RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502974.1

CXCL3-202, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

TSL 2

Gene CXCL3, Length 630 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-202ENST00000502974 COL18A1P39060 1754 aa34.7■■■■□ 3.15
CXCL3-202ENST00000502974 ARHGEF25Q86VW2 580 aa34.7■■■■□ 3.15
CXCL3-202ENST00000502974 CCDC125Q86Z20 511 aa34.68■■■■□ 3.14
CXCL3-202ENST00000502974 TCP11L2Q8N4U5 519 aa34.66■■■■□ 3.14
CXCL3-202ENST00000502974 CRB1P82279 1406 aa34.65■■■■□ 3.14
CXCL3-202ENST00000502974 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa34.64■■■■□ 3.14
CXCL3-202ENST00000502974 OVOS2Q6IE36 1432 aa34.64■■■■□ 3.14
CXCL3-202ENST00000502974 BARGINQ6ZT62 677 aa34.64■■■■□ 3.14
CXCL3-202ENST00000502974 RGPD5Q99666 1765 aa34.64■■■■□ 3.14
CXCL3-202ENST00000502974 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP34.63■■■■□ 3.13
CXCL3-202ENST00000502974 ABCC6O95255 1503 aa34.62■■■■□ 3.13
CXCL3-202ENST00000502974 AXIN2Q9Y2T1 843 aa34.62■■■■□ 3.13
CXCL3-202ENST00000502974 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP34.62■■■■□ 3.13
CXCL3-202ENST00000502974 LTN1O94822 1766 aa34.61■■■■□ 3.13
CXCL3-202ENST00000502974 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa34.6■■■■□ 3.13
CXCL3-202ENST00000502974 KIF20BQ96Q89 1820 aa34.6■■■■□ 3.13
CXCL3-202ENST00000502974 COG3Q96JB2 828 aa34.59■■■■□ 3.13
CXCL3-202ENST00000502974 WDR17Q8IZU2 1322 aa34.58■■■■□ 3.13
CXCL3-202ENST00000502974 NSD3Q9BZ95 1437 aa34.58■■■■□ 3.13
CXCL3-202ENST00000502974 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP34.58■■■■□ 3.13
CXCL3-202ENST00000502974 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP34.58■■■■□ 3.13
CXCL3-202ENST00000502974 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa34.57■■■■□ 3.12
CXCL3-202ENST00000502974 CARD14Q9BXL6 1004 aa34.57■■■■□ 3.12
CXCL3-202ENST00000502974 FYB1O15117 783 aa34.54■■■■□ 3.12
CXCL3-202ENST00000502974 FAM182BQ5T319 152 aa34.54■■■■□ 3.12
CXCL3-202ENST00000502974 GGNBP2Q9H3C7 697 aa34.54■■■■□ 3.12
CXCL3-202ENST00000502974 PDE3BQ13370 1112 aa34.52■■■■□ 3.12
CXCL3-202ENST00000502974 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP34.52■■■■□ 3.12
CXCL3-202ENST00000502974 WNK3Q9BYP7 1800 aa34.48■■■■□ 3.11
CXCL3-202ENST00000502974 CARD10Q9BWT7 1032 aa34.48■■■■□ 3.11
CXCL3-202ENST00000502974 KIF7Q2M1P5 1343 aa34.48■■■■□ 3.11
CXCL3-202ENST00000502974 RGPD1P0DJD0 1748 aa34.47■■■■□ 3.11
CXCL3-202ENST00000502974 FAM196AQ6ZSG2 479 aa34.46■■■■□ 3.11
CXCL3-202ENST00000502974 PANK3Q9H999 370 aa34.45■■■■□ 3.11
CXCL3-202ENST00000502974 ERBB3P21860 1342 aa34.44■■■■□ 3.1
CXCL3-202ENST00000502974 LRRC37A3O60309 1634 aa34.44■■■■□ 3.1
CXCL3-202ENST00000502974 FBLN1P23142 703 aa34.43■■■■□ 3.1
CXCL3-202ENST00000502974 DEFB132Q7Z7B7 95 aa34.43■■■■□ 3.1
CXCL3-202ENST00000502974 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP34.43■■■■□ 3.1
CXCL3-202ENST00000502974 CGNL1Q0VF96 1302 aa34.43■■■■□ 3.1
CXCL3-202ENST00000502974 CCDC7Q96M83 1385 aa34.42■■■■□ 3.1
CXCL3-202ENST00000502974 ANKRD24Q8TF21 1146 aa34.41■■■■□ 3.1
CXCL3-202ENST00000502974 MAP3K19Q56UN5 1328 aa34.4■■■■□ 3.1
CXCL3-202ENST00000502974 BAG6P46379 1132 aa34.4■■■■□ 3.1
CXCL3-202ENST00000502974 DDB1Q16531 1140 aa34.4■■■■□ 3.1
CXCL3-202ENST00000502974 IP6K1Q92551 441 aa34.4■■■■□ 3.1
CXCL3-202ENST00000502974 NLRP2Q9NX02 1062 aa34.4■■■■□ 3.1
CXCL3-202ENST00000502974 AMPHP49418 695 aa34.37■■■■□ 3.09
CXCL3-202ENST00000502974 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP34.37■■■■□ 3.09
CXCL3-202ENST00000502974 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP34.36■■■■□ 3.09
CXCL3-202ENST00000502974 TRIM37O94972 964 aa34.35■■■■□ 3.09
CXCL3-202ENST00000502974 DISP2A7MBM2 1401 aa34.35■■■■□ 3.09
CXCL3-202ENST00000502974 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa34.35■■■■□ 3.09
CXCL3-202ENST00000502974 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP34.35■■■■□ 3.09
CXCL3-202ENST00000502974 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa34.33■■■■□ 3.09
CXCL3-202ENST00000502974 HOXC9P31274 260 aa34.33■■■■□ 3.09
CXCL3-202ENST00000502974 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP34.33■■■■□ 3.09
CXCL3-202ENST00000502974 RTL1A6NKG5 1358 aa34.33■■■■□ 3.09
CXCL3-202ENST00000502974 WASHC2AQ641Q2 1341 aa34.3■■■■□ 3.08
CXCL3-202ENST00000502974 PEAK1Q9H792 1746 aa34.29■■■■□ 3.08
CXCL3-202ENST00000502974 EXOC5O00471 708 aa34.28■■■■□ 3.08
CXCL3-202ENST00000502974 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP34.27■■■■□ 3.08
CXCL3-202ENST00000502974 KNSTRNQ9Y448 316 aa34.27■■■■□ 3.08
CXCL3-202ENST00000502974 IL2RBP14784 551 aa34.26■■■■□ 3.08
CXCL3-202ENST00000502974 TNS2Q63HR2 1409 aa34.26■■■■□ 3.07
CXCL3-202ENST00000502974 NSD2O96028 1365 aa34.24■■■■□ 3.07
CXCL3-202ENST00000502974 APBA3O96018 575 aa34.24■■■■□ 3.07
CXCL3-202ENST00000502974 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP34.23■■■■□ 3.07
CXCL3-202ENST00000502974 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP34.23■■■■□ 3.07
CXCL3-202ENST00000502974 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP34.22■■■■□ 3.07
CXCL3-202ENST00000502974 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa34.22■■■■□ 3.07
CXCL3-202ENST00000502974 SBF2Q86WG5 1849 aa34.22■■■■□ 3.07
CXCL3-202ENST00000502974 FLT4P35916 1363 aa34.22■■■■□ 3.07
CXCL3-202ENST00000502974 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP34.21■■■■□ 3.07
CXCL3-202ENST00000502974 KIF24Q5T7B8 1368 aa34.21■■■■□ 3.07
CXCL3-202ENST00000502974 RGPD2P0DJD1 1756 aa34.2■■■■□ 3.07
CXCL3-202ENST00000502974 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP34.18■■■■□ 3.06
CXCL3-202ENST00000502974 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa34.18■■■■□ 3.06
CXCL3-202ENST00000502974 INSRP06213 1382 aa34.17■■■■□ 3.06
CXCL3-202ENST00000502974 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP34.17■■■■□ 3.06
CXCL3-202ENST00000502974 BCL9O00512 1426 aa34.16■■■■□ 3.06
CXCL3-202ENST00000502974 PARD3Q8TEW0 1356 aa34.16■■■■□ 3.06
CXCL3-202ENST00000502974 MORC1Q86VD1 984 aa34.15■■■■□ 3.06
CXCL3-202ENST00000502974 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP34.14■■■■□ 3.06
CXCL3-202ENST00000502974 CAMKK2Q96RR4 588 aa34.14■■■■□ 3.06
CXCL3-202ENST00000502974 POLKQ9UBT6 870 aa34.13■■■■□ 3.05
CXCL3-202ENST00000502974 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP34.12■■■■□ 3.05
CXCL3-202ENST00000502974 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP34.11■■■■□ 3.05
CXCL3-202ENST00000502974 NBPF6Q5VWK0 638 aa34.09■■■■□ 3.05
CXCL3-202ENST00000502974 NBPF4Q96M43 638 aa34.09■■■■□ 3.05
CXCL3-202ENST00000502974 RREB1Q92766 1687 aa34.08■■■■□ 3.05
CXCL3-202ENST00000502974 USHBP1Q8N6Y0 703 aa34.06■■■■□ 3.04
CXCL3-202ENST00000502974 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP34.06■■■■□ 3.04
CXCL3-202ENST00000502974 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa34.06■■■■□ 3.04
CXCL3-202ENST00000502974 KAT6BQ8WYB5 2073 aa34.05■■■■□ 3.04
CXCL3-202ENST00000502974 MEGF6O75095 1541 aa34.04■■■■□ 3.04
CXCL3-202ENST00000502974 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP34.04■■■■□ 3.04
CXCL3-202ENST00000502974 NHSQ6T4R5 1651 aa34.03■■■■□ 3.04
CXCL3-202ENST00000502974 PTF1AQ7RTS3 328 aa34.03■■■■□ 3.04
CXCL3-202ENST00000502974 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP34.03■■■■□ 3.04
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