RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 RBM25P49756 843 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-213ENST00000496055 VPS72Q15906 364 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-213ENST00000496055 WAPLQ7Z5K2 1190 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-213ENST00000496055 SEPT12Q8IYM1 358 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM9BQ8IZU0 186 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-213ENST00000496055 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-213ENST00000496055 APPP05067 770 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-213ENST00000496055 PDE3BQ13370 1112 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM132EQ6IEE7 984 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-213ENST00000496055 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-213ENST00000496055 RGS12O14924 1447 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-213ENST00000496055 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-213ENST00000496055 PRAM1Q96QH2 718 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-213ENST00000496055 MTMR7Q9Y216 660 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGGTB-213ENST00000496055 SBNO1A3KN83 1393 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-213ENST00000496055 RAD21O60216 631 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-213ENST00000496055 CDCA8Q53HL2 280 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-213ENST00000496055 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-213ENST00000496055 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-213ENST00000496055 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-213ENST00000496055 ATRNO75882 1429 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-213ENST00000496055 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-213ENST00000496055 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-213ENST00000496055 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-213ENST00000496055 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
RABGGTB-213ENST00000496055 PSEN1P49768 467 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM43AQ8N2R8 423 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGGTB-213ENST00000496055 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
RABGGTB-213ENST00000496055 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
RABGGTB-213ENST00000496055 TNS3Q68CZ2 1445 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGGTB-213ENST00000496055 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGGTB-213ENST00000496055 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
RABGGTB-213ENST00000496055 TRAK1Q9UPV9 953 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGGTB-213ENST00000496055 ANKARQ7Z5J8 1434 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGGTB-213ENST00000496055 PRAG1Q86YV5 1406 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGGTB-213ENST00000496055 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGGTB-213ENST00000496055 CLTCL1P53675 1640 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM196AQ6ZSG2 479 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGGTB-213ENST00000496055 KCTD17Q8N5Z5 321 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGGTB-213ENST00000496055 MYO5BQ9ULV0 1848 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGGTB-213ENST00000496055 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
RABGGTB-213ENST00000496055 CFAP70Q5T0N1 1121 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGGTB-213ENST00000496055 DCAF11Q8TEB1 546 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGGTB-213ENST00000496055 NHSL1Q5SYE7 1610 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGGTB-213ENST00000496055 TMTC2Q8N394 836 aa5.93□□□□□ -1.46
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RABGGTB-213ENST00000496055 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
RABGGTB-213ENST00000496055 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
RABGGTB-213ENST00000496055 NLRP13Q86W25 1043 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGGTB-213ENST00000496055 BTG4Q9NY30 223 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGGTB-213ENST00000496055 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
RABGGTB-213ENST00000496055 STRN4Q9NRL3 753 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGGTB-213ENST00000496055 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGGTB-213ENST00000496055 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
RABGGTB-213ENST00000496055 WASLO00401 505 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
RABGGTB-213ENST00000496055 MYOM2P54296 1465 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGGTB-213ENST00000496055 KIF1AQ12756 1690 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGGTB-213ENST00000496055 SGSM3Q96HU1 749 aa5.91□□□□□ -1.46
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RABGGTB-213ENST00000496055 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa5.9□□□□□ -1.46
RABGGTB-213ENST00000496055 CABLES1Q8TDN4 633 aa5.9□□□□□ -1.46
RABGGTB-213ENST00000496055 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
RABGGTB-213ENST00000496055 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.47
RABGGTB-213ENST00000496055 ABTB2Q8N961 1025 aa5.9□□□□□ -1.47
RABGGTB-213ENST00000496055 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.47
RABGGTB-213ENST00000496055 CCDC61Q9Y6R9 512 aa5.9□□□□□ -1.47
RABGGTB-213ENST00000496055 PARD3Q8TEW0 1356 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGGTB-213ENST00000496055 APBA3O96018 575 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGGTB-213ENST00000496055 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
RABGGTB-213ENST00000496055 PIK3C2GO75747 1445 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGGTB-213ENST00000496055 MPNDQ8N594 471 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGGTB-213ENST00000496055 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
RABGGTB-213ENST00000496055 PXDNQ92626 1479 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGGTB-213ENST00000496055 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
RABGGTB-213ENST00000496055 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
RABGGTB-213ENST00000496055 DEFB132Q7Z7B7 95 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGGTB-213ENST00000496055 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGGTB-213ENST00000496055 EGFL6Q8IUX8 553 aa5.88□□□□□ -1.47
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RABGGTB-213ENST00000496055 WASHC2AQ641Q2 1341 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-213ENST00000496055 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa5.88□□□□□ -1.47
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RABGGTB-213ENST00000496055 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa5.88□□□□□ -1.47
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RABGGTB-213ENST00000496055 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-213ENST00000496055 BCL9LQ86UU0 1499 aa5.88□□□□□ -1.47
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RABGGTB-213ENST00000496055 FAM83GA6ND36 823 aa5.88□□□□□ -1.47
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RABGGTB-213ENST00000496055 CARD10Q9BWT7 1032 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-213ENST00000496055 CDK19Q9BWU1 502 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-213ENST00000496055 SLIT2O94813 1529 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-213ENST00000496055 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-213ENST00000496055 KCNH5Q8NCM2 988 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-213ENST00000496055 NRXN1Q9ULB1 1477 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-213ENST00000496055 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-213ENST00000496055 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-213ENST00000496055 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-213ENST00000496055 IRF6O14896 467 aa5.87□□□□□ -1.47
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