RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CRB1P82279 1406 aa15.25■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ATP10DQ9P241 1426 aa15.24■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CPDO75976 1380 aa15.23■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LRRC37A3O60309 1634 aa15.22■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GCP02774 474 aa15.22■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP15.22■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 POLD1P28340 1107 aa15.22■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LMO7Q8WWI1 1683 aa15.22■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ACEP12821 1306 aa15.21■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF827Q17R98 1081 aa15.21■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ACSBG1Q96GR2 724 aa15.21■□□□□ 0.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GRIN3BO60391 1043 aa15.2■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NLRP13Q86W25 1043 aa15.19■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 USP19O94966 1318 aa15.17■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MPHOSPH9Q99550 1183 aa15.17■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CDK19Q9BWU1 502 aa15.17■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EXOC5O00471 708 aa15.16■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa15.15■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AXIN2Q9Y2T1 843 aa15.15■□□□□ 0.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AATKQ6ZMQ8 1374 aa15.14■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LRRC4BQ9NT99 713 aa15.14■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa15.14■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BCL9O00512 1426 aa15.14■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ADGRB1O14514 1584 aa15.13■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCDC61Q9Y6R9 512 aa15.13■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 WDR17Q8IZU2 1322 aa15.13■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ITSN1Q15811 1721 aa15.12■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AKAP12Q02952 1782 aa15.12■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NLRP6P59044 892 aa15.12■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC16A10Q8TF71 515 aa15.12■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SOX12O15370 315 aa15.11■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KCNQ4P56696 695 aa15.11■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa15.11■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa15.11■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa15.11■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PLEKHG3A1L390 1219 aa15.1■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MSH5O43196 834 aa15.1■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 APLP1P51693 650 aa15.1■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AKT1S1Q96B36 256 aa15.1■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 WWC3Q9ULE0 1092 aa15.1■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa15.09■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PAPPAQ13219 1627 aa15.09■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TNS4Q8IZW8 715 aa15.08■□□□□ 0
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CARD10Q9BWT7 1032 aa15.08■□□□□ 0
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ADCY9O60503 1353 aa15.05■□□□□ -0
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NHSQ6T4R5 1651 aa15.04■□□□□ -0
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRELPP51888 382 aa15.04■□□□□ -0
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HTRA3P83110 453 aa15.04■□□□□ -0
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TNS2Q63HR2 1409 aa15.03■□□□□ -0
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KAT6BQ8WYB5 2073 aa15.02■□□□□ -0
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa15.02■□□□□ -0
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CABP2Q9NPB3 220 aa15.02■□□□□ -0
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC27A3Q5K4L6 730 aa15.01□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ARHGEF25Q86VW2 580 aa15.01□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BTAF1O14981 1849 aa15.01□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 COL18A1P39060 1754 aa15.01□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NLRP2Q9NX02 1062 aa15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CABP1Q9NZU7 370 aa15□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCDC7Q96M83 1385 aa14.99□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLIT3O75094 1523 aa14.99□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TOMM70O94826 608 aa14.98□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RGPD5Q99666 1765 aa14.98□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IL2RBP14784 551 aa14.97□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CD2APQ9Y5K6 639 aa14.97□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 COL24A1Q17RW2 1714 aa14.97□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KLRG1Q96E93 195 aa14.96□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa14.95□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KCNH5Q8NCM2 988 aa14.95□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGSF1Q8N6C5 1336 aa14.94□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ABCC6O95255 1503 aa14.94□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 QSER1Q2KHR3 1735 aa14.94□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NMRK2Q9NPI5 230 aa14.93□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa14.92□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 JMYQ8N9B5 988 aa14.92□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PIK3C2AO00443 1686 aa14.91□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC34A2O95436 690 aa14.91□□□□□ -0.02
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ERBB3P21860 1342 aa14.89□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa14.89□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 WDR90Q96KV7 1748 aa14.89□□□□□ -0.03
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