RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506197.2

SMIM20-201, Transcript of small integral membrane protein 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMIM20, Length 935 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20-201ENST00000506197 A0A0G2JS52 829 aa27.3■■□□□ 1.96
SMIM20-201ENST00000506197 MYT1Q01538 1121 aa27.3■■□□□ 1.96
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SMIM20-201ENST00000506197 CCDC125Q86Z20 511 aa27.3■■□□□ 1.96
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SMIM20-201ENST00000506197 USP19O94966 1318 aa27.29■■□□□ 1.96
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SMIM20-201ENST00000506197 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa27.28■■□□□ 1.96
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SMIM20-201ENST00000506197 AXIN2Q9Y2T1 843 aa26.95■■□□□ 1.9
SMIM20-201ENST00000506197 WDR17Q8IZU2 1322 aa26.94■■□□□ 1.9
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SMIM20-201ENST00000506197 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
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SMIM20-201ENST00000506197 MRS2Q9HD23 443 aa26.91■■□□□ 1.9
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SMIM20-201ENST00000506197 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa26.87■■□□□ 1.89
SMIM20-201ENST00000506197 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
SMIM20-201ENST00000506197 NUDCQ9Y266 331 aa26.86■■□□□ 1.89
SMIM20-201ENST00000506197 SBF2Q86WG5 1849 aa26.86■■□□□ 1.89
SMIM20-201ENST00000506197 APBA3O96018 575 aa26.85■■□□□ 1.89
SMIM20-201ENST00000506197 DDB1Q16531 1140 aa26.85■■□□□ 1.89
SMIM20-201ENST00000506197 CCDC184Q52MB2 194 aa26.85■■□□□ 1.89
SMIM20-201ENST00000506197 CARD10Q9BWT7 1032 aa26.85■■□□□ 1.89
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