RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484908.1

ATP6AP1-208, Transcript of ATPase H+ transporting accessory protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene ATP6AP1, Length 566 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1-208ENST00000484908 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
ATP6AP1-208ENST00000484908 NFAT5O94916 1531 aa25.42■■□□□ 1.66
ATP6AP1-208ENST00000484908 WNK3Q9BYP7 1800 aa25.42■■□□□ 1.66
ATP6AP1-208ENST00000484908 USP54Q70EL1 1684 aa25.42■■□□□ 1.66
ATP6AP1-208ENST00000484908 CD163L1Q9NR16 1453 aa25.41■■□□□ 1.66
ATP6AP1-208ENST00000484908 SOX12O15370 315 aa25.41■■□□□ 1.66
ATP6AP1-208ENST00000484908 LRRC37A3O60309 1634 aa25.41■■□□□ 1.66
ATP6AP1-208ENST00000484908 TMC1Q8TDI8 760 aa25.4■■□□□ 1.66
ATP6AP1-208ENST00000484908 USP31Q70CQ4 1352 aa25.4■■□□□ 1.66
ATP6AP1-208ENST00000484908 RREB1Q92766 1687 aa25.39■■□□□ 1.66
ATP6AP1-208ENST00000484908 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa25.39■■□□□ 1.66
ATP6AP1-208ENST00000484908 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa25.39■■□□□ 1.66
ATP6AP1-208ENST00000484908 OVOS2Q6IE36 1432 aa25.39■■□□□ 1.66
ATP6AP1-208ENST00000484908 ABCC6O95255 1503 aa25.39■■□□□ 1.66
ATP6AP1-208ENST00000484908 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
ATP6AP1-208ENST00000484908 DDB1Q16531 1140 aa25.39■■□□□ 1.66
ATP6AP1-208ENST00000484908 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
ATP6AP1-208ENST00000484908 PEAK1Q9H792 1746 aa25.39■■□□□ 1.65
ATP6AP1-208ENST00000484908 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
ATP6AP1-208ENST00000484908 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
ATP6AP1-208ENST00000484908 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP25.38■■□□□ 1.65
ATP6AP1-208ENST00000484908 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
ATP6AP1-208ENST00000484908 SBF2Q86WG5 1849 aa25.36■■□□□ 1.65
ATP6AP1-208ENST00000484908 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa25.36■■□□□ 1.65
ATP6AP1-208ENST00000484908 CARD10Q9BWT7 1032 aa25.36■■□□□ 1.65
ATP6AP1-208ENST00000484908 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa25.36■■□□□ 1.65
ATP6AP1-208ENST00000484908 NUP188Q5SRE5 1749 aa25.34■■□□□ 1.65
ATP6AP1-208ENST00000484908 NME9Q86XW9 330 aa25.34■■□□□ 1.65
ATP6AP1-208ENST00000484908 TERF2IPQ9NYB0 399 aa25.34■■□□□ 1.65
ATP6AP1-208ENST00000484908 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
ATP6AP1-208ENST00000484908 LTN1O94822 1766 aa25.32■■□□□ 1.64
ATP6AP1-208ENST00000484908 A0A1W2PP64 1363 aa25.31■■□□□ 1.64
ATP6AP1-208ENST00000484908 CCDC7Q96M83 1385 aa25.31■■□□□ 1.64
ATP6AP1-208ENST00000484908 SLC24A1O60721 1099 aa25.31■■□□□ 1.64
ATP6AP1-208ENST00000484908 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa25.3■■□□□ 1.64
ATP6AP1-208ENST00000484908 TESK2Q96S53 571 aa25.3■■□□□ 1.64
ATP6AP1-208ENST00000484908 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
ATP6AP1-208ENST00000484908 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa25.3■■□□□ 1.64
ATP6AP1-208ENST00000484908 NBPF14Q5TI25 921 aa25.29■■□□□ 1.64
ATP6AP1-208ENST00000484908 NINLQ9Y2I6 1382 aa25.29■■□□□ 1.64
ATP6AP1-208ENST00000484908 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
ATP6AP1-208ENST00000484908 BCL9O00512 1426 aa25.28■■□□□ 1.64
ATP6AP1-208ENST00000484908 EXOC5O00471 708 aa25.26■■□□□ 1.63
ATP6AP1-208ENST00000484908 PLSCR1O15162 318 aa25.26■■□□□ 1.63
ATP6AP1-208ENST00000484908 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
ATP6AP1-208ENST00000484908 ERBB3P21860 1342 aa25.26■■□□□ 1.63
ATP6AP1-208ENST00000484908 TNS2Q63HR2 1409 aa25.22■■□□□ 1.63
ATP6AP1-208ENST00000484908 NLRP2Q9NX02 1062 aa25.21■■□□□ 1.63
ATP6AP1-208ENST00000484908 PTF1AQ7RTS3 328 aa25.2■■□□□ 1.62
ATP6AP1-208ENST00000484908 ANKRD24Q8TF21 1146 aa25.2■■□□□ 1.62
ATP6AP1-208ENST00000484908 USP47Q96K76 1375 aa25.18■■□□□ 1.62
ATP6AP1-208ENST00000484908 IL2RBP14784 551 aa25.17■■□□□ 1.62
ATP6AP1-208ENST00000484908 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa25.17■■□□□ 1.62
ATP6AP1-208ENST00000484908 TMF1P82094 1093 aa25.16■■□□□ 1.62
ATP6AP1-208ENST00000484908 IP6K1Q92551 441 aa25.16■■□□□ 1.62
ATP6AP1-208ENST00000484908 COG3Q96JB2 828 aa25.16■■□□□ 1.62
ATP6AP1-208ENST00000484908 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
ATP6AP1-208ENST00000484908 NHSQ6T4R5 1651 aa25.13■■□□□ 1.61
ATP6AP1-208ENST00000484908 PROM2Q8N271 834 aa25.12■■□□□ 1.61
ATP6AP1-208ENST00000484908 KAT6BQ8WYB5 2073 aa25.12■■□□□ 1.61
ATP6AP1-208ENST00000484908 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
ATP6AP1-208ENST00000484908 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.1■■□□□ 1.61
ATP6AP1-208ENST00000484908 MAP3K19Q56UN5 1328 aa25.1■■□□□ 1.61
ATP6AP1-208ENST00000484908 KCNQ2O43526 872 aa25.09■■□□□ 1.61
ATP6AP1-208ENST00000484908 TXNRD1Q16881 649 aa25.09■■□□□ 1.61
ATP6AP1-208ENST00000484908 CDCA8Q53HL2 280 aa25.09■■□□□ 1.61
ATP6AP1-208ENST00000484908 SPON1Q9HCB6 807 aa25.09■■□□□ 1.61
ATP6AP1-208ENST00000484908 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
ATP6AP1-208ENST00000484908 HOXC9P31274 260 aa25.07■■□□□ 1.6
ATP6AP1-208ENST00000484908 AMPHP49418 695 aa25.07■■□□□ 1.6
ATP6AP1-208ENST00000484908 ACSBG1Q96GR2 724 aa25.07■■□□□ 1.6
ATP6AP1-208ENST00000484908 CASZ1Q86V15 1759 aa25.06■■□□□ 1.6
ATP6AP1-208ENST00000484908 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.06■■□□□ 1.6
ATP6AP1-208ENST00000484908 FYB1O15117 783 aa25.05■■□□□ 1.6
ATP6AP1-208ENST00000484908 FBLN1P23142 703 aa25.05■■□□□ 1.6
ATP6AP1-208ENST00000484908 BTAF1O14981 1849 aa25.05■■□□□ 1.6
ATP6AP1-208ENST00000484908 RTL1A6NKG5 1358 aa25.05■■□□□ 1.6
ATP6AP1-208ENST00000484908 KIF20BQ96Q89 1820 aa25.04■■□□□ 1.6
ATP6AP1-208ENST00000484908 RGPD2P0DJD1 1756 aa25.03■■□□□ 1.6
ATP6AP1-208ENST00000484908 GGNBP2Q9H3C7 697 aa25.03■■□□□ 1.6
ATP6AP1-208ENST00000484908 STK32BQ9NY57 414 aa25.03■■□□□ 1.6
ATP6AP1-208ENST00000484908 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
ATP6AP1-208ENST00000484908 SLC15A2Q16348 729 aa25.01■■□□□ 1.59
ATP6AP1-208ENST00000484908 MYOM1P52179 1685 aa24.99■■□□□ 1.59
ATP6AP1-208ENST00000484908 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
ATP6AP1-208ENST00000484908 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
ATP6AP1-208ENST00000484908 PCGF6Q9BYE7 350 aa24.98■■□□□ 1.59
ATP6AP1-208ENST00000484908 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
ATP6AP1-208ENST00000484908 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.59
ATP6AP1-208ENST00000484908 SHANK3Q9BYB0 1731 aa24.95■■□□□ 1.59
ATP6AP1-208ENST00000484908 PAPPAQ13219 1627 aa24.95■■□□□ 1.58
ATP6AP1-208ENST00000484908 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
ATP6AP1-208ENST00000484908 MEGF6O75095 1541 aa24.94■■□□□ 1.58
ATP6AP1-208ENST00000484908 KIF24Q5T7B8 1368 aa24.93■■□□□ 1.58
ATP6AP1-208ENST00000484908 ZBTB7AO95365 584 aa24.93■■□□□ 1.58
ATP6AP1-208ENST00000484908 NBPF6Q5VWK0 638 aa24.93■■□□□ 1.58
ATP6AP1-208ENST00000484908 NBPF4Q96M43 638 aa24.93■■□□□ 1.58
ATP6AP1-208ENST00000484908 CARD14Q9BXL6 1004 aa24.93■■□□□ 1.58
ATP6AP1-208ENST00000484908 NSD3Q9BZ95 1437 aa24.93■■□□□ 1.58
ATP6AP1-208ENST00000484908 INSRP06213 1382 aa24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.2 ms