RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 RARSP54136 660 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.83
TRPS1-208ENST00000519076 PDE4AP27815 886 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-208ENST00000519076 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-208ENST00000519076 TBX22Q9Y458 520 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-208ENST00000519076 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-208ENST00000519076 ROBO2Q9HCK4 1378 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-208ENST00000519076 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-208ENST00000519076 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-208ENST00000519076 MYO5BQ9ULV0 1848 aa9.89□□□□□ -0.83
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-208ENST00000519076 PDE3AQ14432 1141 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-208ENST00000519076 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-208ENST00000519076 PHACTR3Q96KR7 559 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-208ENST00000519076 PDCL3Q9H2J4 239 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-208ENST00000519076 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-208ENST00000519076 NFE2L2Q16236 605 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF521Q96K83 1311 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-208ENST00000519076 INSRP06213 1382 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-208ENST00000519076 PTPRMP28827 1452 aa9.88□□□□□ -0.83
TRPS1-208ENST00000519076 PRR36Q9H6K5 1346 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-208ENST00000519076 GNAI1P63096 354 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-208ENST00000519076 FAM83GA6ND36 823 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-208ENST00000519076 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-208ENST00000519076 TAOK2Q9UL54 1235 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-208ENST00000519076 FOXO3O43524 673 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-208ENST00000519076 AEBP1Q8IUX7 1158 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-208ENST00000519076 SSH1Q8WYL5 1049 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-208ENST00000519076 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-208ENST00000519076 TNNQ9UQP3 1299 aa9.87□□□□□ -0.83
TRPS1-208ENST00000519076 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
TRPS1-208ENST00000519076 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-208ENST00000519076 MCM10Q7L590 875 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-208ENST00000519076 PHF8Q9UPP1 1060 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC27Q2M243 656 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-208ENST00000519076 NECTIN2Q92692 538 aa9.85□□□□□ -0.83
TRPS1-208ENST00000519076 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-208ENST00000519076 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-208ENST00000519076 KIF16BQ96L93 1317 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-208ENST00000519076 IFT172Q9UG01 1749 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-208ENST00000519076 SLC4A10Q6U841 1118 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-208ENST00000519076 TRIM35Q9UPQ4 493 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-208ENST00000519076 APBB1O00213 710 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-208ENST00000519076 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-208ENST00000519076 SIRT1Q96EB6 747 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-208ENST00000519076 MIS18AQ9NYP9 233 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-208ENST00000519076 DDX19BQ9UMR2 479 aa9.84□□□□□ -0.83
TRPS1-208ENST00000519076 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-208ENST00000519076 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-208ENST00000519076 MYOM1P52179 1685 aa9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-208ENST00000519076 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-208ENST00000519076 RLBP1P12271 317 aa9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-208ENST00000519076 ATF3P18847 181 aa9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-208ENST00000519076 NLRP1Q9C000 1473 aa9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-208ENST00000519076 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-208ENST00000519076 TSPYL4Q9UJ04 414 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-208ENST00000519076 IL13P35225 146 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-208ENST00000519076 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-208ENST00000519076 USHBP1Q8N6Y0 703 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-208ENST00000519076 TRIM27P14373 513 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-208ENST00000519076 MAP3K19Q56UN5 1328 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-208ENST00000519076 PLEKHG3A1L390 1219 aa9.81□□□□□ -0.84
TRPS1-208ENST00000519076 MVPQ14764 893 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
TRPS1-208ENST00000519076 PLEKHF1Q96S99 279 aa9.81□□□□□ -0.84
TRPS1-208ENST00000519076 FAM135BQ49AJ0 1406 aa9.81□□□□□ -0.84
TRPS1-208ENST00000519076 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
TRPS1-208ENST00000519076 STK31Q9BXU1 1019 aa9.81□□□□□ -0.84
TRPS1-208ENST00000519076 IGHDP01880 384 aa9.81□□□□□ -0.84
TRPS1-208ENST00000519076 FAM161AQ3B820 660 aa9.81□□□□□ -0.84
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM57Q8N5G2 664 aa9.81□□□□□ -0.84
TRPS1-208ENST00000519076 C1orf115Q9H7X2 142 aa9.81□□□□□ -0.84
TRPS1-208ENST00000519076 KIF13AQ9H1H9 1805 aa9.8□□□□□ -0.84
TRPS1-208ENST00000519076 ATP7BP35670 1465 aa9.8□□□□□ -0.84
TRPS1-208ENST00000519076 HSPA2P54652 639 aa9.8□□□□□ -0.84
TRPS1-208ENST00000519076 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP9.8□□□□□ -0.84
TRPS1-208ENST00000519076 MBIPQ9NS73 344 aa9.8□□□□□ -0.84
TRPS1-208ENST00000519076 MYO3AQ8NEV4 1616 aa9.8□□□□□ -0.84
TRPS1-208ENST00000519076 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-208ENST00000519076 TSPYL6Q8N831 410 aa9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-208ENST00000519076 BACH2Q9BYV9 841 aa9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-208ENST00000519076 TTC21AQ8NDW8 1320 aa9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-208ENST00000519076 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-208ENST00000519076 REREQ9P2R6 1566 aa9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-208ENST00000519076 GAS2L2Q8NHY3 880 aa9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-208ENST00000519076 ORAI2Q96SN7 254 aa9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-208ENST00000519076 IFT57Q9NWB7 429 aa9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-208ENST00000519076 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
TRPS1-208ENST00000519076 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
TRPS1-208ENST00000519076 TEFQ10587 303 aa9.78□□□□□ -0.84
TRPS1-208ENST00000519076 KRT24Q2M2I5 525 aa9.78□□□□□ -0.84
TRPS1-208ENST00000519076 DDRGK1Q96HY6 314 aa9.78□□□□□ -0.84
TRPS1-208ENST00000519076 CFAP44Q96MT7 982 aa9.78□□□□□ -0.84
TRPS1-208ENST00000519076 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa9.78□□□□□ -0.84
TRPS1-208ENST00000519076 IL16Q14005 1332 aa9.78□□□□□ -0.84
TRPS1-208ENST00000519076 LNPKQ9C0E8 428 aa9.78□□□□□ -0.84
TRPS1-208ENST00000519076 SLC4A3P48751 1232 aa9.77□□□□□ -0.84
TRPS1-208ENST00000519076 ANKRD45Q5TZF3 282 aa9.77□□□□□ -0.84
TRPS1-208ENST00000519076 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.84
TRPS1-208ENST00000519076 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa9.77□□□□□ -0.84
TRPS1-208ENST00000519076 PLCD3Q8N3E9 789 aa9.77□□□□□ -0.85
TRPS1-208ENST00000519076 C8orf58Q8NAV2 365 aa9.77□□□□□ -0.85
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