RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556049.1

PITX2-208, Transcript of paired like homeodomain 2, human

TSL 2

Gene PITX2, Length 941 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PITX2-208	ENST00000556049	NEUROD1	Q13562	356 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PITX2-208	ENST00000556049	NBPF14	Q5TI25	921 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PITX2-208	ENST00000556049	SSH2	Q76I76	1423 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PITX2-208	ENST00000556049	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
PITX2-208	ENST00000556049	EVC2	Q86UK5	1308 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PITX2-208	ENST00000556049	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PITX2-208	ENST00000556049	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PITX2-208	ENST00000556049	CPD	O75976	1380 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PITX2-208	ENST00000556049	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
PITX2-208	ENST00000556049	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PITX2-208	ENST00000556049	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PITX2-208	ENST00000556049	USP19	O94966	1318 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PITX2-208	ENST00000556049	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
PITX2-208	ENST00000556049	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PITX2-208	ENST00000556049	SOX12	O15370	315 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PITX2-208	ENST00000556049	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PITX2-208	ENST00000556049	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
PITX2-208	ENST00000556049	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
PITX2-208	ENST00000556049	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PITX2-208	ENST00000556049	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
PITX2-208	ENST00000556049	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PITX2-208	ENST00000556049	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
PITX2-208	ENST00000556049	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PITX2-208	ENST00000556049	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PITX2-208	ENST00000556049	DISP2	A7MBM2	1401 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PITX2-208	ENST00000556049	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PITX2-208	ENST00000556049	DDB1	Q16531	1140 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PITX2-208	ENST00000556049	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
PITX2-208	ENST00000556049	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PITX2-208	ENST00000556049	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
PITX2-208	ENST00000556049	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PITX2-208	ENST00000556049	USP6	P35125	1406 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PITX2-208	ENST00000556049	CRB1	P82279	1406 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PITX2-208	ENST00000556049	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PITX2-208	ENST00000556049	LRP5	O75197	1615 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PITX2-208	ENST00000556049	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
PITX2-208	ENST00000556049	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PITX2-208	ENST00000556049	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
PITX2-208	ENST00000556049	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
PITX2-208	ENST00000556049	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PITX2-208	ENST00000556049	TMC1	Q8TDI8	760 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PITX2-208	ENST00000556049	TONSL	Q96HA7	1378 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PITX2-208	ENST00000556049	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PITX2-208	ENST00000556049	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PITX2-208	ENST00000556049	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PITX2-208	ENST00000556049	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PITX2-208	ENST00000556049	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PITX2-208	ENST00000556049	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PITX2-208	ENST00000556049	EXOC5	O00471	708 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PITX2-208	ENST00000556049	ABCB7	O75027	752 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PITX2-208	ENST00000556049	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	13.76	□□□□□ -0.21
PITX2-208	ENST00000556049	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
PITX2-208	ENST00000556049	SPON1	Q9HCB6	807 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PITX2-208	ENST00000556049	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PITX2-208	ENST00000556049	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
PITX2-208	ENST00000556049	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PITX2-208	ENST00000556049	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PITX2-208	ENST00000556049	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PITX2-208	ENST00000556049	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PITX2-208	ENST00000556049	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PITX2-208	ENST00000556049	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PITX2-208	ENST00000556049	PLSCR1	O15162	318 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PITX2-208	ENST00000556049	KCNQ2	O43526	872 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PITX2-208	ENST00000556049	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PITX2-208	ENST00000556049	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PITX2-208	ENST00000556049	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PITX2-208	ENST00000556049	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
PITX2-208	ENST00000556049	SLIT3	O75094	1523 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PITX2-208	ENST00000556049	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PITX2-208	ENST00000556049	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PITX2-208	ENST00000556049	STK32B	Q9NY57	414 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PITX2-208	ENST00000556049	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
PITX2-208	ENST00000556049	CCDC7	Q96M83	1385 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PITX2-208	ENST00000556049	YY1	P25490	414 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PITX2-208	ENST00000556049	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PITX2-208	ENST00000556049	NME9	Q86XW9	330 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PITX2-208	ENST00000556049	PIK3C2A	O00443	1686 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PITX2-208	ENST00000556049	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PITX2-208	ENST00000556049	ZBTB7A	O95365	584 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PITX2-208	ENST00000556049	NBR1	Q14596	966 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PITX2-208	ENST00000556049	TXNRD1	Q16881	649 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PITX2-208	ENST00000556049	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PITX2-208	ENST00000556049	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PITX2-208	ENST00000556049	IL2RB	P14784	551 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PITX2-208	ENST00000556049	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PITX2-208	ENST00000556049	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
PITX2-208	ENST00000556049	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
PITX2-208	ENST00000556049	RREB1	Q92766	1687 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PITX2-208	ENST00000556049	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
PITX2-208	ENST00000556049	LRRC37A3	O60309	1634 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PITX2-208	ENST00000556049	PROM2	Q8N271	834 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PITX2-208	ENST00000556049	COL18A1	P39060	1754 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PITX2-208	ENST00000556049	ERBB3	P21860	1342 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PITX2-208	ENST00000556049	USP31	Q70CQ4	1352 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PITX2-208	ENST00000556049	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PITX2-208	ENST00000556049	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PITX2-208	ENST00000556049	SLC15A2	Q16348	729 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PITX2-208	ENST00000556049	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
PITX2-208	ENST00000556049	COG3	Q96JB2	828 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PITX2-208	ENST00000556049	BCL9	O00512	1426 aa		13.62	□□□□□ -0.23

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