RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497648.1

RABGGTB-214, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,319 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-214ENST00000497648 ZMYND10O75800 440 aa11.27□□□□□ -0.61
RABGGTB-214ENST00000497648 MYBPC2Q14324 1141 aa11.27□□□□□ -0.61
RABGGTB-214ENST00000497648 PRDM4Q9UKN5 801 aa11.27□□□□□ -0.61
RABGGTB-214ENST00000497648 PREX2Q70Z35 1606 aa11.26□□□□□ -0.61
RABGGTB-214ENST00000497648 PACS2Q86VP3 889 aa11.26□□□□□ -0.61
RABGGTB-214ENST00000497648 TEX14Q8IWB6 1497 aa11.25□□□□□ -0.61
RABGGTB-214ENST00000497648 FAM161AQ3B820 660 aa11.25□□□□□ -0.61
RABGGTB-214ENST00000497648 NBPF9Q3BBW0 867 aa11.25□□□□□ -0.61
RABGGTB-214ENST00000497648 SPATA32Q96LK8 384 aa11.25□□□□□ -0.61
RABGGTB-214ENST00000497648 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa11.25□□□□□ -0.61
RABGGTB-214ENST00000497648 SMAPO00193 183 aa11.24□□□□□ -0.61
RABGGTB-214ENST00000497648 GOLIM4O00461 696 aa11.24□□□□□ -0.61
RABGGTB-214ENST00000497648 RALBP1Q15311 655 aa11.24□□□□□ -0.61
RABGGTB-214ENST00000497648 NUDT18Q6ZVK8 323 aa11.24□□□□□ -0.61
RABGGTB-214ENST00000497648 TATDN2Q93075 761 aa11.24□□□□□ -0.61
RABGGTB-214ENST00000497648 SGSM3Q96HU1 749 aa11.24□□□□□ -0.61
RABGGTB-214ENST00000497648 UBA5Q9GZZ9 404 aa11.24□□□□□ -0.61
RABGGTB-214ENST00000497648 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
RABGGTB-214ENST00000497648 ADGRG1Q9Y653 693 aa11.24□□□□□ -0.61
RABGGTB-214ENST00000497648 TAF3Q5VWG9 929 aa11.23□□□□□ -0.61
RABGGTB-214ENST00000497648 BARGINQ6ZT62 677 aa11.23□□□□□ -0.61
RABGGTB-214ENST00000497648 PNMA3Q9UL41 463 aa11.23□□□□□ -0.61
RABGGTB-214ENST00000497648 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
RABGGTB-214ENST00000497648 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP11.22□□□□□ -0.613e-6■■□□□ 14.2
RABGGTB-214ENST00000497648 MKL1Q969V6 931 aa11.22□□□□□ -0.61
RABGGTB-214ENST00000497648 EYA1Q99502 592 aa11.22□□□□□ -0.61
RABGGTB-214ENST00000497648 NBPF3Q9H094 633 aa11.22□□□□□ -0.61
RABGGTB-214ENST00000497648 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa11.22□□□□□ -0.61
RABGGTB-214ENST00000497648 CFAP74Q9C0B2 1584 aa11.22□□□□□ -0.61
RABGGTB-214ENST00000497648 RICTORQ6R327 1708 aa11.22□□□□□ -0.61
RABGGTB-214ENST00000497648 MTUS2Q5JR59 1369 aa11.22□□□□□ -0.61
RABGGTB-214ENST00000497648 FANCAO15360 1455 aa11.21□□□□□ -0.61
RABGGTB-214ENST00000497648 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa11.21□□□□□ -0.61
RABGGTB-214ENST00000497648 NBPF26B4DH59 902 aa11.21□□□□□ -0.61
RABGGTB-214ENST00000497648 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
RABGGTB-214ENST00000497648 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
RABGGTB-214ENST00000497648 MAP2K5Q13163 448 aa11.21□□□□□ -0.61
RABGGTB-214ENST00000497648 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
RABGGTB-214ENST00000497648 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa11.21□□□□□ -0.61
RABGGTB-214ENST00000497648 CCDC82Q8N4S0 544 aa11.21□□□□□ -0.61
RABGGTB-214ENST00000497648 OTUD6BQ8N6M0 293 aa11.21□□□□□ -0.61
RABGGTB-214ENST00000497648 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
RABGGTB-214ENST00000497648 MAP3K1Q13233 1512 aa11.21□□□□□ -0.62
RABGGTB-214ENST00000497648 PLCH2O75038 1416 aa11.2□□□□□ -0.62
RABGGTB-214ENST00000497648 MARCH6O60337 910 aa11.2□□□□□ -0.62
RABGGTB-214ENST00000497648 BRD1O95696 1058 aa11.2□□□□□ -0.62
RABGGTB-214ENST00000497648 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
RABGGTB-214ENST00000497648 LAPTM4BQ86VI4 370 aa11.2□□□□□ -0.62
RABGGTB-214ENST00000497648 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa11.2□□□□□ -0.62
RABGGTB-214ENST00000497648 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
RABGGTB-214ENST00000497648 ARHGAP5Q13017 1502 aa11.2□□□□□ -0.62
RABGGTB-214ENST00000497648 NEO1Q92859 1461 aa11.2□□□□□ -0.62
RABGGTB-214ENST00000497648 WDR78Q5VTH9 848 aa11.19□□□□□ -0.62
RABGGTB-214ENST00000497648 NUB1Q9Y5A7 615 aa11.19□□□□□ -0.62
RABGGTB-214ENST00000497648 ARAP3Q8WWN8 1544 aa11.19□□□□□ -0.62
RABGGTB-214ENST00000497648 NCOA2Q15596 1464 aa11.19□□□□□ -0.62
RABGGTB-214ENST00000497648 ITSN2Q9NZM3 1697 aa11.18□□□□□ -0.62
RABGGTB-214ENST00000497648 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
RABGGTB-214ENST00000497648 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP11.18□□□□□ -0.62
RABGGTB-214ENST00000497648 LIG1P18858 919 aa11.18□□□□□ -0.62
RABGGTB-214ENST00000497648 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
RABGGTB-214ENST00000497648 NME8Q8N427 588 aa11.18□□□□□ -0.62
RABGGTB-214ENST00000497648 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa11.18□□□□□ -0.62
RABGGTB-214ENST00000497648 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
RABGGTB-214ENST00000497648 IRF6O14896 467 aa11.17□□□□□ -0.62
RABGGTB-214ENST00000497648 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
RABGGTB-214ENST00000497648 MMRN1Q13201 1228 aa11.17□□□□□ -0.62
RABGGTB-214ENST00000497648 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP11.17□□□□□ -0.62
RABGGTB-214ENST00000497648 PXYLP1Q8TE99 480 aa11.17□□□□□ -0.62
RABGGTB-214ENST00000497648 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
RABGGTB-214ENST00000497648 PPME1Q9Y570 386 aa11.17□□□□□ -0.62
RABGGTB-214ENST00000497648 AKNAQ7Z591 1439 aa11.17□□□□□ -0.62
RABGGTB-214ENST00000497648 SSR1P43307 286 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
RABGGTB-214ENST00000497648 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
RABGGTB-214ENST00000497648 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
RABGGTB-214ENST00000497648 EGFL6Q8IUX8 553 aa11.16□□□□□ -0.62
RABGGTB-214ENST00000497648 FAM43AQ8N2R8 423 aa11.16□□□□□ -0.62
RABGGTB-214ENST00000497648 CARD10Q9BWT7 1032 aa11.16□□□□□ -0.62
RABGGTB-214ENST00000497648 ABCC1P33527 1531 aa11.16□□□□□ -0.62
RABGGTB-214ENST00000497648 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
RABGGTB-214ENST00000497648 ADGRL1O94910 1474 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGGTB-214ENST00000497648 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
RABGGTB-214ENST00000497648 IL27Q8NEV9 243 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGGTB-214ENST00000497648 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
RABGGTB-214ENST00000497648 TSPAN18Q96SJ8 248 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGGTB-214ENST00000497648 PHOX2BQ99453 314 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGGTB-214ENST00000497648 MTA3Q9BTC8 594 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGGTB-214ENST00000497648 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
RABGGTB-214ENST00000497648 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGGTB-214ENST00000497648 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGGTB-214ENST00000497648 OATP04181 439 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGGTB-214ENST00000497648 CCDC96Q2M329 555 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGGTB-214ENST00000497648 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
RABGGTB-214ENST00000497648 CCDC102AQ96A19 550 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGGTB-214ENST00000497648 YY1AP1Q9H869 796 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGGTB-214ENST00000497648 CCNB3Q8WWL7 1395 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGGTB-214ENST00000497648 SYCP2Q9BX26 1530 aa11.13□□□□□ -0.63
RABGGTB-214ENST00000497648 RAPGEF3O95398 923 aa11.13□□□□□ -0.63
RABGGTB-214ENST00000497648 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
RABGGTB-214ENST00000497648 LONRF3Q496Y0 759 aa11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms