RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 RETREG3Q86VR2 466 aa3.63□□□□□ -1.83
PDE4D-218ENST00000509368 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
PDE4D-218ENST00000509368 TRIM47Q96LD4 638 aa3.63□□□□□ -1.83
PDE4D-218ENST00000509368 ATG7O95352 703 aa3.63□□□□□ -1.83
PDE4D-218ENST00000509368 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
PDE4D-218ENST00000509368 GMPRP36959 345 aa3.63□□□□□ -1.83
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF697Q5TEC3 545 aa3.63□□□□□ -1.83
PDE4D-218ENST00000509368 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP3.63□□□□□ -1.83
PDE4D-218ENST00000509368 ANKLE1Q8NAG6 615 aa3.63□□□□□ -1.83
PDE4D-218ENST00000509368 POM121CA8CG34 1229 aa3.62□□□□□ -1.83
PDE4D-218ENST00000509368 RSPH4AQ5TD94 716 aa3.62□□□□□ -1.83
PDE4D-218ENST00000509368 ST8SIA5O15466 376 aa3.62□□□□□ -1.83
PDE4D-218ENST00000509368 SLC4A3P48751 1232 aa3.62□□□□□ -1.83
PDE4D-218ENST00000509368 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa3.62□□□□□ -1.83
PDE4D-218ENST00000509368 ABL2P42684 1182 aa3.62□□□□□ -1.83
PDE4D-218ENST00000509368 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
PDE4D-218ENST00000509368 CCDC27Q2M243 656 aa3.62□□□□□ -1.83
PDE4D-218ENST00000509368 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa3.62□□□□□ -1.83
PDE4D-218ENST00000509368 OCSTAMPQ9BR26 566 aa3.62□□□□□ -1.83
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PDE4D-218ENST00000509368 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.61□□□□□ -1.83
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PDE4D-218ENST00000509368 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
PDE4D-218ENST00000509368 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP3.61□□□□□ -1.83
PDE4D-218ENST00000509368 GSK3AP49840 483 aa3.61□□□□□ -1.83
PDE4D-218ENST00000509368 GRIPAP1Q4V328 841 aa3.61□□□□□ -1.83
PDE4D-218ENST00000509368 CFAP70Q5T0N1 1121 aa3.61□□□□□ -1.83
PDE4D-218ENST00000509368 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa3.61□□□□□ -1.83
PDE4D-218ENST00000509368 PNMA1Q8ND90 353 aa3.61□□□□□ -1.83
PDE4D-218ENST00000509368 PRR14Q9BWN1 585 aa3.61□□□□□ -1.83
PDE4D-218ENST00000509368 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa3.61□□□□□ -1.83
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PDE4D-218ENST00000509368 ADAM23O75077 832 aa3.6□□□□□ -1.83
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PDE4D-218ENST00000509368 RBM25P49756 843 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
PDE4D-218ENST00000509368 ALG2Q9H553 416 aa3.6□□□□□ -1.83
PDE4D-218ENST00000509368 VRTNQ9H8Y1 702 aa3.6□□□□□ -1.83
PDE4D-218ENST00000509368 NR1I2O75469 434 aa3.6□□□□□ -1.83
PDE4D-218ENST00000509368 ADH1BP00325 375 aa3.6□□□□□ -1.83
PDE4D-218ENST00000509368 LYPD8Q6UX82 237 aa3.6□□□□□ -1.83
PDE4D-218ENST00000509368 MMP16P51512 607 aa3.59□□□□□ -1.83
PDE4D-218ENST00000509368 VAC14Q08AM6 782 aa3.59□□□□□ -1.83
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PDE4D-218ENST00000509368 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF592Q92610 1267 aa3.59□□□□□ -1.83
PDE4D-218ENST00000509368 NUDT12Q9BQG2 462 aa3.59□□□□□ -1.83
PDE4D-218ENST00000509368 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.59□□□□□ -1.83
PDE4D-218ENST00000509368 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.59□□□□□ -1.83
PDE4D-218ENST00000509368 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
PDE4D-218ENST00000509368 MYO15BQ96JP2 1530 aa3.59□□□□□ -1.83
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PDE4D-218ENST00000509368 LCE2CQ5TA81 110 aa3.59□□□□□ -1.84
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PDE4D-218ENST00000509368 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa3.59□□□□□ -1.84
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PDE4D-218ENST00000509368 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
PDE4D-218ENST00000509368 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
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PDE4D-218ENST00000509368 BAP1Q92560 729 aa3.56□□□□□ -1.84
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PDE4D-218ENST00000509368 TSGA10IPQ3SY00 556 aa3.55□□□□□ -1.84
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PDE4D-218ENST00000509368 UCN2Q96RP3 112 aa3.55□□□□□ -1.84
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PDE4D-218ENST00000509368 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-218ENST00000509368 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-218ENST00000509368 KCNH2Q12809 1159 aa3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-218ENST00000509368 SIRT1Q96EB6 747 aa3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-218ENST00000509368 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
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