RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, human

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE4D-222	ENST00000514552	NBPF14	Q5TI25	921 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PDE4D-222	ENST00000514552	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
PDE4D-222	ENST00000514552	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PDE4D-222	ENST00000514552	COG6	Q9Y2V7	657 aa		11.72	□□□□□ -0.53
PDE4D-222	ENST00000514552	DIP2B	Q9P265	1576 aa		11.71	□□□□□ -0.53
PDE4D-222	ENST00000514552	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
PDE4D-222	ENST00000514552		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
PDE4D-222	ENST00000514552	RGS20	O76081	388 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PDE4D-222	ENST00000514552	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		11.7	□□□□□ -0.54
PDE4D-222	ENST00000514552	WNT7B	P56706	349 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PDE4D-222	ENST00000514552	BAP1	Q92560	729 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PDE4D-222	ENST00000514552	PRKD2	Q9BZL6	878 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PDE4D-222	ENST00000514552	IQGAP2	Q13576	1575 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PDE4D-222	ENST00000514552	GPR37L1	O60883	481 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PDE4D-222	ENST00000514552	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PDE4D-222	ENST00000514552	C14orf37	Q86TY3	774 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF511	Q8NB15	262 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PDE4D-222	ENST00000514552	POM121	Q96HA1	1249 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PDE4D-222	ENST00000514552	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PDE4D-222	ENST00000514552		A6NJR5	290 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PDE4D-222	ENST00000514552	SPRYD7	Q5W111	196 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PDE4D-222	ENST00000514552	GPSM3	Q9Y4H4	160 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PDE4D-222	ENST00000514552	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PDE4D-222	ENST00000514552	ABL2	P42684	1182 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PDE4D-222	ENST00000514552	LINC01559	Q495D7	138 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PDE4D-222	ENST00000514552	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PDE4D-222	ENST00000514552	SH3BP2	P78314	561 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PDE4D-222	ENST00000514552	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4D-222	ENST00000514552	PTPRG	P23470	1445 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4D-222	ENST00000514552	PTK2	Q05397	1052 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4D-222	ENST00000514552	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4D-222	ENST00000514552	WWC1	Q8IX03	1113 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4D-222	ENST00000514552	ABCC2	Q92887	1545 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4D-222	ENST00000514552	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PDE4D-222	ENST00000514552	SKOR1	P84550	965 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4D-222	ENST00000514552	IRF5	Q13568	498 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PDE4D-222	ENST00000514552	BPHL	Q86WA6	291 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PDE4D-222	ENST00000514552	ZMYND15	Q9H091	742 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PDE4D-222	ENST00000514552	ZBBX	A8MT70	800 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PDE4D-222	ENST00000514552	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PDE4D-222	ENST00000514552	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PDE4D-222	ENST00000514552	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PDE4D-222	ENST00000514552	WASHC4	Q2M389	1173 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF697	Q5TEC3	545 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PDE4D-222	ENST00000514552	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
PDE4D-222	ENST00000514552	FOXJ1	Q92949	421 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PDE4D-222	ENST00000514552	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PDE4D-222	ENST00000514552	DISP1	Q96F81	1524 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PDE4D-222	ENST00000514552	GLI2	P10070	1586 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PDE4D-222	ENST00000514552	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PDE4D-222	ENST00000514552	AGER	Q15109	404 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PDE4D-222	ENST00000514552	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
PDE4D-222	ENST00000514552	ARHGAP9	Q9BRR9	750 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PDE4D-222	ENST00000514552	KDM6B	O15054	1643 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PDE4D-222	ENST00000514552	NR1H3	Q13133	447 aa		11.59	□□□□□ -0.55
PDE4D-222	ENST00000514552	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	11.59	□□□□□ -0.55
PDE4D-222	ENST00000514552	WNT7A	O00755	349 aa		11.58	□□□□□ -0.56
PDE4D-222	ENST00000514552	FBXO45	P0C2W1	286 aa		11.58	□□□□□ -0.56
PDE4D-222	ENST00000514552	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	11.58	□□□□□ -0.56
PDE4D-222	ENST00000514552	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		11.58	□□□□□ -0.56
PDE4D-222	ENST00000514552	UACA	Q9BZF9	1416 aa		11.58	□□□□□ -0.56
PDE4D-222	ENST00000514552	KIAA0556	O60303	1618 aa		11.57	□□□□□ -0.56
PDE4D-222	ENST00000514552	C4orf48	Q5BLP8	95 aa		11.57	□□□□□ -0.56
PDE4D-222	ENST00000514552	ZBTB33	Q86T24	672 aa		11.57	□□□□□ -0.56
PDE4D-222	ENST00000514552	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		11.57	□□□□□ -0.56
PDE4D-222	ENST00000514552	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		11.56	□□□□□ -0.56
PDE4D-222	ENST00000514552	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		11.56	□□□□□ -0.56
PDE4D-222	ENST00000514552	ASXL2	Q76L83	1435 aa		11.56	□□□□□ -0.56
PDE4D-222	ENST00000514552	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		11.56	□□□□□ -0.56
PDE4D-222	ENST00000514552	C1QTNF2	Q9BXJ5	285 aa		11.56	□□□□□ -0.56
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	11.56	□□□□□ -0.56
PDE4D-222	ENST00000514552	FAM174A	Q8TBP5	190 aa		11.55	□□□□□ -0.56
PDE4D-222	ENST00000514552	ADAM32	Q8TC27	787 aa		11.55	□□□□□ -0.56
PDE4D-222	ENST00000514552	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		11.55	□□□□□ -0.56
PDE4D-222	ENST00000514552	TRAK2	O60296	914 aa		11.54	□□□□□ -0.56
PDE4D-222	ENST00000514552	ERFE	Q4G0M1	354 aa		11.54	□□□□□ -0.56
PDE4D-222	ENST00000514552	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		11.54	□□□□□ -0.56
PDE4D-222	ENST00000514552	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		11.54	□□□□□ -0.56
PDE4D-222	ENST00000514552	VAC14	Q08AM6	782 aa		11.53	□□□□□ -0.56
PDE4D-222	ENST00000514552	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	11.53	□□□□□ -0.56
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF592	Q92610	1267 aa		11.53	□□□□□ -0.56
PDE4D-222	ENST00000514552	MRGPRX2	Q96LB1	330 aa		11.53	□□□□□ -0.56
PDE4D-222	ENST00000514552	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	11.52	□□□□□ -0.56
PDE4D-222	ENST00000514552	GOLGA3	Q08378	1498 aa		11.52	□□□□□ -0.56
PDE4D-222	ENST00000514552	GDF9	O60383	454 aa		11.52	□□□□□ -0.57
PDE4D-222	ENST00000514552	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	11.52	□□□□□ -0.57
PDE4D-222	ENST00000514552	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	11.52	□□□□□ -0.57
PDE4D-222	ENST00000514552	FOXC1	Q12948	553 aa		11.52	□□□□□ -0.57
PDE4D-222	ENST00000514552	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		11.52	□□□□□ -0.57
PDE4D-222	ENST00000514552	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
PDE4D-222	ENST00000514552	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
PDE4D-222	ENST00000514552	SIAH2	O43255	324 aa		11.51	□□□□□ -0.57
PDE4D-222	ENST00000514552	SOX11	P35716	441 aa		11.51	□□□□□ -0.57
PDE4D-222	ENST00000514552	MPND	Q8N594	471 aa		11.51	□□□□□ -0.57
PDE4D-222	ENST00000514552	TSPOAP1	O95153	1857 aa		11.51	□□□□□ -0.57
PDE4D-222	ENST00000514552	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		11.51	□□□□□ -0.57
PDE4D-222	ENST00000514552	PRR20E	P86478	221 aa		11.5	□□□□□ -0.57
PDE4D-222	ENST00000514552	PRR20C	P86479	221 aa		11.5	□□□□□ -0.57
PDE4D-222	ENST00000514552	PRR20D	P86480	221 aa		11.5	□□□□□ -0.57

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