RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495695.1

LAMA5-212, Transcript of laminin subunit alpha 5, humanhuman

TSL 2

Gene LAMA5, Length 780 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5-212ENST00000495695 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa28.6■■■□□ 2.17
LAMA5-212ENST00000495695 BCL9O00512 1426 aa28.6■■■□□ 2.17
LAMA5-212ENST00000495695 QRICH2Q9H0J4 1663 aa28.58■■■□□ 2.17
LAMA5-212ENST00000495695 ARHGEF25Q86VW2 580 aa28.57■■■□□ 2.16
LAMA5-212ENST00000495695 AXIN2Q9Y2T1 843 aa28.57■■■□□ 2.16
LAMA5-212ENST00000495695 CARD10Q9BWT7 1032 aa28.56■■■□□ 2.16
LAMA5-212ENST00000495695 TTC21AQ8NDW8 1320 aa28.55■■■□□ 2.16
LAMA5-212ENST00000495695 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa28.54■■■□□ 2.16
LAMA5-212ENST00000495695 LRRC37A3O60309 1634 aa28.54■■■□□ 2.16
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LAMA5-212ENST00000495695 COL18A1P39060 1754 aa28.53■■■□□ 2.16
LAMA5-212ENST00000495695 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
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LAMA5-212ENST00000495695 PIK3C2AO00443 1686 aa28.51■■■□□ 2.15
LAMA5-212ENST00000495695 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa28.5■■■□□ 2.15
LAMA5-212ENST00000495695 PROM2Q8N271 834 aa28.49■■■□□ 2.15
LAMA5-212ENST00000495695 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa28.48■■■□□ 2.15
LAMA5-212ENST00000495695 CCDC7Q96M83 1385 aa28.48■■■□□ 2.15
LAMA5-212ENST00000495695 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
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LAMA5-212ENST00000495695 STK32BQ9NY57 414 aa28.44■■■□□ 2.14
LAMA5-212ENST00000495695 ABCC6O95255 1503 aa28.43■■■□□ 2.14
LAMA5-212ENST00000495695 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
LAMA5-212ENST00000495695 TXNRD1Q16881 649 aa28.43■■■□□ 2.14
LAMA5-212ENST00000495695 WNK3Q9BYP7 1800 aa28.43■■■□□ 2.14
LAMA5-212ENST00000495695 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
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LAMA5-212ENST00000495695 AKAP12Q02952 1782 aa28.41■■■□□ 2.14
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LAMA5-212ENST00000495695 NFAT5O94916 1531 aa28.38■■■□□ 2.13
LAMA5-212ENST00000495695 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
LAMA5-212ENST00000495695 USP31Q70CQ4 1352 aa28.37■■■□□ 2.13
LAMA5-212ENST00000495695 TNS2Q63HR2 1409 aa28.35■■■□□ 2.13
LAMA5-212ENST00000495695 RGPD5Q99666 1765 aa28.35■■■□□ 2.13
LAMA5-212ENST00000495695 MTFR1LQ9H019 292 aa28.35■■■□□ 2.13
LAMA5-212ENST00000495695 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa28.35■■■□□ 2.13
LAMA5-212ENST00000495695 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
LAMA5-212ENST00000495695 SIN3AQ96ST3 1273 aa28.33■■■□□ 2.13
LAMA5-212ENST00000495695 ERBB3P21860 1342 aa28.32■■■□□ 2.12
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LAMA5-212ENST00000495695 NLRP2Q9NX02 1062 aa28.31■■■□□ 2.12
LAMA5-212ENST00000495695 NEUROD1Q13562 356 aa28.3■■■□□ 2.12
LAMA5-212ENST00000495695 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP28.3■■■□□ 2.12
LAMA5-212ENST00000495695 SYT17Q9BSW7 474 aa28.29■■■□□ 2.12
LAMA5-212ENST00000495695 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
LAMA5-212ENST00000495695 MON2Q7Z3U7 1717 aa28.27■■■□□ 2.12
LAMA5-212ENST00000495695 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
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LAMA5-212ENST00000495695 NHSQ6T4R5 1651 aa28.26■■■□□ 2.11
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LAMA5-212ENST00000495695 NME9Q86XW9 330 aa28.24■■■□□ 2.11
LAMA5-212ENST00000495695 ANKRD24Q8TF21 1146 aa28.24■■■□□ 2.11
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LAMA5-212ENST00000495695 TERF2IPQ9NYB0 399 aa28.24■■■□□ 2.11
LAMA5-212ENST00000495695 TMC1Q8TDI8 760 aa28.23■■■□□ 2.11
LAMA5-212ENST00000495695 ARXQ96QS3 562 aa28.22■■■□□ 2.11
LAMA5-212ENST00000495695 CARD11Q9BXL7 1154 aa28.22■■■□□ 2.11
LAMA5-212ENST00000495695 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
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LAMA5-212ENST00000495695 SLC27A3Q5K4L6 730 aa28.19■■■□□ 2.1
LAMA5-212ENST00000495695 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
LAMA5-212ENST00000495695 SLC16A10Q8TF71 515 aa28.19■■■□□ 2.1
LAMA5-212ENST00000495695 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa28.19■■■□□ 2.1
LAMA5-212ENST00000495695 IP6K1Q92551 441 aa28.17■■■□□ 2.1
LAMA5-212ENST00000495695 LTN1O94822 1766 aa28.15■■■□□ 2.1
LAMA5-212ENST00000495695 SLC24A1O60721 1099 aa28.15■■■□□ 2.1
LAMA5-212ENST00000495695 PAPPAQ13219 1627 aa28.14■■■□□ 2.1
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LAMA5-212ENST00000495695 BTAF1O14981 1849 aa28.12■■■□□ 2.09
LAMA5-212ENST00000495695 ZNF827Q17R98 1081 aa28.11■■■□□ 2.09
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LAMA5-212ENST00000495695 A0A1W2PP64 1363 aa28.1■■■□□ 2.09
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LAMA5-212ENST00000495695 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa28.04■■■□□ 2.08
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LAMA5-212ENST00000495695 AMPHP49418 695 aa28.02■■■□□ 2.08
LAMA5-212ENST00000495695 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
LAMA5-212ENST00000495695 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
LAMA5-212ENST00000495695 HOXC9P31274 260 aa28.01■■■□□ 2.07
LAMA5-212ENST00000495695 TONSLQ96HA7 1378 aa28■■■□□ 2.07
LAMA5-212ENST00000495695 MAP3K19Q56UN5 1328 aa28■■■□□ 2.07
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