RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510363.1

NHP2-204, Transcript of NHP2 ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NHP2, Length 566 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHP2-204ENST00000510363 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
NHP2-204ENST00000510363 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
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NHP2-204ENST00000510363 NBPF14Q5TI25 921 aa22.48■■□□□ 1.19
NHP2-204ENST00000510363 CARD10Q9BWT7 1032 aa22.48■■□□□ 1.19
NHP2-204ENST00000510363 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa22.48■■□□□ 1.19
NHP2-204ENST00000510363 TERF2IPQ9NYB0 399 aa22.47■■□□□ 1.19
NHP2-204ENST00000510363 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa22.47■■□□□ 1.19
NHP2-204ENST00000510363 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa22.47■■□□□ 1.19
NHP2-204ENST00000510363 OVOS2Q6IE36 1432 aa22.47■■□□□ 1.19
NHP2-204ENST00000510363 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
NHP2-204ENST00000510363 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
NHP2-204ENST00000510363 AKAP12Q02952 1782 aa22.45■■□□□ 1.19
NHP2-204ENST00000510363 NME9Q86XW9 330 aa22.45■■□□□ 1.18
NHP2-204ENST00000510363 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
NHP2-204ENST00000510363 SLC24A1O60721 1099 aa22.44■■□□□ 1.18
NHP2-204ENST00000510363 LRP5O75197 1615 aa22.44■■□□□ 1.18
NHP2-204ENST00000510363 USP31Q70CQ4 1352 aa22.44■■□□□ 1.18
NHP2-204ENST00000510363 COL18A1P39060 1754 aa22.43■■□□□ 1.18
NHP2-204ENST00000510363 EXOC5O00471 708 aa22.43■■□□□ 1.18
NHP2-204ENST00000510363 NFAT5O94916 1531 aa22.41■■□□□ 1.18
NHP2-204ENST00000510363 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa22.41■■□□□ 1.18
NHP2-204ENST00000510363 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
NHP2-204ENST00000510363 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
NHP2-204ENST00000510363 CD163L1Q9NR16 1453 aa22.41■■□□□ 1.18
NHP2-204ENST00000510363 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
NHP2-204ENST00000510363 CCDC7Q96M83 1385 aa22.4■■□□□ 1.18
NHP2-204ENST00000510363 PLSCR1O15162 318 aa22.39■■□□□ 1.17
NHP2-204ENST00000510363 MON2Q7Z3U7 1717 aa22.38■■□□□ 1.17
NHP2-204ENST00000510363 NLRP2Q9NX02 1062 aa22.38■■□□□ 1.17
NHP2-204ENST00000510363 A0A1W2PP64 1363 aa22.38■■□□□ 1.17
NHP2-204ENST00000510363 ABCC6O95255 1503 aa22.37■■□□□ 1.17
NHP2-204ENST00000510363 TESK2Q96S53 571 aa22.37■■□□□ 1.17
NHP2-204ENST00000510363 LRRC37A3O60309 1634 aa22.37■■□□□ 1.17
NHP2-204ENST00000510363 NINLQ9Y2I6 1382 aa22.37■■□□□ 1.17
NHP2-204ENST00000510363 ERBB3P21860 1342 aa22.36■■□□□ 1.17
NHP2-204ENST00000510363 BCL9O00512 1426 aa22.34■■□□□ 1.17
NHP2-204ENST00000510363 PTF1AQ7RTS3 328 aa22.34■■□□□ 1.17
NHP2-204ENST00000510363 ANKRD24Q8TF21 1146 aa22.34■■□□□ 1.17
NHP2-204ENST00000510363 PEAK1Q9H792 1746 aa22.34■■□□□ 1.17
NHP2-204ENST00000510363 IL2RBP14784 551 aa22.32■■□□□ 1.16
NHP2-204ENST00000510363 COG3Q96JB2 828 aa22.32■■□□□ 1.16
NHP2-204ENST00000510363 RREB1Q92766 1687 aa22.32■■□□□ 1.16
NHP2-204ENST00000510363 RGPD5Q99666 1765 aa22.3■■□□□ 1.16
NHP2-204ENST00000510363 TMF1P82094 1093 aa22.3■■□□□ 1.16
NHP2-204ENST00000510363 IP6K1Q92551 441 aa22.3■■□□□ 1.16
NHP2-204ENST00000510363 NUP188Q5SRE5 1749 aa22.29■■□□□ 1.16
NHP2-204ENST00000510363 SPON1Q9HCB6 807 aa22.29■■□□□ 1.16
NHP2-204ENST00000510363 TNS2Q63HR2 1409 aa22.29■■□□□ 1.16
NHP2-204ENST00000510363 USP54Q70EL1 1684 aa22.28■■□□□ 1.16
NHP2-204ENST00000510363 PROM2Q8N271 834 aa22.27■■□□□ 1.16
NHP2-204ENST00000510363 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
NHP2-204ENST00000510363 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
NHP2-204ENST00000510363 WNK3Q9BYP7 1800 aa22.27■■□□□ 1.15
NHP2-204ENST00000510363 KCNQ2O43526 872 aa22.26■■□□□ 1.15
NHP2-204ENST00000510363 USP47Q96K76 1375 aa22.25■■□□□ 1.15
NHP2-204ENST00000510363 AMPHP49418 695 aa22.25■■□□□ 1.15
NHP2-204ENST00000510363 TXNRD1Q16881 649 aa22.25■■□□□ 1.15
NHP2-204ENST00000510363 CDCA8Q53HL2 280 aa22.25■■□□□ 1.15
NHP2-204ENST00000510363 ACSBG1Q96GR2 724 aa22.25■■□□□ 1.15
NHP2-204ENST00000510363 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa22.25■■□□□ 1.15
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NHP2-204ENST00000510363 SBF2Q86WG5 1849 aa22.23■■□□□ 1.15
NHP2-204ENST00000510363 MAP3K19Q56UN5 1328 aa22.23■■□□□ 1.15
NHP2-204ENST00000510363 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
NHP2-204ENST00000510363 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa22.22■■□□□ 1.15
NHP2-204ENST00000510363 STK32BQ9NY57 414 aa22.22■■□□□ 1.15
NHP2-204ENST00000510363 LTN1O94822 1766 aa22.22■■□□□ 1.15
NHP2-204ENST00000510363 HOXC9P31274 260 aa22.21■■□□□ 1.15
NHP2-204ENST00000510363 FBLN1P23142 703 aa22.2■■□□□ 1.14
NHP2-204ENST00000510363 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
NHP2-204ENST00000510363 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.2■■□□□ 1.14
NHP2-204ENST00000510363 FYB1O15117 783 aa22.19■■□□□ 1.14
NHP2-204ENST00000510363 SLC15A2Q16348 729 aa22.18■■□□□ 1.14
NHP2-204ENST00000510363 GGNBP2Q9H3C7 697 aa22.18■■□□□ 1.14
NHP2-204ENST00000510363 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
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NHP2-204ENST00000510363 DCAF8L1A6NGE4 600 aa22.15■■□□□ 1.14
NHP2-204ENST00000510363 ZBTB7AO95365 584 aa22.15■■□□□ 1.14
NHP2-204ENST00000510363 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
NHP2-204ENST00000510363 RTL1A6NKG5 1358 aa22.13■■□□□ 1.13
NHP2-204ENST00000510363 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.12■■□□□ 1.13
NHP2-204ENST00000510363 NHSQ6T4R5 1651 aa22.12■■□□□ 1.13
NHP2-204ENST00000510363 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
NHP2-204ENST00000510363 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
NHP2-204ENST00000510363 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
NHP2-204ENST00000510363 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
NHP2-204ENST00000510363 NBPF6Q5VWK0 638 aa22.09■■□□□ 1.13
NHP2-204ENST00000510363 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa22.09■■□□□ 1.13
NHP2-204ENST00000510363 NBPF4Q96M43 638 aa22.09■■□□□ 1.13
NHP2-204ENST00000510363 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
NHP2-204ENST00000510363 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
NHP2-204ENST00000510363 SLC27A3Q5K4L6 730 aa22.08■■□□□ 1.13
NHP2-204ENST00000510363 CARD14Q9BXL6 1004 aa22.08■■□□□ 1.13
NHP2-204ENST00000510363 MTFR1LQ9H019 292 aa22.08■■□□□ 1.13
NHP2-204ENST00000510363 CGNL1Q0VF96 1302 aa22.07■■□□□ 1.12
NHP2-204ENST00000510363 PTGER2P43116 358 aa22.07■■□□□ 1.12
NHP2-204ENST00000510363 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa22.06■■□□□ 1.12
NHP2-204ENST00000510363 USHBP1Q8N6Y0 703 aa22.06■■□□□ 1.12
NHP2-204ENST00000510363 LRRC4BQ9NT99 713 aa22.06■■□□□ 1.12
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