RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482519.1

VAMP4-204, Transcript of vesicle associated membrane protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene VAMP4, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4-204ENST00000482519 NFAT5O94916 1531 aa23.06■■□□□ 1.28
VAMP4-204ENST00000482519 COL18A1P39060 1754 aa23.05■■□□□ 1.28
VAMP4-204ENST00000482519 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa23.05■■□□□ 1.28
VAMP4-204ENST00000482519 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
VAMP4-204ENST00000482519 RGPD5Q99666 1765 aa23.04■■□□□ 1.28
VAMP4-204ENST00000482519 CCDC125Q86Z20 511 aa23.04■■□□□ 1.28
VAMP4-204ENST00000482519 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa23.03■■□□□ 1.28
VAMP4-204ENST00000482519 CRB1P82279 1406 aa23.03■■□□□ 1.28
VAMP4-204ENST00000482519 BARGINQ6ZT62 677 aa23.03■■□□□ 1.28
VAMP4-204ENST00000482519 COG3Q96JB2 828 aa23.03■■□□□ 1.28
VAMP4-204ENST00000482519 USP54Q70EL1 1684 aa23.02■■□□□ 1.28
VAMP4-204ENST00000482519 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
VAMP4-204ENST00000482519 LTN1O94822 1766 aa23■■□□□ 1.27
VAMP4-204ENST00000482519 PDE3BQ13370 1112 aa23■■□□□ 1.27
VAMP4-204ENST00000482519 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
VAMP4-204ENST00000482519 WDR17Q8IZU2 1322 aa23■■□□□ 1.27
VAMP4-204ENST00000482519 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa22.99■■□□□ 1.27
VAMP4-204ENST00000482519 OVOS2Q6IE36 1432 aa22.99■■□□□ 1.27
VAMP4-204ENST00000482519 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
VAMP4-204ENST00000482519 GGNBP2Q9H3C7 697 aa22.98■■□□□ 1.27
VAMP4-204ENST00000482519 MYOM1P52179 1685 aa22.97■■□□□ 1.27
VAMP4-204ENST00000482519 FYB1O15117 783 aa22.96■■□□□ 1.27
VAMP4-204ENST00000482519 FBLN1P23142 703 aa22.96■■□□□ 1.27
VAMP4-204ENST00000482519 DEFB132Q7Z7B7 95 aa22.94■■□□□ 1.26
VAMP4-204ENST00000482519 CARD14Q9BXL6 1004 aa22.94■■□□□ 1.26
VAMP4-204ENST00000482519 CARD10Q9BWT7 1032 aa22.93■■□□□ 1.26
VAMP4-204ENST00000482519 NLRP2Q9NX02 1062 aa22.93■■□□□ 1.26
VAMP4-204ENST00000482519 ABCC6O95255 1503 aa22.92■■□□□ 1.26
VAMP4-204ENST00000482519 NSD3Q9BZ95 1437 aa22.92■■□□□ 1.26
VAMP4-204ENST00000482519 AMPHP49418 695 aa22.92■■□□□ 1.26
VAMP4-204ENST00000482519 FAM196AQ6ZSG2 479 aa22.92■■□□□ 1.26
VAMP4-204ENST00000482519 ANKRD24Q8TF21 1146 aa22.92■■□□□ 1.26
VAMP4-204ENST00000482519 KIF20BQ96Q89 1820 aa22.92■■□□□ 1.26
VAMP4-204ENST00000482519 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
VAMP4-204ENST00000482519 ERBB3P21860 1342 aa22.9■■□□□ 1.26
VAMP4-204ENST00000482519 DDB1Q16531 1140 aa22.9■■□□□ 1.26
VAMP4-204ENST00000482519 IP6K1Q92551 441 aa22.9■■□□□ 1.26
VAMP4-204ENST00000482519 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
VAMP4-204ENST00000482519 MAP3K19Q56UN5 1328 aa22.89■■□□□ 1.26
VAMP4-204ENST00000482519 TRIM37O94972 964 aa22.89■■□□□ 1.25
VAMP4-204ENST00000482519 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
VAMP4-204ENST00000482519 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
VAMP4-204ENST00000482519 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
VAMP4-204ENST00000482519 BAG6P46379 1132 aa22.87■■□□□ 1.25
VAMP4-204ENST00000482519 RGPD1P0DJD0 1748 aa22.87■■□□□ 1.25
VAMP4-204ENST00000482519 CCDC7Q96M83 1385 aa22.87■■□□□ 1.25
VAMP4-204ENST00000482519 HOXC9P31274 260 aa22.86■■□□□ 1.25
VAMP4-204ENST00000482519 WNK3Q9BYP7 1800 aa22.86■■□□□ 1.25
VAMP4-204ENST00000482519 LRRC37A3O60309 1634 aa22.86■■□□□ 1.25
VAMP4-204ENST00000482519 CGNL1Q0VF96 1302 aa22.84■■□□□ 1.25
VAMP4-204ENST00000482519 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
VAMP4-204ENST00000482519 PANK3Q9H999 370 aa22.84■■□□□ 1.25
VAMP4-204ENST00000482519 EXOC5O00471 708 aa22.83■■□□□ 1.25
VAMP4-204ENST00000482519 APBA3O96018 575 aa22.81■■□□□ 1.24
VAMP4-204ENST00000482519 DISP2A7MBM2 1401 aa22.81■■□□□ 1.24
VAMP4-204ENST00000482519 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
VAMP4-204ENST00000482519 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
VAMP4-204ENST00000482519 IL2RBP14784 551 aa22.8■■□□□ 1.24
VAMP4-204ENST00000482519 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
VAMP4-204ENST00000482519 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa22.8■■□□□ 1.24
VAMP4-204ENST00000482519 RTL1A6NKG5 1358 aa22.79■■□□□ 1.24
VAMP4-204ENST00000482519 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
VAMP4-204ENST00000482519 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa22.77■■□□□ 1.24
VAMP4-204ENST00000482519 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa22.77■■□□□ 1.24
VAMP4-204ENST00000482519 KIF7Q2M1P5 1343 aa22.77■■□□□ 1.24
VAMP4-204ENST00000482519 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
VAMP4-204ENST00000482519 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
VAMP4-204ENST00000482519 PEAK1Q9H792 1746 aa22.76■■□□□ 1.23
VAMP4-204ENST00000482519 RGPD2P0DJD1 1756 aa22.76■■□□□ 1.23
VAMP4-204ENST00000482519 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
VAMP4-204ENST00000482519 FLT4P35916 1363 aa22.74■■□□□ 1.23
VAMP4-204ENST00000482519 TNS2Q63HR2 1409 aa22.74■■□□□ 1.23
VAMP4-204ENST00000482519 USHBP1Q8N6Y0 703 aa22.73■■□□□ 1.23
VAMP4-204ENST00000482519 NBPF6Q5VWK0 638 aa22.72■■□□□ 1.23
VAMP4-204ENST00000482519 NBPF4Q96M43 638 aa22.72■■□□□ 1.23
VAMP4-204ENST00000482519 CAMKK2Q96RR4 588 aa22.72■■□□□ 1.23
VAMP4-204ENST00000482519 KNSTRNQ9Y448 316 aa22.72■■□□□ 1.23
VAMP4-204ENST00000482519 SBF2Q86WG5 1849 aa22.72■■□□□ 1.23
VAMP4-204ENST00000482519 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
VAMP4-204ENST00000482519 PTF1AQ7RTS3 328 aa22.71■■□□□ 1.23
VAMP4-204ENST00000482519 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
VAMP4-204ENST00000482519 INSRP06213 1382 aa22.71■■□□□ 1.23
VAMP4-204ENST00000482519 KIF24Q5T7B8 1368 aa22.7■■□□□ 1.22
VAMP4-204ENST00000482519 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa22.7■■□□□ 1.22
VAMP4-204ENST00000482519 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
VAMP4-204ENST00000482519 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
VAMP4-204ENST00000482519 MORC1Q86VD1 984 aa22.68■■□□□ 1.22
VAMP4-204ENST00000482519 ACSBG1Q96GR2 724 aa22.68■■□□□ 1.22
VAMP4-204ENST00000482519 POLKQ9UBT6 870 aa22.68■■□□□ 1.22
VAMP4-204ENST00000482519 KAT6BQ8WYB5 2073 aa22.66■■□□□ 1.22
VAMP4-204ENST00000482519 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa22.66■■□□□ 1.22
VAMP4-204ENST00000482519 BCL9O00512 1426 aa22.65■■□□□ 1.22
VAMP4-204ENST00000482519 NSD2O96028 1365 aa22.65■■□□□ 1.22
VAMP4-204ENST00000482519 PARD3Q8TEW0 1356 aa22.65■■□□□ 1.22
VAMP4-204ENST00000482519 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.65■■□□□ 1.22
VAMP4-204ENST00000482519 KCNQ2O43526 872 aa22.65■■□□□ 1.22
VAMP4-204ENST00000482519 MEGF6O75095 1541 aa22.64■■□□□ 1.21
VAMP4-204ENST00000482519 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
VAMP4-204ENST00000482519 TATP17735 454 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
VAMP4-204ENST00000482519 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
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