RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495423.1

SIMC1-208, Transcript of SUMO interacting motifs containing 1, human

TSL 2

Gene SIMC1, Length 913 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SIMC1-208	ENST00000495423	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		33.32	■■■□□ 2.92
SIMC1-208	ENST00000495423	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		33.31	■■■□□ 2.92
SIMC1-208	ENST00000495423	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		33.3	■■■□□ 2.92
SIMC1-208	ENST00000495423	BCL9	O00512	1426 aa		33.3	■■■□□ 2.92
SIMC1-208	ENST00000495423	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	33.3	■■■□□ 2.92
SIMC1-208	ENST00000495423	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		33.3	■■■□□ 2.92
SIMC1-208	ENST00000495423	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	33.28	■■■□□ 2.92
SIMC1-208	ENST00000495423	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	33.28	■■■□□ 2.92
SIMC1-208	ENST00000495423	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		33.27	■■■□□ 2.92
SIMC1-208	ENST00000495423	YY1	P25490	414 aa		33.26	■■■□□ 2.91
SIMC1-208	ENST00000495423	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	33.26	■■■□□ 2.91
SIMC1-208	ENST00000495423	EVC2	Q86UK5	1308 aa		33.26	■■■□□ 2.91
SIMC1-208	ENST00000495423	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		33.24	■■■□□ 2.91
SIMC1-208	ENST00000495423	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	33.24	■■■□□ 2.91
SIMC1-208	ENST00000495423	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		33.23	■■■□□ 2.91
SIMC1-208	ENST00000495423	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	33.23	■■■□□ 2.91
SIMC1-208	ENST00000495423	NFAT5	O94916	1531 aa		33.22	■■■□□ 2.91
SIMC1-208	ENST00000495423	ABCC6	O95255	1503 aa		33.22	■■■□□ 2.91
SIMC1-208	ENST00000495423	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		33.21	■■■□□ 2.91
SIMC1-208	ENST00000495423	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	33.21	■■■□□ 2.91
SIMC1-208	ENST00000495423	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		33.21	■■■□□ 2.91
SIMC1-208	ENST00000495423	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		33.21	■■■□□ 2.91
SIMC1-208	ENST00000495423	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		33.19	■■■□□ 2.9
SIMC1-208	ENST00000495423	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		33.19	■■■□□ 2.9
SIMC1-208	ENST00000495423	USP54	Q70EL1	1684 aa		33.18	■■■□□ 2.9
SIMC1-208	ENST00000495423	PROM2	Q8N271	834 aa		33.18	■■■□□ 2.9
SIMC1-208	ENST00000495423	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		33.18	■■■□□ 2.9
SIMC1-208	ENST00000495423	MYOM1	P52179	1685 aa		33.17	■■■□□ 2.9
SIMC1-208	ENST00000495423	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		33.16	■■■□□ 2.9
SIMC1-208	ENST00000495423	NHS	Q6T4R5	1651 aa		33.15	■■■□□ 2.9
SIMC1-208	ENST00000495423	CCDC7	Q96M83	1385 aa		33.12	■■■□□ 2.89
SIMC1-208	ENST00000495423	LTN1	O94822	1766 aa		33.12	■■■□□ 2.89
SIMC1-208	ENST00000495423	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	33.12	■■■□□ 2.89
SIMC1-208	ENST00000495423	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		33.11	■■■□□ 2.89
SIMC1-208	ENST00000495423	TNS2	Q63HR2	1409 aa		33.11	■■■□□ 2.89
SIMC1-208	ENST00000495423	EXOC5	O00471	708 aa		33.09	■■■□□ 2.89
SIMC1-208	ENST00000495423	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	33.09	■■■□□ 2.89
SIMC1-208	ENST00000495423	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	33.09	■■■□□ 2.89
SIMC1-208	ENST00000495423	SOX12	O15370	315 aa		33.08	■■■□□ 2.89
SIMC1-208	ENST00000495423	TXNRD1	Q16881	649 aa		33.08	■■■□□ 2.89
SIMC1-208	ENST00000495423	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		33.07	■■■□□ 2.88
SIMC1-208	ENST00000495423	PTGER2	P43116	358 aa		33.06	■■■□□ 2.88
SIMC1-208	ENST00000495423	ZBTB7A	O95365	584 aa		33.05	■■■□□ 2.88
SIMC1-208	ENST00000495423	STK32B	Q9NY57	414 aa		33.05	■■■□□ 2.88
SIMC1-208	ENST00000495423	BTAF1	O14981	1849 aa		33.04	■■■□□ 2.88
SIMC1-208	ENST00000495423	CHD4	Q14839	1912 aa		33.04	■■■□□ 2.88
SIMC1-208	ENST00000495423	SLC15A2	Q16348	729 aa		33.03	■■■□□ 2.88
SIMC1-208	ENST00000495423	USP31	Q70CQ4	1352 aa		33.03	■■■□□ 2.88
SIMC1-208	ENST00000495423	PAPPA	Q13219	1627 aa		33.02	■■■□□ 2.88
SIMC1-208	ENST00000495423	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		33.01	■■■□□ 2.88
SIMC1-208	ENST00000495423	UTRN	P46939	3433 aa		33.01	■■■□□ 2.87
SIMC1-208	ENST00000495423	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		32.99	■■■□□ 2.87
SIMC1-208	ENST00000495423	ERBB3	P21860	1342 aa		32.99	■■■□□ 2.87
SIMC1-208	ENST00000495423	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		32.99	■■■□□ 2.87
SIMC1-208	ENST00000495423	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	32.98	■■■□□ 2.87
SIMC1-208	ENST00000495423	MTFR1L	Q9H019	292 aa		32.95	■■■□□ 2.87
SIMC1-208	ENST00000495423	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		32.94	■■■□□ 2.86
SIMC1-208	ENST00000495423	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		32.93	■■■□□ 2.86
SIMC1-208	ENST00000495423	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	32.92	■■■□□ 2.86
SIMC1-208	ENST00000495423	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	32.92	■■■□□ 2.86
SIMC1-208	ENST00000495423	SYT17	Q9BSW7	474 aa		32.92	■■■□□ 2.86
SIMC1-208	ENST00000495423	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		32.91	■■■□□ 2.86
SIMC1-208	ENST00000495423	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	32.91	■■■□□ 2.86
SIMC1-208	ENST00000495423	IL2RB	P14784	551 aa		32.9	■■■□□ 2.86
SIMC1-208	ENST00000495423	NME9	Q86XW9	330 aa		32.9	■■■□□ 2.86
SIMC1-208	ENST00000495423	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		32.9	■■■□□ 2.86
SIMC1-208	ENST00000495423	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		32.89	■■■□□ 2.86
SIMC1-208	ENST00000495423	NEUROD1	Q13562	356 aa		32.88	■■■□□ 2.85
SIMC1-208	ENST00000495423	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		32.87	■■■□□ 2.85
SIMC1-208	ENST00000495423	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	32.86	■■■□□ 2.85
SIMC1-208	ENST00000495423	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		32.85	■■■□□ 2.85
SIMC1-208	ENST00000495423	MAP3K5	Q99683	1374 aa		32.84	■■■□□ 2.85
SIMC1-208	ENST00000495423	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	32.82	■■■□□ 2.84
SIMC1-208	ENST00000495423	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	32.82	■■■□□ 2.84
SIMC1-208	ENST00000495423	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		32.81	■■■□□ 2.84
SIMC1-208	ENST00000495423	TMC1	Q8TDI8	760 aa		32.8	■■■□□ 2.84
SIMC1-208	ENST00000495423	ARX	Q96QS3	562 aa		32.8	■■■□□ 2.84
SIMC1-208	ENST00000495423	ZNF827	Q17R98	1081 aa		32.79	■■■□□ 2.84
SIMC1-208	ENST00000495423	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		32.79	■■■□□ 2.84
SIMC1-208	ENST00000495423	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		32.78	■■■□□ 2.84
SIMC1-208	ENST00000495423	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		32.78	■■■□□ 2.84
SIMC1-208	ENST00000495423		A0A1W2PP64	1363 aa		32.78	■■■□□ 2.84
SIMC1-208	ENST00000495423	LY75	O60449	1722 aa		32.77	■■■□□ 2.84
SIMC1-208	ENST00000495423	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		32.77	■■■□□ 2.84
SIMC1-208	ENST00000495423	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		32.76	■■■□□ 2.84
SIMC1-208	ENST00000495423	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		32.76	■■■□□ 2.83
SIMC1-208	ENST00000495423	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	32.75	■■■□□ 2.83
SIMC1-208	ENST00000495423	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		32.75	■■■□□ 2.83
SIMC1-208	ENST00000495423	IP6K1	Q92551	441 aa		32.74	■■■□□ 2.83
SIMC1-208	ENST00000495423	AKT1S1	Q96B36	256 aa		32.73	■■■□□ 2.83
SIMC1-208	ENST00000495423	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		32.72	■■■□□ 2.83
SIMC1-208	ENST00000495423	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		32.71	■■■□□ 2.83
SIMC1-208	ENST00000495423	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	32.67	■■■□□ 2.82
SIMC1-208	ENST00000495423	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	32.66	■■■□□ 2.82
SIMC1-208	ENST00000495423	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		32.65	■■■□□ 2.82
SIMC1-208	ENST00000495423	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		32.64	■■■□□ 2.82
SIMC1-208	ENST00000495423	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	32.63	■■■□□ 2.81
SIMC1-208	ENST00000495423	NSD2	O96028	1365 aa		32.62	■■■□□ 2.81
SIMC1-208	ENST00000495423	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		32.61	■■■□□ 2.81
SIMC1-208	ENST00000495423	POLD1	P28340	1107 aa		32.6	■■■□□ 2.81

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