RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521812.1

MEG3-218, Transcript of maternally expressed 3, humanhuman

TSL 2

Gene MEG3, Length 635 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEG3-218ENST00000521812 NLRP13Q86W25 1043 aa23.12■■□□□ 1.29
MEG3-218ENST00000521812 SLC15A2Q16348 729 aa23.11■■□□□ 1.29
MEG3-218ENST00000521812 SGIP1Q9BQI5 828 aa23.11■■□□□ 1.29
MEG3-218ENST00000521812 MTFR1LQ9H019 292 aa23.11■■□□□ 1.29
MEG3-218ENST00000521812 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa23.11■■□□□ 1.29
MEG3-218ENST00000521812 CHD4Q14839 1912 aa23.1■■□□□ 1.29
MEG3-218ENST00000521812 BCL9O00512 1426 aa23.1■■□□□ 1.29
MEG3-218ENST00000521812 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
MEG3-218ENST00000521812 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa23.09■■□□□ 1.29
MEG3-218ENST00000521812 TXNRD1Q16881 649 aa23.09■■□□□ 1.29
MEG3-218ENST00000521812 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
MEG3-218ENST00000521812 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
MEG3-218ENST00000521812 DCAF11Q8TEB1 546 aa23.08■■□□□ 1.29
MEG3-218ENST00000521812 AATKQ6ZMQ8 1374 aa23.06■■□□□ 1.28
MEG3-218ENST00000521812 CEP350Q5VT06 3117 aa23.06■■□□□ 1.28
MEG3-218ENST00000521812 ZBTB7CA1YPR0 619 aa23.06■■□□□ 1.28
MEG3-218ENST00000521812 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa23.06■■□□□ 1.28
MEG3-218ENST00000521812 STAC3Q96MF2 364 aa23.04■■□□□ 1.28
MEG3-218ENST00000521812 ARXQ96QS3 562 aa23.04■■□□□ 1.28
MEG3-218ENST00000521812 MAP3K5Q99683 1374 aa23.03■■□□□ 1.28
MEG3-218ENST00000521812 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
MEG3-218ENST00000521812 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
MEG3-218ENST00000521812 WDR17Q8IZU2 1322 aa23■■□□□ 1.27
MEG3-218ENST00000521812 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
MEG3-218ENST00000521812 GPR162Q16538 588 aa22.99■■□□□ 1.27
MEG3-218ENST00000521812 NLRP6P59044 892 aa22.98■■□□□ 1.27
MEG3-218ENST00000521812 AXIN2Q9Y2T1 843 aa22.98■■□□□ 1.27
MEG3-218ENST00000521812 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa22.98■■□□□ 1.27
MEG3-218ENST00000521812 SLIT3O75094 1523 aa22.98■■□□□ 1.27
MEG3-218ENST00000521812 AKAP12Q02952 1782 aa22.96■■□□□ 1.27
MEG3-218ENST00000521812 WNK3Q9BYP7 1800 aa22.96■■□□□ 1.27
MEG3-218ENST00000521812 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
MEG3-218ENST00000521812 COL18A1P39060 1754 aa22.94■■□□□ 1.26
MEG3-218ENST00000521812 EXOC5O00471 708 aa22.94■■□□□ 1.26
MEG3-218ENST00000521812 CARD10Q9BWT7 1032 aa22.94■■□□□ 1.26
MEG3-218ENST00000521812 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
MEG3-218ENST00000521812 USP6P35125 1406 aa22.92■■□□□ 1.26
MEG3-218ENST00000521812 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
MEG3-218ENST00000521812 PAPPAQ13219 1627 aa22.9■■□□□ 1.26
MEG3-218ENST00000521812 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa22.9■■□□□ 1.26
MEG3-218ENST00000521812 ARHGEF25Q86VW2 580 aa22.9■■□□□ 1.26
MEG3-218ENST00000521812 CABP2Q9NPB3 220 aa22.9■■□□□ 1.26
MEG3-218ENST00000521812 ZNF827Q17R98 1081 aa22.89■■□□□ 1.25
MEG3-218ENST00000521812 TNS2Q63HR2 1409 aa22.88■■□□□ 1.25
MEG3-218ENST00000521812 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
MEG3-218ENST00000521812 KLHL34Q8N239 644 aa22.87■■□□□ 1.25
MEG3-218ENST00000521812 ACSBG1Q96GR2 724 aa22.87■■□□□ 1.25
MEG3-218ENST00000521812 CABP1Q9NZU7 370 aa22.87■■□□□ 1.25
MEG3-218ENST00000521812 SHANK3Q9BYB0 1731 aa22.87■■□□□ 1.25
MEG3-218ENST00000521812 NHSQ6T4R5 1651 aa22.87■■□□□ 1.25
MEG3-218ENST00000521812 CCDC7Q96M83 1385 aa22.86■■□□□ 1.25
MEG3-218ENST00000521812 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.85■■□□□ 1.25
MEG3-218ENST00000521812 PIK3C2AO00443 1686 aa22.84■■□□□ 1.25
MEG3-218ENST00000521812 POLD1P28340 1107 aa22.84■■□□□ 1.25
MEG3-218ENST00000521812 SLC16A10Q8TF71 515 aa22.84■■□□□ 1.25
MEG3-218ENST00000521812 KCNH5Q8NCM2 988 aa22.83■■□□□ 1.25
MEG3-218ENST00000521812 LRRC4BQ9NT99 713 aa22.83■■□□□ 1.25
MEG3-218ENST00000521812 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa22.82■■□□□ 1.24
MEG3-218ENST00000521812 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
MEG3-218ENST00000521812 NLGN2Q8NFZ4 835 aa22.81■■□□□ 1.24
MEG3-218ENST00000521812 AKT1S1Q96B36 256 aa22.81■■□□□ 1.24
MEG3-218ENST00000521812 SOX12O15370 315 aa22.8■■□□□ 1.24
MEG3-218ENST00000521812 NBPF1Q3BBV0 1214 aa22.8■■□□□ 1.24
MEG3-218ENST00000521812 ABCC6O95255 1503 aa22.8■■□□□ 1.24
MEG3-218ENST00000521812 RGPD5Q99666 1765 aa22.79■■□□□ 1.24
MEG3-218ENST00000521812 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa22.78■■□□□ 1.24
MEG3-218ENST00000521812 GRIN3BO60391 1043 aa22.77■■□□□ 1.24
MEG3-218ENST00000521812 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP22.77■■□□□ 1.24
MEG3-218ENST00000521812 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa22.77■■□□□ 1.24
MEG3-218ENST00000521812 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa22.77■■□□□ 1.24
MEG3-218ENST00000521812 BTAF1O14981 1849 aa22.76■■□□□ 1.23
MEG3-218ENST00000521812 QRICH2Q9H0J4 1663 aa22.76■■□□□ 1.23
MEG3-218ENST00000521812 COL24A1Q17RW2 1714 aa22.75■■□□□ 1.23
MEG3-218ENST00000521812 SLC27A3Q5K4L6 730 aa22.75■■□□□ 1.23
MEG3-218ENST00000521812 NFAT5O94916 1531 aa22.75■■□□□ 1.23
MEG3-218ENST00000521812 ATP10DQ9P241 1426 aa22.74■■□□□ 1.23
MEG3-218ENST00000521812 IL2RBP14784 551 aa22.73■■□□□ 1.23
MEG3-218ENST00000521812 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
MEG3-218ENST00000521812 QSER1Q2KHR3 1735 aa22.73■■□□□ 1.23
MEG3-218ENST00000521812 HSPA6P17066 643 aa22.72■■□□□ 1.23
MEG3-218ENST00000521812 NLRP2Q9NX02 1062 aa22.72■■□□□ 1.23
MEG3-218ENST00000521812 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa22.72■■□□□ 1.23
MEG3-218ENST00000521812 TTC21AQ8NDW8 1320 aa22.72■■□□□ 1.23
MEG3-218ENST00000521812 ERBB3P21860 1342 aa22.71■■□□□ 1.23
MEG3-218ENST00000521812 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
MEG3-218ENST00000521812 EVC2Q86UK5 1308 aa22.67■■□□□ 1.22
MEG3-218ENST00000521812 KCNQ4P56696 695 aa22.66■■□□□ 1.22
MEG3-218ENST00000521812 KAT6BQ8WYB5 2073 aa22.65■■□□□ 1.22
MEG3-218ENST00000521812 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa22.64■■□□□ 1.21
MEG3-218ENST00000521812 ADCY9O60503 1353 aa22.63■■□□□ 1.21
MEG3-218ENST00000521812 ANKRD24Q8TF21 1146 aa22.62■■□□□ 1.21
MEG3-218ENST00000521812 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
MEG3-218ENST00000521812 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
MEG3-218ENST00000521812 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
MEG3-218ENST00000521812 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
MEG3-218ENST00000521812 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
MEG3-218ENST00000521812 USP31Q70CQ4 1352 aa22.59■■□□□ 1.21
MEG3-218ENST00000521812 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
MEG3-218ENST00000521812 MSL1Q68DK7 614 aa22.57■■□□□ 1.2
MEG3-218ENST00000521812 CD2APQ9Y5K6 639 aa22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms