RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550159.5

CS-218, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 646 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-218ENST00000550159 PLSCR1O15162 318 aa13.15□□□□□ -0.3
CS-218ENST00000550159 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
CS-218ENST00000550159 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
CS-218ENST00000550159 KIAA0232Q92628 1395 aa13.15□□□□□ -0.3
CS-218ENST00000550159 CCDC7Q96M83 1385 aa13.15□□□□□ -0.3
CS-218ENST00000550159 PLEKHG3A1L390 1219 aa13.14□□□□□ -0.31
CS-218ENST00000550159 MYOM1P52179 1685 aa13.14□□□□□ -0.31
CS-218ENST00000550159 CHD4Q14839 1912 aa13.13□□□□□ -0.31
CS-218ENST00000550159 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
CS-218ENST00000550159 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
CS-218ENST00000550159 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
CS-218ENST00000550159 TCP11L2Q8N4U5 519 aa13.13□□□□□ -0.31
CS-218ENST00000550159 ACEP12821 1306 aa13.13□□□□□ -0.31
CS-218ENST00000550159 ATP7BP35670 1465 aa13.12□□□□□ -0.31
CS-218ENST00000550159 ARXQ96QS3 562 aa13.12□□□□□ -0.31
CS-218ENST00000550159 MTFR1LQ9H019 292 aa13.12□□□□□ -0.31
CS-218ENST00000550159 STK32BQ9NY57 414 aa13.12□□□□□ -0.31
CS-218ENST00000550159 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
CS-218ENST00000550159 CGNL1Q0VF96 1302 aa13.12□□□□□ -0.31
CS-218ENST00000550159 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa13.11□□□□□ -0.31
CS-218ENST00000550159 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
CS-218ENST00000550159 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa13.11□□□□□ -0.31
CS-218ENST00000550159 WASHC2AQ641Q2 1341 aa13.11□□□□□ -0.31
CS-218ENST00000550159 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
CS-218ENST00000550159 CASZ1Q86V15 1759 aa13.1□□□□□ -0.31
CS-218ENST00000550159 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
CS-218ENST00000550159 PROM2Q8N271 834 aa13.1□□□□□ -0.31
CS-218ENST00000550159 PANK3Q9H999 370 aa13.1□□□□□ -0.31
CS-218ENST00000550159 TTC21AQ8NDW8 1320 aa13.1□□□□□ -0.31
CS-218ENST00000550159 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
CS-218ENST00000550159 SSH2Q76I76 1423 aa13.09□□□□□ -0.31
CS-218ENST00000550159 PTF1AQ7RTS3 328 aa13.09□□□□□ -0.31
CS-218ENST00000550159 SGIP1Q9BQI5 828 aa13.09□□□□□ -0.31
CS-218ENST00000550159 SLC15A2Q16348 729 aa13.08□□□□□ -0.32
CS-218ENST00000550159 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
CS-218ENST00000550159 PRR36Q9H6K5 1346 aa13.08□□□□□ -0.32
CS-218ENST00000550159 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
CS-218ENST00000550159 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
CS-218ENST00000550159 HSPA6P17066 643 aa13.07□□□□□ -0.32
CS-218ENST00000550159 ABTB2Q8N961 1025 aa13.07□□□□□ -0.32
CS-218ENST00000550159 COG3Q96JB2 828 aa13.07□□□□□ -0.32
CS-218ENST00000550159 NUTM2GQ5VZR2 741 aa13.06□□□□□ -0.32
CS-218ENST00000550159 NLRP13Q86W25 1043 aa13.06□□□□□ -0.32
CS-218ENST00000550159 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP13.06□□□□□ -0.32
CS-218ENST00000550159 KLHL34Q8N239 644 aa13.06□□□□□ -0.32
CS-218ENST00000550159 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-218ENST00000550159 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-218ENST00000550159 OVOS2Q6IE36 1432 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-218ENST00000550159 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
CS-218ENST00000550159 ANP32CO43423 234 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-218ENST00000550159 TXNRD1Q16881 649 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-218ENST00000550159 ALS2Q96Q42 1657 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-218ENST00000550159 A0A1W2PP64 1363 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-218ENST00000550159 NSD2O96028 1365 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-218ENST00000550159 MAP3K5Q99683 1374 aa13.05□□□□□ -0.32
CS-218ENST00000550159 NLRP6P59044 892 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-218ENST00000550159 USP6P35125 1406 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-218ENST00000550159 NSD3Q9BZ95 1437 aa13.04□□□□□ -0.32
CS-218ENST00000550159 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-218ENST00000550159 DDB1Q16531 1140 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-218ENST00000550159 MORC1Q86VD1 984 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-218ENST00000550159 KCNH5Q8NCM2 988 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-218ENST00000550159 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa13.03□□□□□ -0.32
CS-218ENST00000550159 CAPN15O75808 1086 aa13.02□□□□□ -0.33
CS-218ENST00000550159 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
CS-218ENST00000550159 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
CS-218ENST00000550159 SHANK3Q9BYB0 1731 aa13□□□□□ -0.33
CS-218ENST00000550159 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
CS-218ENST00000550159 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
CS-218ENST00000550159 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa12.99□□□□□ -0.33
CS-218ENST00000550159 GRIN3BO60391 1043 aa12.99□□□□□ -0.33
CS-218ENST00000550159 RALBP1Q15311 655 aa12.99□□□□□ -0.33
CS-218ENST00000550159 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa12.99□□□□□ -0.33
CS-218ENST00000550159 ATP10DQ9P241 1426 aa12.98□□□□□ -0.33
CS-218ENST00000550159 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
CS-218ENST00000550159 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
CS-218ENST00000550159 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
CS-218ENST00000550159 AKAP12Q02952 1782 aa12.98□□□□□ -0.33
CS-218ENST00000550159 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa12.97□□□□□ -0.33
CS-218ENST00000550159 POLD1P28340 1107 aa12.97□□□□□ -0.33
CS-218ENST00000550159 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
CS-218ENST00000550159 CFAP53Q96M91 514 aa12.97□□□□□ -0.33
CS-218ENST00000550159 PEAK1Q9H792 1746 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-218ENST00000550159 ZBTB7CA1YPR0 619 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-218ENST00000550159 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP12.96□□□□□ -0.335e-10■□□□□ 9.3
CS-218ENST00000550159 NLGN2Q8NFZ4 835 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-218ENST00000550159 CARD14Q9BXL6 1004 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-218ENST00000550159 GGNBP2Q9H3C7 697 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-218ENST00000550159 MON2Q7Z3U7 1717 aa12.96□□□□□ -0.34
CS-218ENST00000550159 CRB1P82279 1406 aa12.96□□□□□ -0.34
CS-218ENST00000550159 CPDO75976 1380 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-218ENST00000550159 FYB1O15117 783 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-218ENST00000550159 NME9Q86XW9 330 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-218ENST00000550159 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
CS-218ENST00000550159 CD163L1Q9NR16 1453 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-218ENST00000550159 SOX12O15370 315 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-218ENST00000550159 AMPHP49418 695 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-218ENST00000550159 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-218ENST00000550159 USP31Q70CQ4 1352 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-218ENST00000550159 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
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