RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549308.5

PTPRR-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 1,603 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-209ENST00000549308 PDE3BQ13370 1112 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRR-209ENST00000549308 TCP11L2Q8N4U5 519 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRR-209ENST00000549308 NGEFQ8N5V2 710 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRR-209ENST00000549308 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRR-209ENST00000549308 NEFMP07197 916 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRR-209ENST00000549308 HMOX1P09601 288 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRR-209ENST00000549308 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
PTPRR-209ENST00000549308 IP6K1Q92551 441 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRR-209ENST00000549308 PLEKHF1Q96S99 279 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRR-209ENST00000549308 RSPH6AQ9H0K4 717 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRR-209ENST00000549308 PRKAR2BP31323 418 aa15.91■□□□□ 0.14
PTPRR-209ENST00000549308 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
PTPRR-209ENST00000549308 NEUROD2Q15784 382 aa15.9■□□□□ 0.14
PTPRR-209ENST00000549308 ARHGEF25Q86VW2 580 aa15.9■□□□□ 0.14
PTPRR-209ENST00000549308 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
PTPRR-209ENST00000549308 RGPD1P0DJD0 1748 aa15.9■□□□□ 0.14
PTPRR-209ENST00000549308 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa15.89■□□□□ 0.13
PTPRR-209ENST00000549308 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
PTPRR-209ENST00000549308 SULT6B1Q6IMI4 303 aa15.89■□□□□ 0.13
PTPRR-209ENST00000549308 CABLES1Q8TDN4 633 aa15.89■□□□□ 0.13
PTPRR-209ENST00000549308 TOM1O60784 492 aa15.88■□□□□ 0.13
PTPRR-209ENST00000549308 ZNF521Q96K83 1311 aa15.88■□□□□ 0.13
PTPRR-209ENST00000549308 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
PTPRR-209ENST00000549308 TMPOP42166 694 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
PTPRR-209ENST00000549308 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
PTPRR-209ENST00000549308 GOLGA2Q08379 1002 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRR-209ENST00000549308 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
PTPRR-209ENST00000549308 CDCA7LQ96GN5 454 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRR-209ENST00000549308 AEBP1Q8IUX7 1158 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRR-209ENST00000549308 EYA1Q99502 592 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRR-209ENST00000549308 IGSF1Q8N6C5 1336 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRR-209ENST00000549308 CCDC27Q2M243 656 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRR-209ENST00000549308 WWC1Q8IX03 1113 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRR-209ENST00000549308 RIPK4P57078 832 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRR-209ENST00000549308 PIP4K2BP78356 416 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRR-209ENST00000549308 PHACTR3Q96KR7 559 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRR-209ENST00000549308 UBAP1LF5GYI3 381 aa15.83■□□□□ 0.13
PTPRR-209ENST00000549308 NFE2L2Q16236 605 aa15.83■□□□□ 0.13
PTPRR-209ENST00000549308 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.13
PTPRR-209ENST00000549308 ABCA3Q99758 1704 aa15.83■□□□□ 0.13
PTPRR-209ENST00000549308 PHLPP1O60346 1717 aa15.83■□□□□ 0.12
PTPRR-209ENST00000549308 ANKRD24Q8TF21 1146 aa15.83■□□□□ 0.12
PTPRR-209ENST00000549308 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
PTPRR-209ENST00000549308 RGPD5Q99666 1765 aa15.82■□□□□ 0.12
PTPRR-209ENST00000549308 SLFN5Q08AF3 891 aa15.82■□□□□ 0.12
PTPRR-209ENST00000549308 WDR63Q8IWG1 891 aa15.82■□□□□ 0.12
PTPRR-209ENST00000549308 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa15.82■□□□□ 0.12
PTPRR-209ENST00000549308 CPDO75976 1380 aa15.82■□□□□ 0.12
PTPRR-209ENST00000549308 KIAA0232Q92628 1395 aa15.82■□□□□ 0.12
PTPRR-209ENST00000549308 ABCC6O95255 1503 aa15.82■□□□□ 0.12
PTPRR-209ENST00000549308 E9PSI1 815 aa15.81■□□□□ 0.12
PTPRR-209ENST00000549308 AXIN2Q9Y2T1 843 aa15.81■□□□□ 0.12
PTPRR-209ENST00000549308 KDRP35968 1356 aa15.81■□□□□ 0.12
PTPRR-209ENST00000549308 COL18A1P39060 1754 aa15.8■□□□□ 0.12
PTPRR-209ENST00000549308 CHRNA2Q15822 529 aa15.8■□□□□ 0.12
PTPRR-209ENST00000549308 USHBP1Q8N6Y0 703 aa15.8■□□□□ 0.12
PTPRR-209ENST00000549308 TRIM35Q9UPQ4 493 aa15.8■□□□□ 0.12
PTPRR-209ENST00000549308 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
PTPRR-209ENST00000549308 RGPD2P0DJD1 1756 aa15.8■□□□□ 0.12
PTPRR-209ENST00000549308 NBPF6Q5VWK0 638 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRR-209ENST00000549308 NBPF4Q96M43 638 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRR-209ENST00000549308 LMOD3Q0VAK6 560 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRR-209ENST00000549308 DUSP27Q5VZP5 1158 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRR-209ENST00000549308 CERKQ8TCT0 537 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRR-209ENST00000549308 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
PTPRR-209ENST00000549308 PRDM11Q9NQV5 511 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRR-209ENST00000549308 DLG5Q8TDM6 1919 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRR-209ENST00000549308 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
PTPRR-209ENST00000549308 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
PTPRR-209ENST00000549308 ERBB3P21860 1342 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRR-209ENST00000549308 NEFLP07196 543 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRR-209ENST00000549308 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRR-209ENST00000549308 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
PTPRR-209ENST00000549308 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRR-209ENST00000549308 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
PTPRR-209ENST00000549308 GAS2L2Q8NHY3 880 aa15.76■□□□□ 0.11
PTPRR-209ENST00000549308 IL16Q14005 1332 aa15.75■□□□□ 0.11
PTPRR-209ENST00000549308 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
PTPRR-209ENST00000549308 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
PTPRR-209ENST00000549308 MYH16Q9H6N6 1097 aa15.75■□□□□ 0.11
PTPRR-209ENST00000549308 NLRP2Q9NX02 1062 aa15.75■□□□□ 0.11
PTPRR-209ENST00000549308 NCAPD2Q15021 1401 aa15.74■□□□□ 0.11
PTPRR-209ENST00000549308 RCAN3Q9UKA8 241 aa15.74■□□□□ 0.11
PTPRR-209ENST00000549308 LMO7Q8WWI1 1683 aa15.73■□□□□ 0.11
PTPRR-209ENST00000549308 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
PTPRR-209ENST00000549308 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
PTPRR-209ENST00000549308 FAM83GA6ND36 823 aa15.71■□□□□ 0.11
PTPRR-209ENST00000549308 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
PTPRR-209ENST00000549308 DCTN1Q14203 1278 aa15.7■□□□□ 0.1
PTPRR-209ENST00000549308 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
PTPRR-209ENST00000549308 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
PTPRR-209ENST00000549308 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
PTPRR-209ENST00000549308 EVA1CP58658 441 aa15.69■□□□□ 0.1
PTPRR-209ENST00000549308 FKBP8Q14318 412 aa15.69■□□□□ 0.1
PTPRR-209ENST00000549308 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
PTPRR-209ENST00000549308 WDR17Q8IZU2 1322 aa15.69■□□□□ 0.1
PTPRR-209ENST00000549308 FANCIQ9NVI1 1328 aa15.69■□□□□ 0.1
PTPRR-209ENST00000549308 MAP3K5Q99683 1374 aa15.69■□□□□ 0.1
PTPRR-209ENST00000549308 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
PTPRR-209ENST00000549308 TATP17735 454 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14 ms