RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525459.1

PTPRK-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRK, Length 1,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-218ENST00000525459 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
PTPRK-218ENST00000525459 CHRNA2Q15822 529 aa25.37■■□□□ 1.65
PTPRK-218ENST00000525459 ZBTB7CA1YPR0 619 aa25.36■■□□□ 1.65
PTPRK-218ENST00000525459 AMPHP49418 695 aa25.36■■□□□ 1.65
PTPRK-218ENST00000525459 RALBP1Q15311 655 aa25.36■■□□□ 1.65
PTPRK-218ENST00000525459 BCL9LQ86UU0 1499 aa25.36■■□□□ 1.65
PTPRK-218ENST00000525459 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
PTPRK-218ENST00000525459 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
PTPRK-218ENST00000525459 IP6K1Q92551 441 aa25.35■■□□□ 1.65
PTPRK-218ENST00000525459 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
PTPRK-218ENST00000525459 BTG4Q9NY30 223 aa25.35■■□□□ 1.65
PTPRK-218ENST00000525459 POLKQ9UBT6 870 aa25.34■■□□□ 1.65
PTPRK-218ENST00000525459 USP21Q9UK80 565 aa25.34■■□□□ 1.65
PTPRK-218ENST00000525459 UNC5CLQ8IV45 518 aa25.33■■□□□ 1.65
PTPRK-218ENST00000525459 INSRP06213 1382 aa25.32■■□□□ 1.64
PTPRK-218ENST00000525459 HOXC9P31274 260 aa25.32■■□□□ 1.64
PTPRK-218ENST00000525459 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa25.32■■□□□ 1.64
PTPRK-218ENST00000525459 FBLN1P23142 703 aa25.31■■□□□ 1.64
PTPRK-218ENST00000525459 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
PTPRK-218ENST00000525459 WNK3Q9BYP7 1800 aa25.29■■□□□ 1.64
PTPRK-218ENST00000525459 ERBB3P21860 1342 aa25.29■■□□□ 1.64
PTPRK-218ENST00000525459 ATRNO75882 1429 aa25.29■■□□□ 1.64
PTPRK-218ENST00000525459 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
PTPRK-218ENST00000525459 AXIN2Q9Y2T1 843 aa25.28■■□□□ 1.64
PTPRK-218ENST00000525459 WDR17Q8IZU2 1322 aa25.28■■□□□ 1.64
PTPRK-218ENST00000525459 CRB1P82279 1406 aa25.28■■□□□ 1.64
PTPRK-218ENST00000525459 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
PTPRK-218ENST00000525459 EVA1CP58658 441 aa25.27■■□□□ 1.64
PTPRK-218ENST00000525459 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
PTPRK-218ENST00000525459 RGPD2P0DJD1 1756 aa25.27■■□□□ 1.64
PTPRK-218ENST00000525459 VPS72Q15906 364 aa25.26■■□□□ 1.63
PTPRK-218ENST00000525459 PPP2R1AP30153 589 aa25.26■■□□□ 1.63
PTPRK-218ENST00000525459 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
PTPRK-218ENST00000525459 MTHFSP49914 203 aa25.25■■□□□ 1.63
PTPRK-218ENST00000525459 ANP32CO43423 234 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPRK-218ENST00000525459 ANKRD24Q8TF21 1146 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPRK-218ENST00000525459 STRN4Q9NRL3 753 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPRK-218ENST00000525459 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRK-218ENST00000525459 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRK-218ENST00000525459 CFAP53Q96M91 514 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRK-218ENST00000525459 GLI3P10071 1580 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRK-218ENST00000525459 RGPD1P0DJD0 1748 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRK-218ENST00000525459 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
PTPRK-218ENST00000525459 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.63
PTPRK-218ENST00000525459 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRK-218ENST00000525459 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRK-218ENST00000525459 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRK-218ENST00000525459 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
PTPRK-218ENST00000525459 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
PTPRK-218ENST00000525459 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
PTPRK-218ENST00000525459 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRK-218ENST00000525459 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
PTPRK-218ENST00000525459 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
PTPRK-218ENST00000525459 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
PTPRK-218ENST00000525459 CARD10Q9BWT7 1032 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRK-218ENST00000525459 NCAPD2Q15021 1401 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRK-218ENST00000525459 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRK-218ENST00000525459 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
PTPRK-218ENST00000525459 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
PTPRK-218ENST00000525459 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
PTPRK-218ENST00000525459 NLRP2Q9NX02 1062 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRK-218ENST00000525459 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
PTPRK-218ENST00000525459 TCP11L2Q8N4U5 519 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRK-218ENST00000525459 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRK-218ENST00000525459 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
PTPRK-218ENST00000525459 BARGINQ6ZT62 677 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRK-218ENST00000525459 RXRBP28702 533 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRK-218ENST00000525459 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
PTPRK-218ENST00000525459 POTEAQ6S8J7 498 aa25.11■■□□□ 1.61
PTPRK-218ENST00000525459 IGSF1Q8N6C5 1336 aa25.11■■□□□ 1.61
PTPRK-218ENST00000525459 IL13P35225 146 aa25.1■■□□□ 1.61
PTPRK-218ENST00000525459 LRRC37A3O60309 1634 aa25.09■■□□□ 1.61
PTPRK-218ENST00000525459 NUDCQ9Y266 331 aa25.09■■□□□ 1.61
PTPRK-218ENST00000525459 USP35Q9P2H5 1018 aa25.09■■□□□ 1.61
PTPRK-218ENST00000525459 DISP2A7MBM2 1401 aa25.08■■□□□ 1.61
PTPRK-218ENST00000525459 NBPF6Q5VWK0 638 aa25.08■■□□□ 1.61
PTPRK-218ENST00000525459 NBPF4Q96M43 638 aa25.08■■□□□ 1.61
PTPRK-218ENST00000525459 EYA1Q99502 592 aa25.07■■□□□ 1.6
PTPRK-218ENST00000525459 PKD1L3Q7Z443 1732 aa25.07■■□□□ 1.6
PTPRK-218ENST00000525459 KDRP35968 1356 aa25.06■■□□□ 1.6
PTPRK-218ENST00000525459 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
PTPRK-218ENST00000525459 BRWD3Q6RI45 1802 aa25.06■■□□□ 1.6
PTPRK-218ENST00000525459 IL2RBP14784 551 aa25.04■■□□□ 1.6
PTPRK-218ENST00000525459 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
PTPRK-218ENST00000525459 RGS12O14924 1447 aa25.03■■□□□ 1.6
PTPRK-218ENST00000525459 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa25.03■■□□□ 1.6
PTPRK-218ENST00000525459 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa25.02■■□□□ 1.6
PTPRK-218ENST00000525459 TNS2Q63HR2 1409 aa25.02■■□□□ 1.6
PTPRK-218ENST00000525459 SHANK3Q9BYB0 1731 aa25.02■■□□□ 1.6
PTPRK-218ENST00000525459 MEGF6O75095 1541 aa25.02■■□□□ 1.6
PTPRK-218ENST00000525459 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
PTPRK-218ENST00000525459 USHBP1Q8N6Y0 703 aa25■■□□□ 1.59
PTPRK-218ENST00000525459 A0A0G2JS52 829 aa24.99■■□□□ 1.59
PTPRK-218ENST00000525459 TATP17735 454 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
PTPRK-218ENST00000525459 MYT1Q01538 1121 aa24.99■■□□□ 1.59
PTPRK-218ENST00000525459 SULT6B1Q6IMI4 303 aa24.98■■□□□ 1.59
PTPRK-218ENST00000525459 SEPT12Q8IYM1 358 aa24.97■■□□□ 1.59
PTPRK-218ENST00000525459 DDB1Q16531 1140 aa24.96■■□□□ 1.59
PTPRK-218ENST00000525459 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.59
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