RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493436.5

SH3BP4-211, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 481 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-211ENST00000493436 NFAT5O94916 1531 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3BP4-211ENST00000493436 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
SH3BP4-211ENST00000493436 CRB1P82279 1406 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3BP4-211ENST00000493436 FAM182BQ5T319 152 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3BP4-211ENST00000493436 AXIN2Q9Y2T1 843 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3BP4-211ENST00000493436 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
SH3BP4-211ENST00000493436 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP4-211ENST00000493436 DEFB132Q7Z7B7 95 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP4-211ENST00000493436 LTN1O94822 1766 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP4-211ENST00000493436 CDCA8Q53HL2 280 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP4-211ENST00000493436 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP4-211ENST00000493436 WDR17Q8IZU2 1322 aa23.39■■□□□ 1.34
SH3BP4-211ENST00000493436 PDE3BQ13370 1112 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP4-211ENST00000493436 RGPD1P0DJD0 1748 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP4-211ENST00000493436 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
SH3BP4-211ENST00000493436 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP4-211ENST00000493436 OVOS2Q6IE36 1432 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP4-211ENST00000493436 ABCC6O95255 1503 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP4-211ENST00000493436 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP4-211ENST00000493436 FAM196AQ6ZSG2 479 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP4-211ENST00000493436 BAG6P46379 1132 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP4-211ENST00000493436 WNK3Q9BYP7 1800 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP4-211ENST00000493436 COG3Q96JB2 828 aa23.33■■□□□ 1.33
SH3BP4-211ENST00000493436 CARD10Q9BWT7 1032 aa23.33■■□□□ 1.33
SH3BP4-211ENST00000493436 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.32
SH3BP4-211ENST00000493436 MYOM1P52179 1685 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP4-211ENST00000493436 LRRC37A3O60309 1634 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP4-211ENST00000493436 TRIM37O94972 964 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP4-211ENST00000493436 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP23.29■■□□□ 1.32
SH3BP4-211ENST00000493436 DDB1Q16531 1140 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP4-211ENST00000493436 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
SH3BP4-211ENST00000493436 ERBB3P21860 1342 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP4-211ENST00000493436 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
SH3BP4-211ENST00000493436 KIF20BQ96Q89 1820 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP4-211ENST00000493436 CCDC7Q96M83 1385 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP4-211ENST00000493436 FYB1O15117 783 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP4-211ENST00000493436 ANKRD24Q8TF21 1146 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP4-211ENST00000493436 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
SH3BP4-211ENST00000493436 GGNBP2Q9H3C7 697 aa23.26■■□□□ 1.31
SH3BP4-211ENST00000493436 NLRP2Q9NX02 1062 aa23.26■■□□□ 1.31
SH3BP4-211ENST00000493436 DISP2A7MBM2 1401 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP4-211ENST00000493436 FBLN1P23142 703 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP4-211ENST00000493436 IP6K1Q92551 441 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP4-211ENST00000493436 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP4-211ENST00000493436 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
SH3BP4-211ENST00000493436 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.24■■□□□ 1.31
SH3BP4-211ENST00000493436 MAP3K19Q56UN5 1328 aa23.24■■□□□ 1.31
SH3BP4-211ENST00000493436 PEAK1Q9H792 1746 aa23.24■■□□□ 1.31
SH3BP4-211ENST00000493436 SBF2Q86WG5 1849 aa23.24■■□□□ 1.31
SH3BP4-211ENST00000493436 APBA3O96018 575 aa23.23■■□□□ 1.31
SH3BP4-211ENST00000493436 CARD14Q9BXL6 1004 aa23.23■■□□□ 1.31
SH3BP4-211ENST00000493436 AMPHP49418 695 aa23.22■■□□□ 1.31
SH3BP4-211ENST00000493436 EXOC5O00471 708 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP4-211ENST00000493436 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
SH3BP4-211ENST00000493436 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
SH3BP4-211ENST00000493436 NSD3Q9BZ95 1437 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP4-211ENST00000493436 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
SH3BP4-211ENST00000493436 HOXC9P31274 260 aa23.2■■□□□ 1.3
SH3BP4-211ENST00000493436 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
SH3BP4-211ENST00000493436 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
SH3BP4-211ENST00000493436 CAMKK2Q96RR4 588 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BP4-211ENST00000493436 IL2RBP14784 551 aa23.17■■□□□ 1.3
SH3BP4-211ENST00000493436 RGPD2P0DJD1 1756 aa23.17■■□□□ 1.3
SH3BP4-211ENST00000493436 TNS2Q63HR2 1409 aa23.16■■□□□ 1.3
SH3BP4-211ENST00000493436 RTL1A6NKG5 1358 aa23.16■■□□□ 1.3
SH3BP4-211ENST00000493436 KAT6BQ8WYB5 2073 aa23.16■■□□□ 1.3
SH3BP4-211ENST00000493436 PARD3Q8TEW0 1356 aa23.15■■□□□ 1.3
SH3BP4-211ENST00000493436 BCL9O00512 1426 aa23.14■■□□□ 1.29
SH3BP4-211ENST00000493436 RREB1Q92766 1687 aa23.13■■□□□ 1.29
SH3BP4-211ENST00000493436 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
SH3BP4-211ENST00000493436 CGNL1Q0VF96 1302 aa23.12■■□□□ 1.29
SH3BP4-211ENST00000493436 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
SH3BP4-211ENST00000493436 PTF1AQ7RTS3 328 aa23.1■■□□□ 1.29
SH3BP4-211ENST00000493436 NUP188Q5SRE5 1749 aa23.1■■□□□ 1.29
SH3BP4-211ENST00000493436 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
SH3BP4-211ENST00000493436 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
SH3BP4-211ENST00000493436 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
SH3BP4-211ENST00000493436 PANK3Q9H999 370 aa23.08■■□□□ 1.29
SH3BP4-211ENST00000493436 FLT4P35916 1363 aa23.08■■□□□ 1.29
SH3BP4-211ENST00000493436 KIF24Q5T7B8 1368 aa23.08■■□□□ 1.29
SH3BP4-211ENST00000493436 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
SH3BP4-211ENST00000493436 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa23.08■■□□□ 1.29
SH3BP4-211ENST00000493436 INSRP06213 1382 aa23.07■■□□□ 1.28
SH3BP4-211ENST00000493436 PLSCR1O15162 318 aa23.07■■□□□ 1.28
SH3BP4-211ENST00000493436 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa23.07■■□□□ 1.28
SH3BP4-211ENST00000493436 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa23.07■■□□□ 1.28
SH3BP4-211ENST00000493436 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa23.07■■□□□ 1.28
SH3BP4-211ENST00000493436 NBPF6Q5VWK0 638 aa23.05■■□□□ 1.28
SH3BP4-211ENST00000493436 NBPF4Q96M43 638 aa23.05■■□□□ 1.28
SH3BP4-211ENST00000493436 NHSQ6T4R5 1651 aa23.04■■□□□ 1.28
SH3BP4-211ENST00000493436 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
SH3BP4-211ENST00000493436 ACSBG1Q96GR2 724 aa23.04■■□□□ 1.28
SH3BP4-211ENST00000493436 KCNQ2O43526 872 aa23.03■■□□□ 1.28
SH3BP4-211ENST00000493436 NBPF14Q5TI25 921 aa23.03■■□□□ 1.28
SH3BP4-211ENST00000493436 USHBP1Q8N6Y0 703 aa23.03■■□□□ 1.28
SH3BP4-211ENST00000493436 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
SH3BP4-211ENST00000493436 MEGF6O75095 1541 aa23.02■■□□□ 1.28
SH3BP4-211ENST00000493436 SHANK3Q9BYB0 1731 aa23■■□□□ 1.27
SH3BP4-211ENST00000493436 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
SH3BP4-211ENST00000493436 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
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