RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503638.1

PGGT1B-204, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 579 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-204ENST00000503638 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa18.28■□□□□ 0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 SLIT3O75094 1523 aa18.28■□□□□ 0.52
PGGT1B-204ENST00000503638 MORC1Q86VD1 984 aa18.26■□□□□ 0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 CCDC125Q86Z20 511 aa18.26■□□□□ 0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 UNC5CLQ8IV45 518 aa18.26■□□□□ 0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 FAM83GA6ND36 823 aa18.25■□□□□ 0.51
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PGGT1B-204ENST00000503638 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 NSD2O96028 1365 aa18.25■□□□□ 0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 BTG4Q9NY30 223 aa18.24■□□□□ 0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 SLIT2O94813 1529 aa18.23■□□□□ 0.51
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PGGT1B-204ENST00000503638 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 USP54Q70EL1 1684 aa18.22■□□□□ 0.51
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PGGT1B-204ENST00000503638 FBLN1P23142 703 aa18.22■□□□□ 0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 AMPHP49418 695 aa18.22■□□□□ 0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 EVA1CP58658 441 aa18.22■□□□□ 0.51
PGGT1B-204ENST00000503638 NFAT5O94916 1531 aa18.22■□□□□ 0.51
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PGGT1B-204ENST00000503638 GLI3P10071 1580 aa18.21■□□□□ 0.51
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PGGT1B-204ENST00000503638 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa18.19■□□□□ 0.5
PGGT1B-204ENST00000503638 SEPT12Q8IYM1 358 aa18.19■□□□□ 0.5
PGGT1B-204ENST00000503638 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa18.19■□□□□ 0.5
PGGT1B-204ENST00000503638 MAP3K19Q56UN5 1328 aa18.19■□□□□ 0.5
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PGGT1B-204ENST00000503638 LTN1O94822 1766 aa18.17■□□□□ 0.5
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PGGT1B-204ENST00000503638 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
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PGGT1B-204ENST00000503638 USP35Q9P2H5 1018 aa18.14■□□□□ 0.49
PGGT1B-204ENST00000503638 AXIN2Q9Y2T1 843 aa18.14■□□□□ 0.49
PGGT1B-204ENST00000503638 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa18.14■□□□□ 0.49
PGGT1B-204ENST00000503638 BRWD3Q6RI45 1802 aa18.14■□□□□ 0.49
PGGT1B-204ENST00000503638 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa18.13■□□□□ 0.49
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PGGT1B-204ENST00000503638 MYT1Q01538 1121 aa18.13■□□□□ 0.49
PGGT1B-204ENST00000503638 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa18.13■□□□□ 0.49
PGGT1B-204ENST00000503638 IP6K1Q92551 441 aa18.13■□□□□ 0.49
PGGT1B-204ENST00000503638 ANKRD24Q8TF21 1146 aa18.12■□□□□ 0.49
PGGT1B-204ENST00000503638 RTL1A6NKG5 1358 aa18.12■□□□□ 0.49
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PGGT1B-204ENST00000503638 FLT4P35916 1363 aa18.11■□□□□ 0.49
PGGT1B-204ENST00000503638 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
PGGT1B-204ENST00000503638 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
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PGGT1B-204ENST00000503638 ABCC6O95255 1503 aa18.09■□□□□ 0.49
PGGT1B-204ENST00000503638 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa18.09■□□□□ 0.49
PGGT1B-204ENST00000503638 COL18A1P39060 1754 aa18.09■□□□□ 0.49
PGGT1B-204ENST00000503638 RGPD5Q99666 1765 aa18.09■□□□□ 0.49
PGGT1B-204ENST00000503638 WDR17Q8IZU2 1322 aa18.08■□□□□ 0.49
PGGT1B-204ENST00000503638 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
PGGT1B-204ENST00000503638 KIF24Q5T7B8 1368 aa18.07■□□□□ 0.48
PGGT1B-204ENST00000503638 PEAK1Q9H792 1746 aa18.07■□□□□ 0.48
PGGT1B-204ENST00000503638 ERBB3P21860 1342 aa18.07■□□□□ 0.48
PGGT1B-204ENST00000503638 MTHFSP49914 203 aa18.07■□□□□ 0.48
PGGT1B-204ENST00000503638 CRB1P82279 1406 aa18.06■□□□□ 0.48
PGGT1B-204ENST00000503638 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa18.06■□□□□ 0.48
PGGT1B-204ENST00000503638 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa18.06■□□□□ 0.48
PGGT1B-204ENST00000503638 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
PGGT1B-204ENST00000503638 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
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PGGT1B-204ENST00000503638 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa18.04■□□□□ 0.48
PGGT1B-204ENST00000503638 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
PGGT1B-204ENST00000503638 PPP2R1AP30153 589 aa18.04■□□□□ 0.48
PGGT1B-204ENST00000503638 RALBP1Q15311 655 aa18.04■□□□□ 0.48
PGGT1B-204ENST00000503638 FAM182BQ5T319 152 aa18.04■□□□□ 0.48
PGGT1B-204ENST00000503638 TCP11L2Q8N4U5 519 aa18.04■□□□□ 0.48
PGGT1B-204ENST00000503638 CFAP53Q96M91 514 aa18.04■□□□□ 0.48
PGGT1B-204ENST00000503638 PARD3Q8TEW0 1356 aa18.04■□□□□ 0.48
PGGT1B-204ENST00000503638 ANP32CO43423 234 aa18.02■□□□□ 0.48
PGGT1B-204ENST00000503638 USHBP1Q8N6Y0 703 aa18.02■□□□□ 0.48
PGGT1B-204ENST00000503638 CARD10Q9BWT7 1032 aa18.01■□□□□ 0.47
PGGT1B-204ENST00000503638 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
PGGT1B-204ENST00000503638 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
PGGT1B-204ENST00000503638 BAG6P46379 1132 aa17.99■□□□□ 0.47
PGGT1B-204ENST00000503638 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
PGGT1B-204ENST00000503638 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
PGGT1B-204ENST00000503638 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
PGGT1B-204ENST00000503638 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
PGGT1B-204ENST00000503638 NBPF6Q5VWK0 638 aa17.98■□□□□ 0.47
PGGT1B-204ENST00000503638 NBPF4Q96M43 638 aa17.98■□□□□ 0.47
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