RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532308.5

TSTA3-215, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 5

Gene TSTA3, Length 951 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-215ENST00000532308 HOXC9P31274 260 aa27.43■■□□□ 1.98
TSTA3-215ENST00000532308 PRDM11Q9NQV5 511 aa27.43■■□□□ 1.98
TSTA3-215ENST00000532308 ABCC6O95255 1503 aa27.42■■□□□ 1.98
TSTA3-215ENST00000532308 CCDC184Q52MB2 194 aa27.41■■□□□ 1.98
TSTA3-215ENST00000532308 COL18A1P39060 1754 aa27.4■■□□□ 1.98
TSTA3-215ENST00000532308 CHRNA2Q15822 529 aa27.39■■□□□ 1.98
TSTA3-215ENST00000532308 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa27.39■■□□□ 1.98
TSTA3-215ENST00000532308 RGPD5Q99666 1765 aa27.39■■□□□ 1.98
TSTA3-215ENST00000532308 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.97
TSTA3-215ENST00000532308 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
TSTA3-215ENST00000532308 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
TSTA3-215ENST00000532308 ADAMTS2O95450 1211 aa27.38■■□□□ 1.97
TSTA3-215ENST00000532308 FAM83GA6ND36 823 aa27.37■■□□□ 1.97
TSTA3-215ENST00000532308 NUDCQ9Y266 331 aa27.37■■□□□ 1.97
TSTA3-215ENST00000532308 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
TSTA3-215ENST00000532308 LMO7Q8WWI1 1683 aa27.34■■□□□ 1.97
TSTA3-215ENST00000532308 AXIN2Q9Y2T1 843 aa27.34■■□□□ 1.97
TSTA3-215ENST00000532308 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
TSTA3-215ENST00000532308 IL13P35225 146 aa27.32■■□□□ 1.96
TSTA3-215ENST00000532308 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP27.31■■□□□ 1.96
TSTA3-215ENST00000532308 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
TSTA3-215ENST00000532308 LRP6O75581 1613 aa27.3■■□□□ 1.96
TSTA3-215ENST00000532308 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
TSTA3-215ENST00000532308 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
TSTA3-215ENST00000532308 ANKRD24Q8TF21 1146 aa27.3■■□□□ 1.96
TSTA3-215ENST00000532308 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa27.3■■□□□ 1.96
TSTA3-215ENST00000532308 PLCH1Q4KWH8 1693 aa27.29■■□□□ 1.96
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TSTA3-215ENST00000532308 BTG4Q9NY30 223 aa27.28■■□□□ 1.96
TSTA3-215ENST00000532308 NWD2Q9ULI1 1742 aa27.27■■□□□ 1.96
TSTA3-215ENST00000532308 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
TSTA3-215ENST00000532308 ERBB3P21860 1342 aa27.27■■□□□ 1.96
TSTA3-215ENST00000532308 EVA1CP58658 441 aa27.27■■□□□ 1.96
TSTA3-215ENST00000532308 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa27.26■■□□□ 1.95
TSTA3-215ENST00000532308 NGLY1Q96IV0 654 aa27.26■■□□□ 1.95
TSTA3-215ENST00000532308 C8orf37Q96NL8 207 aa27.26■■□□□ 1.95
TSTA3-215ENST00000532308 FAM9BQ8IZU0 186 aa27.25■■□□□ 1.95
TSTA3-215ENST00000532308 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
TSTA3-215ENST00000532308 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
TSTA3-215ENST00000532308 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP27.24■■□□□ 1.95
TSTA3-215ENST00000532308 RGPD2P0DJD1 1756 aa27.23■■□□□ 1.95
TSTA3-215ENST00000532308 SLIT2O94813 1529 aa27.23■■□□□ 1.95
TSTA3-215ENST00000532308 RGPD1P0DJD0 1748 aa27.23■■□□□ 1.95
TSTA3-215ENST00000532308 WDR17Q8IZU2 1322 aa27.22■■□□□ 1.95
TSTA3-215ENST00000532308 EYA1Q99502 592 aa27.22■■□□□ 1.95
TSTA3-215ENST00000532308 STRN4Q9NRL3 753 aa27.22■■□□□ 1.95
TSTA3-215ENST00000532308 ADAMTS8Q9UP79 889 aa27.21■■□□□ 1.95
TSTA3-215ENST00000532308 IGSF1Q8N6C5 1336 aa27.2■■□□□ 1.95
TSTA3-215ENST00000532308 NRAPQ86VF7 1730 aa27.2■■□□□ 1.94
TSTA3-215ENST00000532308 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
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TSTA3-215ENST00000532308 NBPF6Q5VWK0 638 aa27.19■■□□□ 1.94
TSTA3-215ENST00000532308 NBPF4Q96M43 638 aa27.19■■□□□ 1.94
TSTA3-215ENST00000532308 NLRP2Q9NX02 1062 aa27.19■■□□□ 1.94
TSTA3-215ENST00000532308 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa27.18■■□□□ 1.94
TSTA3-215ENST00000532308 FCHSD2O94868 740 aa27.17■■□□□ 1.94
TSTA3-215ENST00000532308 UNC5CLQ8IV45 518 aa27.17■■□□□ 1.94
TSTA3-215ENST00000532308 SULT6B1Q6IMI4 303 aa27.16■■□□□ 1.94
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TSTA3-215ENST00000532308 CARD10Q9BWT7 1032 aa27.15■■□□□ 1.94
TSTA3-215ENST00000532308 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
TSTA3-215ENST00000532308 USP21Q9UK80 565 aa27.14■■□□□ 1.94
TSTA3-215ENST00000532308 AFF2P51816 1311 aa27.14■■□□□ 1.93
TSTA3-215ENST00000532308 USHBP1Q8N6Y0 703 aa27.13■■□□□ 1.93
TSTA3-215ENST00000532308 NCAPD2Q15021 1401 aa27.13■■□□□ 1.93
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TSTA3-215ENST00000532308 KDRP35968 1356 aa27.12■■□□□ 1.93
TSTA3-215ENST00000532308 NEFMP07197 916 aa27.12■■□□□ 1.93
TSTA3-215ENST00000532308 RSPH6AQ9H0K4 717 aa27.12■■□□□ 1.93
TSTA3-215ENST00000532308 AEBP1Q8IUX7 1158 aa27.1■■□□□ 1.93
TSTA3-215ENST00000532308 PRKAR2BP31323 418 aa27.09■■□□□ 1.93
TSTA3-215ENST00000532308 RUNDC1Q96C34 613 aa27.09■■□□□ 1.93
TSTA3-215ENST00000532308 VPS72Q15906 364 aa27.08■■□□□ 1.93
TSTA3-215ENST00000532308 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
TSTA3-215ENST00000532308 PLEKHF1Q96S99 279 aa27.07■■□□□ 1.92
TSTA3-215ENST00000532308 CCDC146Q8IYE0 955 aa27.06■■□□□ 1.92
TSTA3-215ENST00000532308 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa27.06■■□□□ 1.92
TSTA3-215ENST00000532308 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
TSTA3-215ENST00000532308 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa27.06■■□□□ 1.92
TSTA3-215ENST00000532308 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa27.06■■□□□ 1.92
TSTA3-215ENST00000532308 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa27.06■■□□□ 1.92
TSTA3-215ENST00000532308 USP35Q9P2H5 1018 aa27.05■■□□□ 1.92
TSTA3-215ENST00000532308 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa27.05■■□□□ 1.92
TSTA3-215ENST00000532308 TATP17735 454 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
TSTA3-215ENST00000532308 TCP11L2Q8N4U5 519 aa27.04■■□□□ 1.92
TSTA3-215ENST00000532308 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
TSTA3-215ENST00000532308 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
TSTA3-215ENST00000532308 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa27.02■■□□□ 1.92
TSTA3-215ENST00000532308 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
TSTA3-215ENST00000532308 ATRNO75882 1429 aa27.01■■□□□ 1.91
TSTA3-215ENST00000532308 IL2RBP14784 551 aa27.01■■□□□ 1.91
TSTA3-215ENST00000532308 WNK3Q9BYP7 1800 aa27■■□□□ 1.91
TSTA3-215ENST00000532308 AMOTQ4VCS5 1084 aa26.99■■□□□ 1.91
TSTA3-215ENST00000532308 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
TSTA3-215ENST00000532308 PHACTR3Q96KR7 559 aa26.99■■□□□ 1.91
TSTA3-215ENST00000532308 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
TSTA3-215ENST00000532308 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
TSTA3-215ENST00000532308 BARGINQ6ZT62 677 aa26.98■■□□□ 1.91
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