RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531995.1

PUF60-218, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 3

Gene PUF60, Length 631 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-218ENST00000531995 SBF2Q86WG5 1849 aa26.11■■□□□ 1.77
PUF60-218ENST00000531995 AATKQ6ZMQ8 1374 aa26.11■■□□□ 1.77
PUF60-218ENST00000531995 APBA3O96018 575 aa26.11■■□□□ 1.77
PUF60-218ENST00000531995 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
PUF60-218ENST00000531995 SOX12O15370 315 aa26.1■■□□□ 1.77
PUF60-218ENST00000531995 CAMKK2Q96RR4 588 aa26.1■■□□□ 1.77
PUF60-218ENST00000531995 NFAT5O94916 1531 aa26.09■■□□□ 1.77
PUF60-218ENST00000531995 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
PUF60-218ENST00000531995 PARD3Q8TEW0 1356 aa26.08■■□□□ 1.77
PUF60-218ENST00000531995 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.08■■□□□ 1.77
PUF60-218ENST00000531995 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa26.08■■□□□ 1.77
PUF60-218ENST00000531995 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa26.07■■□□□ 1.76
PUF60-218ENST00000531995 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa26.07■■□□□ 1.76
PUF60-218ENST00000531995 OVOS2Q6IE36 1432 aa26.07■■□□□ 1.76
PUF60-218ENST00000531995 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
PUF60-218ENST00000531995 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa26.05■■□□□ 1.76
PUF60-218ENST00000531995 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa26.05■■□□□ 1.76
PUF60-218ENST00000531995 USP54Q70EL1 1684 aa26.05■■□□□ 1.76
PUF60-218ENST00000531995 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
PUF60-218ENST00000531995 LTN1O94822 1766 aa26.05■■□□□ 1.76
PUF60-218ENST00000531995 AXIN2Q9Y2T1 843 aa26.03■■□□□ 1.76
PUF60-218ENST00000531995 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
PUF60-218ENST00000531995 WDR17Q8IZU2 1322 aa26.02■■□□□ 1.76
PUF60-218ENST00000531995 SLC24A1O60721 1099 aa26.01■■□□□ 1.75
PUF60-218ENST00000531995 TTC21AQ8NDW8 1320 aa26.01■■□□□ 1.75
PUF60-218ENST00000531995 CD163L1Q9NR16 1453 aa26■■□□□ 1.75
PUF60-218ENST00000531995 ABCC6O95255 1503 aa25.99■■□□□ 1.75
PUF60-218ENST00000531995 TMF1P82094 1093 aa25.99■■□□□ 1.75
PUF60-218ENST00000531995 DDB1Q16531 1140 aa25.99■■□□□ 1.75
PUF60-218ENST00000531995 ARHGEF25Q86VW2 580 aa25.99■■□□□ 1.75
PUF60-218ENST00000531995 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
PUF60-218ENST00000531995 KCNH5Q8NCM2 988 aa25.97■■□□□ 1.75
PUF60-218ENST00000531995 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
PUF60-218ENST00000531995 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa25.96■■□□□ 1.75
PUF60-218ENST00000531995 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP25.96■■□□□ 1.75
PUF60-218ENST00000531995 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
PUF60-218ENST00000531995 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa25.93■■□□□ 1.74
PUF60-218ENST00000531995 PTF1AQ7RTS3 328 aa25.92■■□□□ 1.74
PUF60-218ENST00000531995 NME9Q86XW9 330 aa25.92■■□□□ 1.74
PUF60-218ENST00000531995 TMC1Q8TDI8 760 aa25.92■■□□□ 1.74
PUF60-218ENST00000531995 TNS2Q63HR2 1409 aa25.91■■□□□ 1.74
PUF60-218ENST00000531995 NBPF14Q5TI25 921 aa25.9■■□□□ 1.74
PUF60-218ENST00000531995 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
PUF60-218ENST00000531995 CARD10Q9BWT7 1032 aa25.89■■□□□ 1.74
PUF60-218ENST00000531995 A0A1W2PP64 1363 aa25.89■■□□□ 1.74
PUF60-218ENST00000531995 USP31Q70CQ4 1352 aa25.89■■□□□ 1.74
PUF60-218ENST00000531995 NHSQ6T4R5 1651 aa25.89■■□□□ 1.73
PUF60-218ENST00000531995 CASZ1Q86V15 1759 aa25.89■■□□□ 1.73
PUF60-218ENST00000531995 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
PUF60-218ENST00000531995 CCDC7Q96M83 1385 aa25.87■■□□□ 1.73
PUF60-218ENST00000531995 CDCA8Q53HL2 280 aa25.87■■□□□ 1.73
PUF60-218ENST00000531995 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
PUF60-218ENST00000531995 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
PUF60-218ENST00000531995 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
PUF60-218ENST00000531995 BCL9O00512 1426 aa25.85■■□□□ 1.73
PUF60-218ENST00000531995 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
PUF60-218ENST00000531995 ERBB3P21860 1342 aa25.84■■□□□ 1.73
PUF60-218ENST00000531995 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
PUF60-218ENST00000531995 NINLQ9Y2I6 1382 aa25.82■■□□□ 1.72
PUF60-218ENST00000531995 MYOM1P52179 1685 aa25.81■■□□□ 1.72
PUF60-218ENST00000531995 BTAF1O14981 1849 aa25.8■■□□□ 1.72
PUF60-218ENST00000531995 PLSCR1O15162 318 aa25.8■■□□□ 1.72
PUF60-218ENST00000531995 NLRP2Q9NX02 1062 aa25.8■■□□□ 1.72
PUF60-218ENST00000531995 KIF7Q2M1P5 1343 aa25.8■■□□□ 1.72
PUF60-218ENST00000531995 EXOC5O00471 708 aa25.78■■□□□ 1.72
PUF60-218ENST00000531995 TERF2IPQ9NYB0 399 aa25.78■■□□□ 1.72
PUF60-218ENST00000531995 ANKRD24Q8TF21 1146 aa25.77■■□□□ 1.72
PUF60-218ENST00000531995 RGPD2P0DJD1 1756 aa25.77■■□□□ 1.72
PUF60-218ENST00000531995 POLR3GLQ9BT43 218 aa25.76■■□□□ 1.71
PUF60-218ENST00000531995 SPON1Q9HCB6 807 aa25.76■■□□□ 1.71
PUF60-218ENST00000531995 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
PUF60-218ENST00000531995 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa25.76■■□□□ 1.71
PUF60-218ENST00000531995 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.74■■□□□ 1.71
PUF60-218ENST00000531995 KCNQ2O43526 872 aa25.74■■□□□ 1.71
PUF60-218ENST00000531995 PROM2Q8N271 834 aa25.74■■□□□ 1.71
PUF60-218ENST00000531995 ACSBG1Q96GR2 724 aa25.74■■□□□ 1.71
PUF60-218ENST00000531995 CARD14Q9BXL6 1004 aa25.74■■□□□ 1.71
PUF60-218ENST00000531995 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
PUF60-218ENST00000531995 PAPPAQ13219 1627 aa25.74■■□□□ 1.71
PUF60-218ENST00000531995 KAT6BQ8WYB5 2073 aa25.73■■□□□ 1.71
PUF60-218ENST00000531995 IL2RBP14784 551 aa25.72■■□□□ 1.71
PUF60-218ENST00000531995 DOT1LQ8TEK3 1739 aa25.71■■□□□ 1.71
PUF60-218ENST00000531995 TXNRD1Q16881 649 aa25.71■■□□□ 1.71
PUF60-218ENST00000531995 KIF20BQ96Q89 1820 aa25.71■■□□□ 1.71
PUF60-218ENST00000531995 SHANK3Q9BYB0 1731 aa25.71■■□□□ 1.71
PUF60-218ENST00000531995 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
PUF60-218ENST00000531995 ZBTB7AO95365 584 aa25.68■■□□□ 1.7
PUF60-218ENST00000531995 STK32BQ9NY57 414 aa25.67■■□□□ 1.7
PUF60-218ENST00000531995 PANK3Q9H999 370 aa25.66■■□□□ 1.7
PUF60-218ENST00000531995 COG3Q96JB2 828 aa25.65■■□□□ 1.7
PUF60-218ENST00000531995 MAP3K19Q56UN5 1328 aa25.64■■□□□ 1.7
PUF60-218ENST00000531995 FBLN1P23142 703 aa25.64■■□□□ 1.7
PUF60-218ENST00000531995 IP6K1Q92551 441 aa25.64■■□□□ 1.7
PUF60-218ENST00000531995 SLC15A2Q16348 729 aa25.62■■□□□ 1.69
PUF60-218ENST00000531995 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa25.62■■□□□ 1.69
PUF60-218ENST00000531995 MEGF6O75095 1541 aa25.62■■□□□ 1.69
PUF60-218ENST00000531995 FYB1O15117 783 aa25.61■■□□□ 1.69
PUF60-218ENST00000531995 HOXC9P31274 260 aa25.61■■□□□ 1.69
PUF60-218ENST00000531995 NSD3Q9BZ95 1437 aa25.61■■□□□ 1.69
PUF60-218ENST00000531995 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
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