RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A0G2JS52 829 aa26.19■■□□□ 1.78
SH3BP2-218ENST00000511185 MYT1Q01538 1121 aa26.19■■□□□ 1.78
SH3BP2-218ENST00000511185 RGPD1P0DJD0 1748 aa26.18■■□□□ 1.78
SH3BP2-218ENST00000511185 USP35Q9P2H5 1018 aa26.18■■□□□ 1.78
SH3BP2-218ENST00000511185 RGPD2P0DJD1 1756 aa26.18■■□□□ 1.78
SH3BP2-218ENST00000511185 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa26.17■■□□□ 1.78
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC24A1O60721 1099 aa26.17■■□□□ 1.78
SH3BP2-218ENST00000511185 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
SH3BP2-218ENST00000511185 ARHGEF25Q86VW2 580 aa26.17■■□□□ 1.78
SH3BP2-218ENST00000511185 AXIN2Q9Y2T1 843 aa26.17■■□□□ 1.78
SH3BP2-218ENST00000511185 CRB1P82279 1406 aa26.16■■□□□ 1.78
SH3BP2-218ENST00000511185 KCNH5Q8NCM2 988 aa26.16■■□□□ 1.78
SH3BP2-218ENST00000511185 EVA1CP58658 441 aa26.14■■□□□ 1.78
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
SH3BP2-218ENST00000511185 KRT27Q7Z3Y8 459 aa26.13■■□□□ 1.77
SH3BP2-218ENST00000511185 PEAK1Q9H792 1746 aa26.13■■□□□ 1.77
SH3BP2-218ENST00000511185 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.12■■□□□ 1.77
SH3BP2-218ENST00000511185 NSD3Q9BZ95 1437 aa26.12■■□□□ 1.77
SH3BP2-218ENST00000511185 CDCA8Q53HL2 280 aa26.11■■□□□ 1.77
SH3BP2-218ENST00000511185 SBF2Q86WG5 1849 aa26.1■■□□□ 1.77
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM182BQ5T319 152 aa26.1■■□□□ 1.77
SH3BP2-218ENST00000511185 WDR17Q8IZU2 1322 aa26.09■■□□□ 1.77
SH3BP2-218ENST00000511185 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
SH3BP2-218ENST00000511185 BARGINQ6ZT62 677 aa26.07■■□□□ 1.76
SH3BP2-218ENST00000511185 TCP11L2Q8N4U5 519 aa26.07■■□□□ 1.76
SH3BP2-218ENST00000511185 POLR3GLQ9BT43 218 aa26.07■■□□□ 1.76
SH3BP2-218ENST00000511185 FBLN1P23142 703 aa26.05■■□□□ 1.76
SH3BP2-218ENST00000511185 CARD14Q9BXL6 1004 aa26.05■■□□□ 1.76
SH3BP2-218ENST00000511185 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa26.04■■□□□ 1.76
SH3BP2-218ENST00000511185 GGNBP2Q9H3C7 697 aa26.04■■□□□ 1.76
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SH3BP2-218ENST00000511185 DISP2A7MBM2 1401 aa26.04■■□□□ 1.76
SH3BP2-218ENST00000511185 COG3Q96JB2 828 aa26.03■■□□□ 1.76
SH3BP2-218ENST00000511185 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
SH3BP2-218ENST00000511185 FYB1O15117 783 aa26.02■■□□□ 1.76
SH3BP2-218ENST00000511185 ERBB3P21860 1342 aa26.02■■□□□ 1.76
SH3BP2-218ENST00000511185 SHANK3Q9BYB0 1731 aa26.01■■□□□ 1.75
SH3BP2-218ENST00000511185 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
SH3BP2-218ENST00000511185 MAP3K19Q56UN5 1328 aa25.99■■□□□ 1.75
SH3BP2-218ENST00000511185 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa25.99■■□□□ 1.75
SH3BP2-218ENST00000511185 RREB1Q92766 1687 aa25.96■■□□□ 1.75
SH3BP2-218ENST00000511185 DEFB132Q7Z7B7 95 aa25.96■■□□□ 1.75
SH3BP2-218ENST00000511185 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
SH3BP2-218ENST00000511185 ANKRD24Q8TF21 1146 aa25.95■■□□□ 1.74
SH3BP2-218ENST00000511185 RTL1A6NKG5 1358 aa25.95■■□□□ 1.74
SH3BP2-218ENST00000511185 CARD10Q9BWT7 1032 aa25.94■■□□□ 1.74
SH3BP2-218ENST00000511185 TNS2Q63HR2 1409 aa25.94■■□□□ 1.74
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC7Q96M83 1385 aa25.94■■□□□ 1.74
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC125Q86Z20 511 aa25.93■■□□□ 1.74
SH3BP2-218ENST00000511185 NUP188Q5SRE5 1749 aa25.92■■□□□ 1.74
SH3BP2-218ENST00000511185 HOXC9P31274 260 aa25.92■■□□□ 1.74
SH3BP2-218ENST00000511185 IP6K1Q92551 441 aa25.92■■□□□ 1.74
SH3BP2-218ENST00000511185 KIF7Q2M1P5 1343 aa25.91■■□□□ 1.74
SH3BP2-218ENST00000511185 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa25.91■■□□□ 1.74
SH3BP2-218ENST00000511185 PDE3BQ13370 1112 aa25.9■■□□□ 1.74
SH3BP2-218ENST00000511185 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
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SH3BP2-218ENST00000511185 NHSQ6T4R5 1651 aa25.89■■□□□ 1.73
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SH3BP2-218ENST00000511185 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa25.89■■□□□ 1.73
SH3BP2-218ENST00000511185 CGNL1Q0VF96 1302 aa25.88■■□□□ 1.73
SH3BP2-218ENST00000511185 AMPHP49418 695 aa25.87■■□□□ 1.73
SH3BP2-218ENST00000511185 DDB1Q16531 1140 aa25.87■■□□□ 1.73
SH3BP2-218ENST00000511185 PANK3Q9H999 370 aa25.87■■□□□ 1.73
SH3BP2-218ENST00000511185 DOT1LQ8TEK3 1739 aa25.86■■□□□ 1.73
SH3BP2-218ENST00000511185 TRIM37O94972 964 aa25.86■■□□□ 1.73
SH3BP2-218ENST00000511185 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM196AQ6ZSG2 479 aa25.86■■□□□ 1.73
SH3BP2-218ENST00000511185 MEGF6O75095 1541 aa25.85■■□□□ 1.73
SH3BP2-218ENST00000511185 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa25.85■■□□□ 1.73
SH3BP2-218ENST00000511185 FLT4P35916 1363 aa25.84■■□□□ 1.73
SH3BP2-218ENST00000511185 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
SH3BP2-218ENST00000511185 BTAF1O14981 1849 aa25.82■■□□□ 1.72
SH3BP2-218ENST00000511185 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
SH3BP2-218ENST00000511185 PKD1L3Q7Z443 1732 aa25.81■■□□□ 1.72
SH3BP2-218ENST00000511185 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
SH3BP2-218ENST00000511185 BAG6P46379 1132 aa25.8■■□□□ 1.72
SH3BP2-218ENST00000511185 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa25.8■■□□□ 1.72
SH3BP2-218ENST00000511185 INSRP06213 1382 aa25.8■■□□□ 1.72
SH3BP2-218ENST00000511185 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
SH3BP2-218ENST00000511185 KAT6BQ8WYB5 2073 aa25.79■■□□□ 1.72
SH3BP2-218ENST00000511185 IL2RBP14784 551 aa25.79■■□□□ 1.72
SH3BP2-218ENST00000511185 KIF24Q5T7B8 1368 aa25.79■■□□□ 1.72
SH3BP2-218ENST00000511185 PTF1AQ7RTS3 328 aa25.78■■□□□ 1.72
SH3BP2-218ENST00000511185 USHBP1Q8N6Y0 703 aa25.78■■□□□ 1.72
SH3BP2-218ENST00000511185 BCL9O00512 1426 aa25.78■■□□□ 1.72
SH3BP2-218ENST00000511185 NSD2O96028 1365 aa25.77■■□□□ 1.72
SH3BP2-218ENST00000511185 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
SH3BP2-218ENST00000511185 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.76■■□□□ 1.71
SH3BP2-218ENST00000511185 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
SH3BP2-218ENST00000511185 NBPF6Q5VWK0 638 aa25.75■■□□□ 1.71
SH3BP2-218ENST00000511185 NBPF4Q96M43 638 aa25.75■■□□□ 1.71
SH3BP2-218ENST00000511185 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa25.74■■□□□ 1.71
SH3BP2-218ENST00000511185 NCAPD2Q15021 1401 aa25.73■■□□□ 1.71
SH3BP2-218ENST00000511185 EXOC5O00471 708 aa25.73■■□□□ 1.71
SH3BP2-218ENST00000511185 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
SH3BP2-218ENST00000511185 APBA3O96018 575 aa25.73■■□□□ 1.71
SH3BP2-218ENST00000511185 CAMKK2Q96RR4 588 aa25.71■■□□□ 1.71
SH3BP2-218ENST00000511185 POLKQ9UBT6 870 aa25.71■■□□□ 1.71
SH3BP2-218ENST00000511185 ITGB4P16144 1822 aa25.68■■□□□ 1.7
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