RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548122.2

PTPRB-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRB, Length 4,237 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-206ENST00000548122 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRB-206ENST00000548122 USHBP1Q8N6Y0 703 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRB-206ENST00000548122 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRB-206ENST00000548122 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRB-206ENST00000548122 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRB-206ENST00000548122 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRB-206ENST00000548122 TECPR2O15040 1411 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRB-206ENST00000548122 KIF7Q2M1P5 1343 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRB-206ENST00000548122 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PTPRB-206ENST00000548122 LAMC1P11047 1609 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRB-206ENST00000548122 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRB-206ENST00000548122 KAT6BQ8WYB5 2073 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRB-206ENST00000548122 APBA3O96018 575 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRB-206ENST00000548122 IL2RBP14784 551 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRB-206ENST00000548122 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PTPRB-206ENST00000548122 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PTPRB-206ENST00000548122 FAM182BQ5T319 152 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRB-206ENST00000548122 ACSBG1Q96GR2 724 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRB-206ENST00000548122 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa7.21□□□□□ -1.25
PTPRB-206ENST00000548122 FBLN1P23142 703 aa7.21□□□□□ -1.25
PTPRB-206ENST00000548122 TEFQ10587 303 aa7.21□□□□□ -1.25
PTPRB-206ENST00000548122 ERICH6BQ5W0A0 696 aa7.21□□□□□ -1.25
PTPRB-206ENST00000548122 POTEAQ6S8J7 498 aa7.21□□□□□ -1.25
PTPRB-206ENST00000548122 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
PTPRB-206ENST00000548122 A0A1W2PP64 1363 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRB-206ENST00000548122 TULP4Q9NRJ4 1543 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRB-206ENST00000548122 MRS2Q9HD23 443 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRB-206ENST00000548122 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRB-206ENST00000548122 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
PTPRB-206ENST00000548122 HMOX1P09601 288 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRB-206ENST00000548122 TESK2Q96S53 571 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRB-206ENST00000548122 MTHFSP49914 203 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-206ENST00000548122 PPLO60437 1756 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-206ENST00000548122 FYB1O15117 783 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-206ENST00000548122 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-206ENST00000548122 FAM196AQ6ZSG2 479 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-206ENST00000548122 TTC5Q8N0Z6 440 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-206ENST00000548122 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-206ENST00000548122 DLC1Q96QB1 1528 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-206ENST00000548122 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-206ENST00000548122 VPS72Q15906 364 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-206ENST00000548122 FAM9BQ8IZU0 186 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-206ENST00000548122 USP6P35125 1406 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-206ENST00000548122 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-206ENST00000548122 TRIM37O94972 964 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRB-206ENST00000548122 SULT6B1Q6IMI4 303 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRB-206ENST00000548122 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PTPRB-206ENST00000548122 IP6K1Q92551 441 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRB-206ENST00000548122 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRB-206ENST00000548122 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PTPRB-206ENST00000548122 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRB-206ENST00000548122 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRB-206ENST00000548122 PHLPP1O60346 1717 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRB-206ENST00000548122 MAP3K19Q56UN5 1328 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRB-206ENST00000548122 CCDC7Q96M83 1385 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRB-206ENST00000548122 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PTPRB-206ENST00000548122 CABP4P57796 275 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRB-206ENST00000548122 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRB-206ENST00000548122 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PTPRB-206ENST00000548122 PDE4CQ08493 712 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRB-206ENST00000548122 ARHGEF25Q86VW2 580 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRB-206ENST00000548122 TMOD3Q9NYL9 352 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRB-206ENST00000548122 HOXC9P31274 260 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRB-206ENST00000548122 RALBP1Q15311 655 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRB-206ENST00000548122 AEBP1Q8IUX7 1158 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRB-206ENST00000548122 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRB-206ENST00000548122 NRXN1Q9ULB1 1477 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRB-206ENST00000548122 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRB-206ENST00000548122 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRB-206ENST00000548122 NWD1Q149M9 1564 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRB-206ENST00000548122 STK32BQ9NY57 414 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRB-206ENST00000548122 WDR17Q8IZU2 1322 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRB-206ENST00000548122 FLT4P35916 1363 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRB-206ENST00000548122 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRB-206ENST00000548122 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRB-206ENST00000548122 SOCS7O14512 581 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRB-206ENST00000548122 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRB-206ENST00000548122 CARD10Q9BWT7 1032 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRB-206ENST00000548122 ATP7BP35670 1465 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRB-206ENST00000548122 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PTPRB-206ENST00000548122 WASHC2AQ641Q2 1341 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRB-206ENST00000548122 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PTPRB-206ENST00000548122 IFNL2Q8IZJ0 200 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRB-206ENST00000548122 GAS2L2Q8NHY3 880 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRB-206ENST00000548122 AMOTQ4VCS5 1084 aa7.15□□□□□ -1.27
PTPRB-206ENST00000548122 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PTPRB-206ENST00000548122 ADGRB1O14514 1584 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRB-206ENST00000548122 NSD2O96028 1365 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRB-206ENST00000548122 NPM3O75607 178 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PTPRB-206ENST00000548122 LMOD3Q0VAK6 560 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRB-206ENST00000548122 ILDR2Q71H61 639 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRB-206ENST00000548122 AK7Q96M32 723 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRB-206ENST00000548122 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRB-206ENST00000548122 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PTPRB-206ENST00000548122 CARD14Q9BXL6 1004 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRB-206ENST00000548122 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRB-206ENST00000548122 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRB-206ENST00000548122 PRKAR2BP31323 418 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRB-206ENST00000548122 FGD1P98174 961 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRB-206ENST00000548122 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
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