RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543442.1

GGTA2P-201, Transcript of glycoprotein, alpha-galactosyltransferase 2, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene GGTA2P, Length 1,125 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTA2P-201ENST00000543442 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa15.7■□□□□ 0.1
GGTA2P-201ENST00000543442 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa15.69■□□□□ 0.1
GGTA2P-201ENST00000543442 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa15.69■□□□□ 0.1
GGTA2P-201ENST00000543442 OVOS2Q6IE36 1432 aa15.69■□□□□ 0.1
GGTA2P-201ENST00000543442 NUP188Q5SRE5 1749 aa15.69■□□□□ 0.1
GGTA2P-201ENST00000543442 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
GGTA2P-201ENST00000543442 APBA3O96018 575 aa15.69■□□□□ 0.1
GGTA2P-201ENST00000543442 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
GGTA2P-201ENST00000543442 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa15.69■□□□□ 0.1
GGTA2P-201ENST00000543442 SBF2Q86WG5 1849 aa15.68■□□□□ 0.1
GGTA2P-201ENST00000543442 SOX12O15370 315 aa15.68■□□□□ 0.1
GGTA2P-201ENST00000543442 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
GGTA2P-201ENST00000543442 NFAT5O94916 1531 aa15.68■□□□□ 0.1
GGTA2P-201ENST00000543442 WDR17Q8IZU2 1322 aa15.68■□□□□ 0.1
GGTA2P-201ENST00000543442 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa15.67■□□□□ 0.1
GGTA2P-201ENST00000543442 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
GGTA2P-201ENST00000543442 TMC1Q8TDI8 760 aa15.67■□□□□ 0.1
GGTA2P-201ENST00000543442 PEAK1Q9H792 1746 aa15.66■□□□□ 0.1
GGTA2P-201ENST00000543442 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
GGTA2P-201ENST00000543442 DDB1Q16531 1140 aa15.65■□□□□ 0.1
GGTA2P-201ENST00000543442 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP15.65■□□□□ 0.1
GGTA2P-201ENST00000543442 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
GGTA2P-201ENST00000543442 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
GGTA2P-201ENST00000543442 ARHGEF25Q86VW2 580 aa15.64■□□□□ 0.09
GGTA2P-201ENST00000543442 CAMKK2Q96RR4 588 aa15.64■□□□□ 0.09
GGTA2P-201ENST00000543442 TERF2IPQ9NYB0 399 aa15.64■□□□□ 0.09
GGTA2P-201ENST00000543442 SLC24A1O60721 1099 aa15.63■□□□□ 0.09
GGTA2P-201ENST00000543442 NBPF14Q5TI25 921 aa15.63■□□□□ 0.09
GGTA2P-201ENST00000543442 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
GGTA2P-201ENST00000543442 CCDC7Q96M83 1385 aa15.62■□□□□ 0.09
GGTA2P-201ENST00000543442 NINLQ9Y2I6 1382 aa15.62■□□□□ 0.09
GGTA2P-201ENST00000543442 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
GGTA2P-201ENST00000543442 CD163L1Q9NR16 1453 aa15.62■□□□□ 0.09
GGTA2P-201ENST00000543442 USP31Q70CQ4 1352 aa15.62■□□□□ 0.09
GGTA2P-201ENST00000543442 CARD10Q9BWT7 1032 aa15.61■□□□□ 0.09
GGTA2P-201ENST00000543442 AXIN2Q9Y2T1 843 aa15.61■□□□□ 0.09
GGTA2P-201ENST00000543442 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
GGTA2P-201ENST00000543442 A0A1W2PP64 1363 aa15.6■□□□□ 0.09
GGTA2P-201ENST00000543442 TNS2Q63HR2 1409 aa15.59■□□□□ 0.09
GGTA2P-201ENST00000543442 NME9Q86XW9 330 aa15.58■□□□□ 0.08
GGTA2P-201ENST00000543442 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa15.58■□□□□ 0.08
GGTA2P-201ENST00000543442 NHSQ6T4R5 1651 aa15.57■□□□□ 0.08
GGTA2P-201ENST00000543442 EXOC5O00471 708 aa15.56■□□□□ 0.08
GGTA2P-201ENST00000543442 ERBB3P21860 1342 aa15.56■□□□□ 0.08
GGTA2P-201ENST00000543442 BCL9O00512 1426 aa15.56■□□□□ 0.08
GGTA2P-201ENST00000543442 KIF20BQ96Q89 1820 aa15.55■□□□□ 0.08
GGTA2P-201ENST00000543442 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa15.55■□□□□ 0.08
GGTA2P-201ENST00000543442 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
GGTA2P-201ENST00000543442 NLRP2Q9NX02 1062 aa15.55■□□□□ 0.08
GGTA2P-201ENST00000543442 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa15.55■□□□□ 0.08
GGTA2P-201ENST00000543442 KAT6BQ8WYB5 2073 aa15.54■□□□□ 0.08
GGTA2P-201ENST00000543442 USP47Q96K76 1375 aa15.53■□□□□ 0.08
GGTA2P-201ENST00000543442 PLSCR1O15162 318 aa15.53■□□□□ 0.08
GGTA2P-201ENST00000543442 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
GGTA2P-201ENST00000543442 ANKRD24Q8TF21 1146 aa15.53■□□□□ 0.08
GGTA2P-201ENST00000543442 COG3Q96JB2 828 aa15.53■□□□□ 0.08
GGTA2P-201ENST00000543442 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa15.52■□□□□ 0.08
GGTA2P-201ENST00000543442 IL2RBP14784 551 aa15.52■□□□□ 0.08
GGTA2P-201ENST00000543442 TMF1P82094 1093 aa15.52■□□□□ 0.08
GGTA2P-201ENST00000543442 TESK2Q96S53 571 aa15.52■□□□□ 0.08
GGTA2P-201ENST00000543442 BTAF1O14981 1849 aa15.5■□□□□ 0.07
GGTA2P-201ENST00000543442 CDCA8Q53HL2 280 aa15.5■□□□□ 0.07
GGTA2P-201ENST00000543442 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
GGTA2P-201ENST00000543442 CASZ1Q86V15 1759 aa15.49■□□□□ 0.07
GGTA2P-201ENST00000543442 SPON1Q9HCB6 807 aa15.49■□□□□ 0.07
GGTA2P-201ENST00000543442 AMPHP49418 695 aa15.48■□□□□ 0.07
GGTA2P-201ENST00000543442 RGPD2P0DJD1 1756 aa15.48■□□□□ 0.07
GGTA2P-201ENST00000543442 MSH5O43196 834 aa15.47■□□□□ 0.07
GGTA2P-201ENST00000543442 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
GGTA2P-201ENST00000543442 IP6K1Q92551 441 aa15.47■□□□□ 0.07
GGTA2P-201ENST00000543442 MYOM1P52179 1685 aa15.47■□□□□ 0.07
GGTA2P-201ENST00000543442 RTL1A6NKG5 1358 aa15.47■□□□□ 0.07
GGTA2P-201ENST00000543442 KCNQ2O43526 872 aa15.46■□□□□ 0.07
GGTA2P-201ENST00000543442 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
GGTA2P-201ENST00000543442 STK32BQ9NY57 414 aa15.46■□□□□ 0.07
GGTA2P-201ENST00000543442 DOT1LQ8TEK3 1739 aa15.46■□□□□ 0.06
GGTA2P-201ENST00000543442 ACSBG1Q96GR2 724 aa15.45■□□□□ 0.06
GGTA2P-201ENST00000543442 MAP3K19Q56UN5 1328 aa15.44■□□□□ 0.06
GGTA2P-201ENST00000543442 DCAF8L1A6NGE4 600 aa15.44■□□□□ 0.06
GGTA2P-201ENST00000543442 TXNRD1Q16881 649 aa15.44■□□□□ 0.06
GGTA2P-201ENST00000543442 PTF1AQ7RTS3 328 aa15.44■□□□□ 0.06
GGTA2P-201ENST00000543442 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
GGTA2P-201ENST00000543442 CLSPNQ9HAW4 1339 aa15.43■□□□□ 0.06
GGTA2P-201ENST00000543442 HOXC9P31274 260 aa15.43■□□□□ 0.06
GGTA2P-201ENST00000543442 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa15.43■□□□□ 0.06
GGTA2P-201ENST00000543442 SHANK3Q9BYB0 1731 aa15.43■□□□□ 0.06
GGTA2P-201ENST00000543442 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
GGTA2P-201ENST00000543442 PAPPAQ13219 1627 aa15.41■□□□□ 0.06
GGTA2P-201ENST00000543442 SLC15A2Q16348 729 aa15.4■□□□□ 0.06
GGTA2P-201ENST00000543442 GGNBP2Q9H3C7 697 aa15.4■□□□□ 0.06
GGTA2P-201ENST00000543442 QSER1Q2KHR3 1735 aa15.4■□□□□ 0.06
GGTA2P-201ENST00000543442 PROM2Q8N271 834 aa15.39■□□□□ 0.05
GGTA2P-201ENST00000543442 PCGF6Q9BYE7 350 aa15.39■□□□□ 0.05
GGTA2P-201ENST00000543442 KIF24Q5T7B8 1368 aa15.38■□□□□ 0.05
GGTA2P-201ENST00000543442 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa15.38■□□□□ 0.05
GGTA2P-201ENST00000543442 NSD3Q9BZ95 1437 aa15.38■□□□□ 0.05
GGTA2P-201ENST00000543442 FYB1O15117 783 aa15.38■□□□□ 0.05
GGTA2P-201ENST00000543442 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
GGTA2P-201ENST00000543442 MEGF6O75095 1541 aa15.38■□□□□ 0.05
GGTA2P-201ENST00000543442 FLT4P35916 1363 aa15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.2 ms