RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489918.1

C1orf61-220, Transcript of chromosome 1 open reading frame 61, humanhuman

TSL 3

Gene C1orf61, Length 427 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61-220ENST00000489918 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa27.44■■□□□ 1.98
C1orf61-220ENST00000489918 OVOS2Q6IE36 1432 aa27.44■■□□□ 1.98
C1orf61-220ENST00000489918 AXIN2Q9Y2T1 843 aa27.44■■□□□ 1.98
C1orf61-220ENST00000489918 RGPD5Q99666 1765 aa27.43■■□□□ 1.98
C1orf61-220ENST00000489918 KRT27Q7Z3Y8 459 aa27.41■■□□□ 1.98
C1orf61-220ENST00000489918 LTN1O94822 1766 aa27.38■■□□□ 1.97
C1orf61-220ENST00000489918 CRB1P82279 1406 aa27.37■■□□□ 1.97
C1orf61-220ENST00000489918 BARGINQ6ZT62 677 aa27.36■■□□□ 1.97
C1orf61-220ENST00000489918 TCP11L2Q8N4U5 519 aa27.36■■□□□ 1.97
C1orf61-220ENST00000489918 POLR3GLQ9BT43 218 aa27.35■■□□□ 1.97
C1orf61-220ENST00000489918 FAM182BQ5T319 152 aa27.34■■□□□ 1.97
C1orf61-220ENST00000489918 CARD14Q9BXL6 1004 aa27.34■■□□□ 1.97
C1orf61-220ENST00000489918 ABCC6O95255 1503 aa27.34■■□□□ 1.97
C1orf61-220ENST00000489918 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa27.33■■□□□ 1.97
C1orf61-220ENST00000489918 COG3Q96JB2 828 aa27.33■■□□□ 1.97
C1orf61-220ENST00000489918 WDR17Q8IZU2 1322 aa27.33■■□□□ 1.97
C1orf61-220ENST00000489918 FYB1O15117 783 aa27.32■■□□□ 1.96
C1orf61-220ENST00000489918 FBLN1P23142 703 aa27.31■■□□□ 1.96
C1orf61-220ENST00000489918 GGNBP2Q9H3C7 697 aa27.31■■□□□ 1.96
C1orf61-220ENST00000489918 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
C1orf61-220ENST00000489918 KIF20BQ96Q89 1820 aa27.3■■□□□ 1.96
C1orf61-220ENST00000489918 NSD3Q9BZ95 1437 aa27.3■■□□□ 1.96
C1orf61-220ENST00000489918 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
C1orf61-220ENST00000489918 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
C1orf61-220ENST00000489918 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa27.28■■□□□ 1.96
C1orf61-220ENST00000489918 CCDC125Q86Z20 511 aa27.27■■□□□ 1.96
C1orf61-220ENST00000489918 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
C1orf61-220ENST00000489918 WNK3Q9BYP7 1800 aa27.25■■□□□ 1.95
C1orf61-220ENST00000489918 ERBB3P21860 1342 aa27.25■■□□□ 1.95
C1orf61-220ENST00000489918 MAP3K19Q56UN5 1328 aa27.24■■□□□ 1.95
C1orf61-220ENST00000489918 CARD10Q9BWT7 1032 aa27.24■■□□□ 1.95
C1orf61-220ENST00000489918 LRRC37A3O60309 1634 aa27.23■■□□□ 1.95
C1orf61-220ENST00000489918 ANKRD24Q8TF21 1146 aa27.22■■□□□ 1.95
C1orf61-220ENST00000489918 IP6K1Q92551 441 aa27.22■■□□□ 1.95
C1orf61-220ENST00000489918 PDE3BQ13370 1112 aa27.21■■□□□ 1.95
C1orf61-220ENST00000489918 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
C1orf61-220ENST00000489918 DEFB132Q7Z7B7 95 aa27.2■■□□□ 1.94
C1orf61-220ENST00000489918 DISP2A7MBM2 1401 aa27.19■■□□□ 1.94
C1orf61-220ENST00000489918 NLRP2Q9NX02 1062 aa27.19■■□□□ 1.94
C1orf61-220ENST00000489918 HOXC9P31274 260 aa27.18■■□□□ 1.94
C1orf61-220ENST00000489918 AMPHP49418 695 aa27.17■■□□□ 1.94
C1orf61-220ENST00000489918 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
C1orf61-220ENST00000489918 FAM196AQ6ZSG2 479 aa27.17■■□□□ 1.94
C1orf61-220ENST00000489918 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
C1orf61-220ENST00000489918 PANK3Q9H999 370 aa27.17■■□□□ 1.94
C1orf61-220ENST00000489918 CCDC7Q96M83 1385 aa27.17■■□□□ 1.94
C1orf61-220ENST00000489918 RGPD1P0DJD0 1748 aa27.16■■□□□ 1.94
C1orf61-220ENST00000489918 CGNL1Q0VF96 1302 aa27.16■■□□□ 1.94
C1orf61-220ENST00000489918 DDB1Q16531 1140 aa27.15■■□□□ 1.94
C1orf61-220ENST00000489918 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
C1orf61-220ENST00000489918 KIF7Q2M1P5 1343 aa27.15■■□□□ 1.94
C1orf61-220ENST00000489918 PEAK1Q9H792 1746 aa27.14■■□□□ 1.94
C1orf61-220ENST00000489918 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
C1orf61-220ENST00000489918 RTL1A6NKG5 1358 aa27.13■■□□□ 1.93
C1orf61-220ENST00000489918 TRIM37O94972 964 aa27.13■■□□□ 1.93
C1orf61-220ENST00000489918 RGPD2P0DJD1 1756 aa27.11■■□□□ 1.93
C1orf61-220ENST00000489918 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
C1orf61-220ENST00000489918 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
C1orf61-220ENST00000489918 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa27.09■■□□□ 1.93
C1orf61-220ENST00000489918 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa27.09■■□□□ 1.93
C1orf61-220ENST00000489918 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa27.08■■□□□ 1.93
C1orf61-220ENST00000489918 BAG6P46379 1132 aa27.08■■□□□ 1.93
C1orf61-220ENST00000489918 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa27.07■■□□□ 1.92
C1orf61-220ENST00000489918 TNS2Q63HR2 1409 aa27.07■■□□□ 1.92
C1orf61-220ENST00000489918 IL2RBP14784 551 aa27.06■■□□□ 1.92
C1orf61-220ENST00000489918 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
C1orf61-220ENST00000489918 EXOC5O00471 708 aa27.05■■□□□ 1.92
C1orf61-220ENST00000489918 FLT4P35916 1363 aa27.05■■□□□ 1.92
C1orf61-220ENST00000489918 SBF2Q86WG5 1849 aa27.04■■□□□ 1.92
C1orf61-220ENST00000489918 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
C1orf61-220ENST00000489918 INSRP06213 1382 aa27.03■■□□□ 1.92
C1orf61-220ENST00000489918 KIF24Q5T7B8 1368 aa27.03■■□□□ 1.92
C1orf61-220ENST00000489918 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
C1orf61-220ENST00000489918 NBPF6Q5VWK0 638 aa27.02■■□□□ 1.92
C1orf61-220ENST00000489918 NBPF4Q96M43 638 aa27.02■■□□□ 1.92
C1orf61-220ENST00000489918 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
C1orf61-220ENST00000489918 APBA3O96018 575 aa27.01■■□□□ 1.91
C1orf61-220ENST00000489918 USHBP1Q8N6Y0 703 aa27■■□□□ 1.91
C1orf61-220ENST00000489918 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
C1orf61-220ENST00000489918 WASHC2AQ641Q2 1341 aa26.99■■□□□ 1.91
C1orf61-220ENST00000489918 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
C1orf61-220ENST00000489918 PTF1AQ7RTS3 328 aa26.99■■□□□ 1.91
C1orf61-220ENST00000489918 POLKQ9UBT6 870 aa26.99■■□□□ 1.91
C1orf61-220ENST00000489918 NSD2O96028 1365 aa26.98■■□□□ 1.91
C1orf61-220ENST00000489918 KNSTRNQ9Y448 316 aa26.98■■□□□ 1.91
C1orf61-220ENST00000489918 BCL9O00512 1426 aa26.98■■□□□ 1.91
C1orf61-220ENST00000489918 MEGF6O75095 1541 aa26.97■■□□□ 1.91
C1orf61-220ENST00000489918 CAMKK2Q96RR4 588 aa26.97■■□□□ 1.91
C1orf61-220ENST00000489918 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
C1orf61-220ENST00000489918 MORC1Q86VD1 984 aa26.92■■□□□ 1.9
C1orf61-220ENST00000489918 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
C1orf61-220ENST00000489918 SHANK3Q9BYB0 1731 aa26.92■■□□□ 1.9
C1orf61-220ENST00000489918 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
C1orf61-220ENST00000489918 RREB1Q92766 1687 aa26.91■■□□□ 1.9
C1orf61-220ENST00000489918 KCNQ2O43526 872 aa26.9■■□□□ 1.9
C1orf61-220ENST00000489918 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
C1orf61-220ENST00000489918 ACSBG1Q96GR2 724 aa26.9■■□□□ 1.9
C1orf61-220ENST00000489918 PARD3Q8TEW0 1356 aa26.89■■□□□ 1.9
C1orf61-220ENST00000489918 NHSQ6T4R5 1651 aa26.89■■□□□ 1.89
C1orf61-220ENST00000489918 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64 ms