RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555562.1

FOXN3-AS1-201, FOXN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXN3-AS1, Length 1,077 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa27.6■■■□□ 2.01
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OVOS2Q6IE36 1432 aa27.6■■■□□ 2.01
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 COL18A1P39060 1754 aa27.6■■■□□ 2.01
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SOX12O15370 315 aa27.58■■■□□ 2.01
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CARD10Q9BWT7 1032 aa27.58■■■□□ 2.01
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa27.58■■■□□ 2.01
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PLSCR1O15162 318 aa27.57■■■□□ 2
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa27.56■■■□□ 2
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CARD11Q9BXL7 1154 aa27.56■■■□□ 2
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RREB1Q92766 1687 aa27.56■■■□□ 2
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP27.55■■■□□ 2
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 AKAP12Q02952 1782 aa27.55■■■□□ 2
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PEAK1Q9H792 1746 aa27.53■■■□□ 2
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NUP188Q5SRE5 1749 aa27.52■■■□□ 2
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP27.51■■□□□ 1.99
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LRRC37A3O60309 1634 aa27.51■■□□□ 1.99
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BCL9O00512 1426 aa27.5■■□□□ 1.99
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 USP31Q70CQ4 1352 aa27.5■■□□□ 1.99
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 EXOC5O00471 708 aa27.5■■□□□ 1.99
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMC1Q8TDI8 760 aa27.49■■□□□ 1.99
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NFAT5O94916 1531 aa27.49■■□□□ 1.99
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP27.48■■□□□ 1.99
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CCDC7Q96M83 1385 aa27.48■■□□□ 1.99
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PTF1AQ7RTS3 328 aa27.47■■□□□ 1.99
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SPON1Q9HCB6 807 aa27.47■■□□□ 1.99
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NME9Q86XW9 330 aa27.46■■□□□ 1.99
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa27.46■■□□□ 1.99
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KCNQ2O43526 872 aa27.45■■□□□ 1.98
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SBF2Q86WG5 1849 aa27.45■■□□□ 1.98
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ABCC6O95255 1503 aa27.45■■□□□ 1.98
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RGPD5Q99666 1765 aa27.45■■□□□ 1.98
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TERF2IPQ9NYB0 399 aa27.44■■□□□ 1.98
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TONSLQ96HA7 1378 aa27.44■■□□□ 1.98
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MON2Q7Z3U7 1717 aa27.44■■□□□ 1.98
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CD163L1Q9NR16 1453 aa27.44■■□□□ 1.98
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PROM2Q8N271 834 aa27.43■■□□□ 1.98
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa27.42■■□□□ 1.98
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 WNK3Q9BYP7 1800 aa27.41■■□□□ 1.98
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NLRP2Q9NX02 1062 aa27.4■■□□□ 1.98
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ERBB3P21860 1342 aa27.4■■□□□ 1.98
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.97
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TNS2Q63HR2 1409 aa27.36■■□□□ 1.97
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLC24A1O60721 1099 aa27.36■■□□□ 1.97
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TXNRD1Q16881 649 aa27.36■■□□□ 1.97
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ANKRD24Q8TF21 1146 aa27.36■■□□□ 1.97
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 USP54Q70EL1 1684 aa27.36■■□□□ 1.97
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IL2RBP14784 551 aa27.35■■□□□ 1.97
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 A0A1W2PP64 1363 aa27.35■■□□□ 1.97
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CLSPNQ9HAW4 1339 aa27.34■■□□□ 1.97
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TESK2Q96S53 571 aa27.32■■□□□ 1.96
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 STK32BQ9NY57 414 aa27.32■■□□□ 1.96
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa27.31■■□□□ 1.96
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IP6K1Q92551 441 aa27.31■■□□□ 1.96
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NINLQ9Y2I6 1382 aa27.3■■□□□ 1.96
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DCAF8L1A6NGE4 600 aa27.29■■□□□ 1.96
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLC15A2Q16348 729 aa27.29■■□□□ 1.96
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ACSBG1Q96GR2 724 aa27.28■■□□□ 1.96
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LTN1O94822 1766 aa27.27■■□□□ 1.96
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZBTB7AO95365 584 aa27.26■■□□□ 1.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 COG3Q96JB2 828 aa27.26■■□□□ 1.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CASZ1Q86V15 1759 aa27.24■■□□□ 1.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NHSQ6T4R5 1651 aa27.21■■□□□ 1.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 YY1P25490 414 aa27.21■■□□□ 1.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PTGER2P43116 358 aa27.21■■□□□ 1.95
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MAP3K19Q56UN5 1328 aa27.19■■□□□ 1.94
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 AMPHP49418 695 aa27.19■■□□□ 1.94
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MTFR1LQ9H019 292 aa27.19■■□□□ 1.94
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HOXC9P31274 260 aa27.18■■□□□ 1.94
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa27.17■■□□□ 1.94
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMF1P82094 1093 aa27.16■■□□□ 1.94
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FBLN1P23142 703 aa27.15■■□□□ 1.94
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LRRC4BQ9NT99 713 aa27.13■■□□□ 1.93
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa27.13■■□□□ 1.93
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KAT6BQ8WYB5 2073 aa27.12■■□□□ 1.93
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FYB1O15117 783 aa27.12■■□□□ 1.93
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLC27A3Q5K4L6 730 aa27.12■■□□□ 1.93
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SGIP1Q9BQI5 828 aa27.12■■□□□ 1.93
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BTAF1O14981 1849 aa27.11■■□□□ 1.93
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 USP47Q96K76 1375 aa27.09■■□□□ 1.93
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF827Q17R98 1081 aa27.09■■□□□ 1.93
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CDCA8Q53HL2 280 aa27.09■■□□□ 1.93
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SYT17Q9BSW7 474 aa27.09■■□□□ 1.93
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GGNBP2Q9H3C7 697 aa27.09■■□□□ 1.93
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RTL1A6NKG5 1358 aa27.09■■□□□ 1.93
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.3 ms