557207 RGPD5Q99666 1765 aa22.78■■□□□ 1.24
GPATCH2L-211ENST00000557207 CD163L1Q9NR16 1453 aa22.78■■□□□ 1.24
GPATCH2L-211ENST00000557207 USP31Q70CQ4 1352 aa22.76■■□□□ 1.23
GPATCH2L-211ENST00000557207 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
GPATCH2L-211ENST00000557207 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa22.76■■□□□ 1.23
GPATCH2L-211ENST00000557207 TMC1Q8TDI8 760 aa22.76■■□□□ 1.23
GPATCH2L-211ENST00000557207 SBF2Q86WG5 1849 aa22.75■■□□□ 1.23
GPATCH2L-211ENST00000557207 USP54Q70EL1 1684 aa22.75■■□□□ 1.23
GPATCH2L-211ENST00000557207 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
GPATCH2L-211ENST00000557207 CCDC7Q96M83 1385 aa22.75■■□□□ 1.23
GPATCH2L-211ENST00000557207 BCL9O00512 1426 aa22.74■■□□□ 1.23
GPATCH2L-211ENST00000557207 PLSCR1O15162 318 aa22.74■■□□□ 1.23
GPATCH2L-211ENST00000557207 NME9Q86XW9 330 aa22.74■■□□□ 1.23
GPATCH2L-211ENST00000557207 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
GPATCH2L-211ENST00000557207 PTF1AQ7RTS3 328 aa22.73■■□□□ 1.23
GPATCH2L-211ENST00000557207 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
GPATCH2L-211ENST00000557207 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa22.72■■□□□ 1.23
GPATCH2L-211ENST00000557207 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
GPATCH2L-211ENST00000557207 TNS2Q63HR2 1409 aa22.71■■□□□ 1.23
GPATCH2L-211ENST00000557207 EXOC5O00471 708 aa22.7■■□□□ 1.22
GPATCH2L-211ENST00000557207 ERBB3P21860 1342 aa22.7■■□□□ 1.22
GPATCH2L-211ENST00000557207 A0A1W2PP64 1363 aa22.69■■□□□ 1.22
GPATCH2L-211ENST00000557207 TERF2IPQ9NYB0 399 aa22.69■■□□□ 1.22
GPATCH2L-211ENST00000557207 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
GPATCH2L-211ENST00000557207 SPON1Q9HCB6 807 aa22.67■■□□□ 1.22
GPATCH2L-211ENST00000557207 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
GPATCH2L-211ENST00000557207 NLRP2Q9NX02 1062 aa22.67■■□□□ 1.22
GPATCH2L-211ENST00000557207 LTN1O94822 1766 aa22.67■■□□□ 1.22
GPATCH2L-211ENST00000557207 KCNQ2O43526 872 aa22.64■■□□□ 1.21
GPATCH2L-211ENST00000557207 PROM2Q8N271 834 aa22.64■■□□□ 1.21
GPATCH2L-211ENST00000557207 ANKRD24Q8TF21 1146 aa22.64■■□□□ 1.21
GPATCH2L-211ENST00000557207 NINLQ9Y2I6 1382 aa22.63■■□□□ 1.21
GPATCH2L-211ENST00000557207 TESK2Q96S53 571 aa22.63■■□□□ 1.21
GPATCH2L-211ENST00000557207 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
GPATCH2L-211ENST00000557207 IL2RBP14784 551 aa22.62■■□□□ 1.21
GPATCH2L-211ENST00000557207 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa22.61■■□□□ 1.21
GPATCH2L-211ENST00000557207 NHSQ6T4R5 1651 aa22.61■■□□□ 1.21
GPATCH2L-211ENST00000557207 TXNRD1Q16881 649 aa22.6■■□□□ 1.21
GPATCH2L-211ENST00000557207 CASZ1Q86V15 1759 aa22.6■■□□□ 1.21
GPATCH2L-211ENST00000557207 ACSBG1Q96GR2 724 aa22.58■■□□□ 1.21
GPATCH2L-211ENST00000557207 SLC24A1O60721 1099 aa22.57■■□□□ 1.2
GPATCH2L-211ENST00000557207 IP6K1Q92551 441 aa22.57■■□□□ 1.2
GPATCH2L-211ENST00000557207 STK32BQ9NY57 414 aa22.57■■□□□ 1.2
GPATCH2L-211ENST00000557207 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
GPATCH2L-211ENST00000557207 COG3Q96JB2 828 aa22.55■■□□□ 1.2
GPATCH2L-211ENST00000557207 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
GPATCH2L-211ENST00000557207 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa22.53■■□□□ 1.2
GPATCH2L-211ENST00000557207 ZBTB7AO95365 584 aa22.53■■□□□ 1.2
GPATCH2L-211ENST00000557207 SLC15A2Q16348 729 aa22.53■■□□□ 1.2
GPATCH2L-211ENST00000557207 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
GPATCH2L-211ENST00000557207 MAP3K19Q56UN5 1328 aa22.53■■□□□ 1.2
GPATCH2L-211ENST00000557207 USP47Q96K76 1375 aa22.5■■□□□ 1.19
GPATCH2L-211ENST00000557207 BTAF1O14981 1849 aa22.5■■□□□ 1.19
GPATCH2L-211ENST00000557207 HOXC9P31274 260 aa22.5■■□□□ 1.19
GPATCH2L-211ENST00000557207 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
GPATCH2L-211ENST00000557207 AMPHP49418 695 aa22.49■■□□□ 1.19
GPATCH2L-211ENST00000557207 TMF1P82094 1093 aa22.49■■□□□ 1.19
GPATCH2L-211ENST00000557207 PAPPAQ13219 1627 aa22.49■■□□□ 1.19
GPATCH2L-211ENST00000557207 FBLN1P23142 703 aa22.48■■□□□ 1.19
GPATCH2L-211ENST00000557207 PTGER2P43116 358 aa22.48■■□□□ 1.19
GPATCH2L-211ENST00000557207 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
GPATCH2L-211ENST00000557207 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
GPATCH2L-211ENST00000557207 MYOM1P52179 1685 aa22.48■■□□□ 1.19
GPATCH2L-211ENST00000557207 DCAF8L1A6NGE4 600 aa22.47■■□□□ 1.19
GPATCH2L-211ENST00000557207 RTL1A6NKG5 1358 aa22.47■■□□□ 1.19
GPATCH2L-211ENST00000557207 YY1P25490 414 aa22.45■■□□□ 1.18
GPATCH2L-211ENST00000557207 MTFR1LQ9H019 292 aa22.45■■□□□ 1.18
GPATCH2L-211ENST00000557207 KAT6BQ8WYB5 2073 aa22.44■■□□□ 1.18
GPATCH2L-211ENST00000557207 GGNBP2Q9H3C7 697 aa22.44■■□□□ 1.18
GPATCH2L-211ENST00000557207 FYB1O15117 783 aa22.43■■□□□ 1.18
GPATCH2L-211ENST00000557207 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
GPATCH2L-211ENST00000557207 MEGF6O75095 1541 aa22.42■■□□□ 1.18
GPATCH2L-211ENST00000557207 LRRC4BQ9NT99 713 aa22.42■■□□□ 1.18
GPATCH2L-211ENST00000557207 ZNF827Q17R98 1081 aa22.41■■□□□ 1.18
GPATCH2L-211ENST00000557207 RGPD2P0DJD1 1756 aa22.4■■□□□ 1.18
GPATCH2L-211ENST00000557207 CDCA8Q53HL2 280 aa22.4■■□□□ 1.18
GPATCH2L-211ENST00000557207 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
GPATCH2L-211ENST00000557207 SGIP1Q9BQI5 828 aa22.4■■□□□ 1.18
GPATCH2L-211ENST00000557207 DOT1LQ8TEK3 1739 aa22.4■■□□□ 1.18
GPATCH2L-211ENST00000557207 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
GPATCH2L-211ENST00000557207 SLC27A3Q5K4L6 730 aa22.39■■□□□ 1.17
GPATCH2L-211ENST00000557207 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms