RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495022.5

TRDMT1-211, Transcript of tRNA aspartic acid methyltransferase 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRDMT1, Length 1,374 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1-211ENST00000495022 KCNH5Q8NCM2 988 aa32.18■■■□□ 2.74
TRDMT1-211ENST00000495022 USP54Q70EL1 1684 aa32.15■■■□□ 2.74
TRDMT1-211ENST00000495022 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa32.15■■■□□ 2.74
TRDMT1-211ENST00000495022 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa32.15■■■□□ 2.74
TRDMT1-211ENST00000495022 OVOS2Q6IE36 1432 aa32.15■■■□□ 2.74
TRDMT1-211ENST00000495022 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP32.15■■■□□ 2.74
TRDMT1-211ENST00000495022 WDR17Q8IZU2 1322 aa32.15■■■□□ 2.74
TRDMT1-211ENST00000495022 ARHGEF25Q86VW2 580 aa32.15■■■□□ 2.74
TRDMT1-211ENST00000495022 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP32.14■■■□□ 2.74
TRDMT1-211ENST00000495022 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa32.14■■■□□ 2.74
TRDMT1-211ENST00000495022 NFAT5O94916 1531 aa32.14■■■□□ 2.74
TRDMT1-211ENST00000495022 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa32.14■■■□□ 2.74
TRDMT1-211ENST00000495022 AXIN2Q9Y2T1 843 aa32.13■■■□□ 2.73
TRDMT1-211ENST00000495022 ABCC6O95255 1503 aa32.13■■■□□ 2.73
TRDMT1-211ENST00000495022 CARD11Q9BXL7 1154 aa32.1■■■□□ 2.73
TRDMT1-211ENST00000495022 DDB1Q16531 1140 aa32.08■■■□□ 2.73
TRDMT1-211ENST00000495022 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP32.08■■■□□ 2.73
TRDMT1-211ENST00000495022 CD163L1Q9NR16 1453 aa32.06■■■□□ 2.72
TRDMT1-211ENST00000495022 TONSLQ96HA7 1378 aa32.05■■■□□ 2.72
TRDMT1-211ENST00000495022 LTN1O94822 1766 aa32.05■■■□□ 2.72
TRDMT1-211ENST00000495022 SOX12O15370 315 aa32.05■■■□□ 2.72
TRDMT1-211ENST00000495022 USP31Q70CQ4 1352 aa32.05■■■□□ 2.72
TRDMT1-211ENST00000495022 CARD10Q9BWT7 1032 aa32.04■■■□□ 2.72
TRDMT1-211ENST00000495022 NBPF14Q5TI25 921 aa32.03■■■□□ 2.72
TRDMT1-211ENST00000495022 BCL9O00512 1426 aa32.03■■■□□ 2.72
TRDMT1-211ENST00000495022 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa32.01■■■□□ 2.71
TRDMT1-211ENST00000495022 CCDC7Q96M83 1385 aa31.99■■■□□ 2.71
TRDMT1-211ENST00000495022 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP31.99■■■□□ 2.71
TRDMT1-211ENST00000495022 PLSCR1O15162 318 aa31.98■■■□□ 2.71
TRDMT1-211ENST00000495022 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP31.98■■■□□ 2.71
TRDMT1-211ENST00000495022 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP31.97■■■□□ 2.71
TRDMT1-211ENST00000495022 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP31.97■■■□□ 2.71
TRDMT1-211ENST00000495022 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP31.96■■■□□ 2.71
TRDMT1-211ENST00000495022 TMC1Q8TDI8 760 aa31.96■■■□□ 2.71
TRDMT1-211ENST00000495022 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP31.96■■■□□ 2.71
TRDMT1-211ENST00000495022 NME9Q86XW9 330 aa31.94■■■□□ 2.7
TRDMT1-211ENST00000495022 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa31.94■■■□□ 2.7
TRDMT1-211ENST00000495022 TERF2IPQ9NYB0 399 aa31.93■■■□□ 2.7
TRDMT1-211ENST00000495022 TNS2Q63HR2 1409 aa31.92■■■□□ 2.7
TRDMT1-211ENST00000495022 A0A1W2PP64 1363 aa31.91■■■□□ 2.7
TRDMT1-211ENST00000495022 ERBB3P21860 1342 aa31.91■■■□□ 2.7
TRDMT1-211ENST00000495022 EXOC5O00471 708 aa31.91■■■□□ 2.7
TRDMT1-211ENST00000495022 KAT6BQ8WYB5 2073 aa31.89■■■□□ 2.7
TRDMT1-211ENST00000495022 NINLQ9Y2I6 1382 aa31.88■■■□□ 2.69
TRDMT1-211ENST00000495022 PTF1AQ7RTS3 328 aa31.88■■■□□ 2.69
TRDMT1-211ENST00000495022 NHSQ6T4R5 1651 aa31.86■■■□□ 2.69
TRDMT1-211ENST00000495022 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP31.85■■■□□ 2.69
TRDMT1-211ENST00000495022 TESK2Q96S53 571 aa31.85■■■□□ 2.69
TRDMT1-211ENST00000495022 CASZ1Q86V15 1759 aa31.85■■■□□ 2.69
TRDMT1-211ENST00000495022 SLC24A1O60721 1099 aa31.84■■■□□ 2.69
TRDMT1-211ENST00000495022 SPON1Q9HCB6 807 aa31.82■■■□□ 2.69
TRDMT1-211ENST00000495022 NLRP2Q9NX02 1062 aa31.82■■■□□ 2.69
TRDMT1-211ENST00000495022 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa31.81■■■□□ 2.68
TRDMT1-211ENST00000495022 PROM2Q8N271 834 aa31.81■■■□□ 2.68
TRDMT1-211ENST00000495022 ANKRD24Q8TF21 1146 aa31.81■■■□□ 2.68
TRDMT1-211ENST00000495022 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP31.81■■■□□ 2.68
TRDMT1-211ENST00000495022 KCNQ2O43526 872 aa31.8■■■□□ 2.68
TRDMT1-211ENST00000495022 IL2RBP14784 551 aa31.79■■■□□ 2.68
TRDMT1-211ENST00000495022 BTAF1O14981 1849 aa31.76■■■□□ 2.67
TRDMT1-211ENST00000495022 TXNRD1Q16881 649 aa31.75■■■□□ 2.67
TRDMT1-211ENST00000495022 IP6K1Q92551 441 aa31.75■■■□□ 2.67
TRDMT1-211ENST00000495022 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP31.73■■■□□ 2.67
TRDMT1-211ENST00000495022 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP31.72■■■□□ 2.67
TRDMT1-211ENST00000495022 COG3Q96JB2 828 aa31.71■■■□□ 2.67
TRDMT1-211ENST00000495022 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa31.71■■■□□ 2.67
TRDMT1-211ENST00000495022 RGPD2P0DJD1 1756 aa31.69■■■□□ 2.66
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TRDMT1-211ENST00000495022 ACSBG1Q96GR2 724 aa31.68■■■□□ 2.66
TRDMT1-211ENST00000495022 PAPPAQ13219 1627 aa31.66■■■□□ 2.66
TRDMT1-211ENST00000495022 USP47Q96K76 1375 aa31.66■■■□□ 2.66
TRDMT1-211ENST00000495022 SLC15A2Q16348 729 aa31.66■■■□□ 2.66
TRDMT1-211ENST00000495022 MAP3K19Q56UN5 1328 aa31.65■■■□□ 2.66
TRDMT1-211ENST00000495022 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP31.65■■■□□ 2.66
TRDMT1-211ENST00000495022 TMF1P82094 1093 aa31.64■■■□□ 2.66
TRDMT1-211ENST00000495022 KIF20BQ96Q89 1820 aa31.63■■■□□ 2.65
TRDMT1-211ENST00000495022 HOXC9P31274 260 aa31.63■■■□□ 2.65
TRDMT1-211ENST00000495022 MYOM1P52179 1685 aa31.62■■■□□ 2.65
TRDMT1-211ENST00000495022 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP31.62■■■□□ 2.65
TRDMT1-211ENST00000495022 SHANK3Q9BYB0 1731 aa31.62■■■□□ 2.65
TRDMT1-211ENST00000495022 RTL1A6NKG5 1358 aa31.62■■■□□ 2.65
TRDMT1-211ENST00000495022 AMPHP49418 695 aa31.6■■■□□ 2.65
TRDMT1-211ENST00000495022 ZBTB7AO95365 584 aa31.59■■■□□ 2.65
TRDMT1-211ENST00000495022 DOT1LQ8TEK3 1739 aa31.58■■■□□ 2.65
TRDMT1-211ENST00000495022 FBLN1P23142 703 aa31.56■■■□□ 2.64
TRDMT1-211ENST00000495022 PTGER2P43116 358 aa31.56■■■□□ 2.64
TRDMT1-211ENST00000495022 QSER1Q2KHR3 1735 aa31.56■■■□□ 2.64
TRDMT1-211ENST00000495022 FYB1O15117 783 aa31.56■■■□□ 2.64
TRDMT1-211ENST00000495022 CDCA8Q53HL2 280 aa31.56■■■□□ 2.64
TRDMT1-211ENST00000495022 DCAF8L1A6NGE4 600 aa31.55■■■□□ 2.64
TRDMT1-211ENST00000495022 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP31.55■■■□□ 2.64
TRDMT1-211ENST00000495022 MTFR1LQ9H019 292 aa31.53■■■□□ 2.64
TRDMT1-211ENST00000495022 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP31.53■■■□□ 2.64
TRDMT1-211ENST00000495022 GGNBP2Q9H3C7 697 aa31.52■■■□□ 2.64
TRDMT1-211ENST00000495022 MEGF6O75095 1541 aa31.51■■■□□ 2.64
TRDMT1-211ENST00000495022 LY75O60449 1722 aa31.51■■■□□ 2.64
TRDMT1-211ENST00000495022 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP31.51■■■□□ 2.63
TRDMT1-211ENST00000495022 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP31.49■■■□□ 2.63
TRDMT1-211ENST00000495022 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP31.49■■■□□ 2.63
TRDMT1-211ENST00000495022 LRRC4BQ9NT99 713 aa31.49■■■□□ 2.63
TRDMT1-211ENST00000495022 YY1P25490 414 aa31.48■■■□□ 2.63
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