RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494420.1

HOXB-AS3-215, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 2

Gene HOXB-AS3, Length 431 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TMF1P82094 1093 aa27.06■■□□□ 1.92
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 USP31Q70CQ4 1352 aa27.06■■□□□ 1.92
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa27.05■■□□□ 1.92
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 WDR17Q8IZU2 1322 aa27.03■■□□□ 1.92
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NINLQ9Y2I6 1382 aa27.03■■□□□ 1.92
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TRIM37O94972 964 aa27.02■■□□□ 1.92
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 OVOS2Q6IE36 1432 aa26.9■■□□□ 1.9
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LTN1O94822 1766 aa26.82■■□□□ 1.88
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 POLR3GLQ9BT43 218 aa26.81■■□□□ 1.88
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MAP3K19Q56UN5 1328 aa26.81■■□□□ 1.88
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 PTF1AQ7RTS3 328 aa26.74■■□□□ 1.87
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NBPF14Q5TI25 921 aa26.73■■□□□ 1.87
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PLSCR1O15162 318 aa26.72■■□□□ 1.87
HOXB-AS3-215ENST00000494420 BCL9O00512 1426 aa26.72■■□□□ 1.87
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TNS2Q63HR2 1409 aa26.72■■□□□ 1.87
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NSD3Q9BZ95 1437 aa26.72■■□□□ 1.87
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RTL1A6NKG5 1358 aa26.68■■□□□ 1.86
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 SBF2Q86WG5 1849 aa26.67■■□□□ 1.86
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MYOM1P52179 1685 aa26.66■■□□□ 1.86
HOXB-AS3-215ENST00000494420 KCNQ2O43526 872 aa26.66■■□□□ 1.86
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 NBPF4Q96M43 638 aa26.63■■□□□ 1.85
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 INSRP06213 1382 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FLT4P35916 1363 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXB-AS3-215ENST00000494420 USHBP1Q8N6Y0 703 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PANK3Q9H999 370 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXB-AS3-215ENST00000494420 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NUP188Q5SRE5 1749 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
HOXB-AS3-215ENST00000494420 KIF24Q5T7B8 1368 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TXNRD1Q16881 649 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LRP5O75197 1615 aa26.54■■□□□ 1.84
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RGPD2P0DJD1 1756 aa26.54■■□□□ 1.84
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TATP17735 454 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa26.53■■□□□ 1.84
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