RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493601.5

PTPRU-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRU, Length 695 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-208ENST00000493601 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
PTPRU-208ENST00000493601 PEAK1Q9H792 1746 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRU-208ENST00000493601 APBA3O96018 575 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRU-208ENST00000493601 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRU-208ENST00000493601 CAMKK2Q96RR4 588 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRU-208ENST00000493601 WDR17Q8IZU2 1322 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPRU-208ENST00000493601 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPRU-208ENST00000493601 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPRU-208ENST00000493601 OVOS2Q6IE36 1432 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPRU-208ENST00000493601 ARHGEF25Q86VW2 580 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPRU-208ENST00000493601 NUP188Q5SRE5 1749 aa23.59■■□□□ 1.37
PTPRU-208ENST00000493601 CD163L1Q9NR16 1453 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRU-208ENST00000493601 SOX12O15370 315 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRU-208ENST00000493601 AXIN2Q9Y2T1 843 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRU-208ENST00000493601 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
PTPRU-208ENST00000493601 SBF2Q86WG5 1849 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRU-208ENST00000493601 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
PTPRU-208ENST00000493601 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRU-208ENST00000493601 USP31Q70CQ4 1352 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRU-208ENST00000493601 DDB1Q16531 1140 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRU-208ENST00000493601 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
PTPRU-208ENST00000493601 LTN1O94822 1766 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRU-208ENST00000493601 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
PTPRU-208ENST00000493601 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRU-208ENST00000493601 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
PTPRU-208ENST00000493601 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP23.53■■□□□ 1.36
PTPRU-208ENST00000493601 TMC1Q8TDI8 760 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRU-208ENST00000493601 CARD10Q9BWT7 1032 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPRU-208ENST00000493601 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
PTPRU-208ENST00000493601 TERF2IPQ9NYB0 399 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRU-208ENST00000493601 CCDC7Q96M83 1385 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPRU-208ENST00000493601 NME9Q86XW9 330 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRU-208ENST00000493601 A0A1W2PP64 1363 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRU-208ENST00000493601 NINLQ9Y2I6 1382 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRU-208ENST00000493601 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
PTPRU-208ENST00000493601 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRU-208ENST00000493601 BCL9O00512 1426 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRU-208ENST00000493601 NBPF14Q5TI25 921 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRU-208ENST00000493601 TNS2Q63HR2 1409 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRU-208ENST00000493601 SLC24A1O60721 1099 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRU-208ENST00000493601 ERBB3P21860 1342 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRU-208ENST00000493601 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
PTPRU-208ENST00000493601 TESK2Q96S53 571 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRU-208ENST00000493601 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
PTPRU-208ENST00000493601 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRU-208ENST00000493601 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
PTPRU-208ENST00000493601 PLSCR1O15162 318 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRU-208ENST00000493601 EXOC5O00471 708 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRU-208ENST00000493601 NLRP2Q9NX02 1062 aa23.39■■□□□ 1.33
PTPRU-208ENST00000493601 NHSQ6T4R5 1651 aa23.38■■□□□ 1.33
PTPRU-208ENST00000493601 ANKRD24Q8TF21 1146 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRU-208ENST00000493601 USP47Q96K76 1375 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRU-208ENST00000493601 PTF1AQ7RTS3 328 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRU-208ENST00000493601 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRU-208ENST00000493601 IL2RBP14784 551 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRU-208ENST00000493601 COG3Q96JB2 828 aa23.33■■□□□ 1.33
PTPRU-208ENST00000493601 TMF1P82094 1093 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRU-208ENST00000493601 CASZ1Q86V15 1759 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRU-208ENST00000493601 IP6K1Q92551 441 aa23.31■■□□□ 1.32
PTPRU-208ENST00000493601 SPON1Q9HCB6 807 aa23.3■■□□□ 1.32
PTPRU-208ENST00000493601 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
PTPRU-208ENST00000493601 KIF20BQ96Q89 1820 aa23.29■■□□□ 1.32
PTPRU-208ENST00000493601 BTAF1O14981 1849 aa23.28■■□□□ 1.32
PTPRU-208ENST00000493601 KCNQ2O43526 872 aa23.27■■□□□ 1.32
PTPRU-208ENST00000493601 TXNRD1Q16881 649 aa23.27■■□□□ 1.32
PTPRU-208ENST00000493601 PROM2Q8N271 834 aa23.27■■□□□ 1.32
PTPRU-208ENST00000493601 MAP3K19Q56UN5 1328 aa23.27■■□□□ 1.32
PTPRU-208ENST00000493601 RTL1A6NKG5 1358 aa23.27■■□□□ 1.31
PTPRU-208ENST00000493601 CDCA8Q53HL2 280 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRU-208ENST00000493601 HOXC9P31274 260 aa23.25■■□□□ 1.31
PTPRU-208ENST00000493601 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
PTPRU-208ENST00000493601 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
PTPRU-208ENST00000493601 AMPHP49418 695 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRU-208ENST00000493601 ACSBG1Q96GR2 724 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRU-208ENST00000493601 MYOM1P52179 1685 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRU-208ENST00000493601 RGPD2P0DJD1 1756 aa23.24■■□□□ 1.31
PTPRU-208ENST00000493601 STK32BQ9NY57 414 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRU-208ENST00000493601 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.22■■□□□ 1.31
PTPRU-208ENST00000493601 PAPPAQ13219 1627 aa23.22■■□□□ 1.31
PTPRU-208ENST00000493601 KAT6BQ8WYB5 2073 aa23.21■■□□□ 1.31
PTPRU-208ENST00000493601 SHANK3Q9BYB0 1731 aa23.2■■□□□ 1.3
PTPRU-208ENST00000493601 CLSPNQ9HAW4 1339 aa23.2■■□□□ 1.3
PTPRU-208ENST00000493601 FYB1O15117 783 aa23.2■■□□□ 1.3
PTPRU-208ENST00000493601 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
PTPRU-208ENST00000493601 GGNBP2Q9H3C7 697 aa23.19■■□□□ 1.3
PTPRU-208ENST00000493601 DOT1LQ8TEK3 1739 aa23.19■■□□□ 1.3
PTPRU-208ENST00000493601 FBLN1P23142 703 aa23.18■■□□□ 1.3
PTPRU-208ENST00000493601 SLC15A2Q16348 729 aa23.18■■□□□ 1.3
PTPRU-208ENST00000493601 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
PTPRU-208ENST00000493601 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
PTPRU-208ENST00000493601 MEGF6O75095 1541 aa23.17■■□□□ 1.3
PTPRU-208ENST00000493601 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
PTPRU-208ENST00000493601 ZBTB7AO95365 584 aa23.14■■□□□ 1.29
PTPRU-208ENST00000493601 KIF24Q5T7B8 1368 aa23.14■■□□□ 1.29
PTPRU-208ENST00000493601 NSD3Q9BZ95 1437 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRU-208ENST00000493601 FLT4P35916 1363 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRU-208ENST00000493601 CGNL1Q0VF96 1302 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRU-208ENST00000493601 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
PTPRU-208ENST00000493601 INSRP06213 1382 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRU-208ENST00000493601 QSER1Q2KHR3 1735 aa23.11■■□□□ 1.29
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