RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544253.1

ANKRD49-208, Transcript of ankyrin repeat domain 49, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD49, Length 3,002 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD49-208ENST00000544253 WDR17Q8IZU2 1322 aa8.24□□□□□ -1.09
ANKRD49-208ENST00000544253 TCP11L2Q8N4U5 519 aa8.24□□□□□ -1.09
ANKRD49-208ENST00000544253 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
ANKRD49-208ENST00000544253 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa8.23□□□□□ -1.09
ANKRD49-208ENST00000544253 GCP02774 474 aa8.23□□□□□ -1.09
ANKRD49-208ENST00000544253 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
ANKRD49-208ENST00000544253 ARHGEF25Q86VW2 580 aa8.22□□□□□ -1.09
ANKRD49-208ENST00000544253 CABLES1Q8TDN4 633 aa8.22□□□□□ -1.09
ANKRD49-208ENST00000544253 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP8.21□□□□□ -1.09
ANKRD49-208ENST00000544253 CARD10Q9BWT7 1032 aa8.21□□□□□ -1.09
ANKRD49-208ENST00000544253 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.09
ANKRD49-208ENST00000544253 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa8.21□□□□□ -1.09
ANKRD49-208ENST00000544253 ABTB2Q8N961 1025 aa8.21□□□□□ -1.1
ANKRD49-208ENST00000544253 CAMKK2Q96RR4 588 aa8.21□□□□□ -1.1
ANKRD49-208ENST00000544253 BTAF1O14981 1849 aa8.21□□□□□ -1.1
ANKRD49-208ENST00000544253 PLSCR1O15162 318 aa8.21□□□□□ -1.1
ANKRD49-208ENST00000544253 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
ANKRD49-208ENST00000544253 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
ANKRD49-208ENST00000544253 TONSLQ96HA7 1378 aa8.2□□□□□ -1.1
ANKRD49-208ENST00000544253 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
ANKRD49-208ENST00000544253 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
ANKRD49-208ENST00000544253 LMOD2Q6P5Q4 547 aa8.19□□□□□ -1.1
ANKRD49-208ENST00000544253 NSD2O96028 1365 aa8.19□□□□□ -1.1
ANKRD49-208ENST00000544253 CABP1Q9NZU7 370 aa8.19□□□□□ -1.1
ANKRD49-208ENST00000544253 MAP3K5Q99683 1374 aa8.19□□□□□ -1.1
ANKRD49-208ENST00000544253 CABP2Q9NPB3 220 aa8.19□□□□□ -1.1
ANKRD49-208ENST00000544253 TESK2Q96S53 571 aa8.18□□□□□ -1.1
ANKRD49-208ENST00000544253 A0A1W2PP64 1363 aa8.18□□□□□ -1.1
ANKRD49-208ENST00000544253 DOT1LQ8TEK3 1739 aa8.18□□□□□ -1.1
ANKRD49-208ENST00000544253 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
ANKRD49-208ENST00000544253 TERF2IPQ9NYB0 399 aa8.18□□□□□ -1.1
ANKRD49-208ENST00000544253 CGNL1Q0VF96 1302 aa8.17□□□□□ -1.1
ANKRD49-208ENST00000544253 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
ANKRD49-208ENST00000544253 DEFB132Q7Z7B7 95 aa8.17□□□□□ -1.1
ANKRD49-208ENST00000544253 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
ANKRD49-208ENST00000544253 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa8.17□□□□□ -1.1
ANKRD49-208ENST00000544253 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
ANKRD49-208ENST00000544253 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
ANKRD49-208ENST00000544253 EP400Q96L91 3159 aa8.16□□□□□ -1.1
ANKRD49-208ENST00000544253 ERBB3P21860 1342 aa8.16□□□□□ -1.1
ANKRD49-208ENST00000544253 CDCA8Q53HL2 280 aa8.16□□□□□ -1.1
ANKRD49-208ENST00000544253 NLRP6P59044 892 aa8.15□□□□□ -1.1
ANKRD49-208ENST00000544253 C5P01031 1676 aa8.15□□□□□ -1.1
ANKRD49-208ENST00000544253 TAF1LQ8IZX4 1826 aa8.15□□□□□ -1.11
ANKRD49-208ENST00000544253 EVA1CP58658 441 aa8.15□□□□□ -1.11
ANKRD49-208ENST00000544253 CARD11Q9BXL7 1154 aa8.15□□□□□ -1.11
ANKRD49-208ENST00000544253 RGPD2P0DJD1 1756 aa8.14□□□□□ -1.11
ANKRD49-208ENST00000544253 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
ANKRD49-208ENST00000544253 PDE3BQ13370 1112 aa8.14□□□□□ -1.11
ANKRD49-208ENST00000544253 NBPF14Q5TI25 921 aa8.14□□□□□ -1.11
ANKRD49-208ENST00000544253 A0A0G2JS52 829 aa8.13□□□□□ -1.11
ANKRD49-208ENST00000544253 MYT1Q01538 1121 aa8.13□□□□□ -1.11
ANKRD49-208ENST00000544253 SIN3AQ96ST3 1273 aa8.13□□□□□ -1.11
ANKRD49-208ENST00000544253 USP47Q96K76 1375 aa8.13□□□□□ -1.11
ANKRD49-208ENST00000544253 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
ANKRD49-208ENST00000544253 CHRNA2Q15822 529 aa8.13□□□□□ -1.11
ANKRD49-208ENST00000544253 IP6K1Q92551 441 aa8.13□□□□□ -1.11
ANKRD49-208ENST00000544253 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa8.13□□□□□ -1.11
ANKRD49-208ENST00000544253 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
ANKRD49-208ENST00000544253 DDB1Q16531 1140 aa8.12□□□□□ -1.11
ANKRD49-208ENST00000544253 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa8.12□□□□□ -1.11
ANKRD49-208ENST00000544253 INSRP06213 1382 aa8.12□□□□□ -1.11
ANKRD49-208ENST00000544253 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
ANKRD49-208ENST00000544253 STRN4Q9NRL3 753 aa8.11□□□□□ -1.11
ANKRD49-208ENST00000544253 ITGB4P16144 1822 aa8.11□□□□□ -1.11
ANKRD49-208ENST00000544253 APBA3O96018 575 aa8.11□□□□□ -1.11
ANKRD49-208ENST00000544253 AXIN2Q9Y2T1 843 aa8.11□□□□□ -1.11
ANKRD49-208ENST00000544253 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
ANKRD49-208ENST00000544253 TRIM37O94972 964 aa8.1□□□□□ -1.11
ANKRD49-208ENST00000544253 TMF1P82094 1093 aa8.1□□□□□ -1.11
ANKRD49-208ENST00000544253 FLT4P35916 1363 aa8.1□□□□□ -1.11
ANKRD49-208ENST00000544253 KIF13BQ9NQT8 1826 aa8.1□□□□□ -1.11
ANKRD49-208ENST00000544253 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
ANKRD49-208ENST00000544253 SLC27A3Q5K4L6 730 aa8.1□□□□□ -1.11
ANKRD49-208ENST00000544253 IL2RBP14784 551 aa8.09□□□□□ -1.11
ANKRD49-208ENST00000544253 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa8.09□□□□□ -1.11
ANKRD49-208ENST00000544253 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
ANKRD49-208ENST00000544253 NSD3Q9BZ95 1437 aa8.09□□□□□ -1.11
ANKRD49-208ENST00000544253 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
ANKRD49-208ENST00000544253 MEGF6O75095 1541 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD49-208ENST00000544253 UBR3Q6ZT12 1888 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD49-208ENST00000544253 CHD4Q14839 1912 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD49-208ENST00000544253 EXOC5O00471 708 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD49-208ENST00000544253 KCNQ2O43526 872 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD49-208ENST00000544253 SPON1Q9HCB6 807 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD49-208ENST00000544253 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP8.07□□□□□ -1.12
ANKRD49-208ENST00000544253 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
ANKRD49-208ENST00000544253 HOXC9P31274 260 aa8.07□□□□□ -1.12
ANKRD49-208ENST00000544253 NUTM2GQ5VZR2 741 aa8.07□□□□□ -1.12
ANKRD49-208ENST00000544253 NME9Q86XW9 330 aa8.07□□□□□ -1.12
ANKRD49-208ENST00000544253 ANKRD24Q8TF21 1146 aa8.07□□□□□ -1.12
ANKRD49-208ENST00000544253 SLC16A10Q8TF71 515 aa8.07□□□□□ -1.12
ANKRD49-208ENST00000544253 COG3Q96JB2 828 aa8.07□□□□□ -1.12
ANKRD49-208ENST00000544253 MAP3K19Q56UN5 1328 aa8.06□□□□□ -1.12
ANKRD49-208ENST00000544253 C4BP0C0L5 1744 aa8.06□□□□□ -1.12
ANKRD49-208ENST00000544253 MRC1P22897 1456 aa8.06□□□□□ -1.12
ANKRD49-208ENST00000544253 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa8.05□□□□□ -1.12
ANKRD49-208ENST00000544253 NEUROD1Q13562 356 aa8.05□□□□□ -1.12
ANKRD49-208ENST00000544253 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
ANKRD49-208ENST00000544253 SGIP1Q9BQI5 828 aa8.05□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54 ms