RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481518.1

PSME4-208, Transcript of proteasome activator subunit 4, human

TSL 5

Gene PSME4, Length 886 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSME4-208	ENST00000481518	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		32.36	■■■□□ 2.77
PSME4-208	ENST00000481518	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	32.35	■■■□□ 2.77
PSME4-208	ENST00000481518	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		32.34	■■■□□ 2.77
PSME4-208	ENST00000481518	RGPD5	Q99666	1765 aa		32.34	■■■□□ 2.77
PSME4-208	ENST00000481518	TMF1	P82094	1093 aa		32.33	■■■□□ 2.77
PSME4-208	ENST00000481518	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	32.31	■■■□□ 2.76
PSME4-208	ENST00000481518	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		32.31	■■■□□ 2.76
PSME4-208	ENST00000481518	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		32.31	■■■□□ 2.76
PSME4-208	ENST00000481518	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	32.29	■■■□□ 2.76
PSME4-208	ENST00000481518	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	32.29	■■■□□ 2.76
PSME4-208	ENST00000481518	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		32.28	■■■□□ 2.76
PSME4-208	ENST00000481518	ABCC6	O95255	1503 aa		32.28	■■■□□ 2.76
PSME4-208	ENST00000481518	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		32.27	■■■□□ 2.76
PSME4-208	ENST00000481518	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		32.27	■■■□□ 2.76
PSME4-208	ENST00000481518	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		32.26	■■■□□ 2.76
PSME4-208	ENST00000481518	LTN1	O94822	1766 aa		32.26	■■■□□ 2.75
PSME4-208	ENST00000481518	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	32.25	■■■□□ 2.75
PSME4-208	ENST00000481518	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		32.23	■■■□□ 2.75
PSME4-208	ENST00000481518	LRRC37A3	O60309	1634 aa		32.23	■■■□□ 2.75
PSME4-208	ENST00000481518	PDE3B	Q13370	1112 aa		32.22	■■■□□ 2.75
PSME4-208	ENST00000481518	MYOM1	P52179	1685 aa		32.21	■■■□□ 2.75
PSME4-208	ENST00000481518	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		32.21	■■■□□ 2.75
PSME4-208	ENST00000481518	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		32.19	■■■□□ 2.74
PSME4-208	ENST00000481518	BAG6	P46379	1132 aa		32.18	■■■□□ 2.74
PSME4-208	ENST00000481518	CDCA8	Q53HL2	280 aa		32.18	■■■□□ 2.74
PSME4-208	ENST00000481518	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		32.18	■■■□□ 2.74
PSME4-208	ENST00000481518	TRIM37	O94972	964 aa		32.16	■■■□□ 2.74
PSME4-208	ENST00000481518	DISP2	A7MBM2	1401 aa		32.15	■■■□□ 2.74
PSME4-208	ENST00000481518	PEAK1	Q9H792	1746 aa		32.14	■■■□□ 2.74
PSME4-208	ENST00000481518	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	32.14	■■■□□ 2.74
PSME4-208	ENST00000481518	COG3	Q96JB2	828 aa		32.14	■■■□□ 2.74
PSME4-208	ENST00000481518	ERBB3	P21860	1342 aa		32.14	■■■□□ 2.74
PSME4-208	ENST00000481518	FBLN1	P23142	703 aa		32.11	■■■□□ 2.73
PSME4-208	ENST00000481518	DDB1	Q16531	1140 aa		32.11	■■■□□ 2.73
PSME4-208	ENST00000481518	CCDC7	Q96M83	1385 aa		32.1	■■■□□ 2.73
PSME4-208	ENST00000481518	FYB1	O15117	783 aa		32.1	■■■□□ 2.73
PSME4-208	ENST00000481518	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		32.09	■■■□□ 2.73
PSME4-208	ENST00000481518	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		32.09	■■■□□ 2.73
PSME4-208	ENST00000481518	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		32.09	■■■□□ 2.73
PSME4-208	ENST00000481518	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		32.08	■■■□□ 2.73
PSME4-208	ENST00000481518	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	32.08	■■■□□ 2.73
PSME4-208	ENST00000481518	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		32.08	■■■□□ 2.73
PSME4-208	ENST00000481518	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		32.07	■■■□□ 2.73
PSME4-208	ENST00000481518	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	32.06	■■■□□ 2.72
PSME4-208	ENST00000481518	IP6K1	Q92551	441 aa		32.06	■■■□□ 2.72
PSME4-208	ENST00000481518	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		32.06	■■■□□ 2.72
PSME4-208	ENST00000481518	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	32.05	■■■□□ 2.72
PSME4-208	ENST00000481518	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		32.04	■■■□□ 2.72
PSME4-208	ENST00000481518	APBA3	O96018	575 aa		32.04	■■■□□ 2.72
PSME4-208	ENST00000481518	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	32.04	■■■□□ 2.72
PSME4-208	ENST00000481518	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	32.04	■■■□□ 2.72
PSME4-208	ENST00000481518	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		32.02	■■■□□ 2.72
PSME4-208	ENST00000481518	TNS2	Q63HR2	1409 aa		32.01	■■■□□ 2.72
PSME4-208	ENST00000481518	SBF2	Q86WG5	1849 aa		32.01	■■■□□ 2.72
PSME4-208	ENST00000481518	HOXC9	P31274	260 aa		32	■■■□□ 2.71
PSME4-208	ENST00000481518	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	31.99	■■■□□ 2.71
PSME4-208	ENST00000481518	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	31.99	■■■□□ 2.71
PSME4-208	ENST00000481518	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	31.99	■■■□□ 2.71
PSME4-208	ENST00000481518	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	31.98	■■■□□ 2.71
PSME4-208	ENST00000481518	RREB1	Q92766	1687 aa		31.97	■■■□□ 2.71
PSME4-208	ENST00000481518	EXOC5	O00471	708 aa		31.97	■■■□□ 2.71
PSME4-208	ENST00000481518	AMPH	P49418	695 aa		31.97	■■■□□ 2.71
PSME4-208	ENST00000481518	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		31.97	■■■□□ 2.71
PSME4-208	ENST00000481518	BCL9	O00512	1426 aa		31.96	■■■□□ 2.71
PSME4-208	ENST00000481518	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		31.96	■■■□□ 2.71
PSME4-208	ENST00000481518	RTL1	A6NKG5	1358 aa		31.95	■■■□□ 2.71
PSME4-208	ENST00000481518	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		31.95	■■■□□ 2.71
PSME4-208	ENST00000481518	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	31.94	■■■□□ 2.7
PSME4-208	ENST00000481518	IL2RB	P14784	551 aa		31.94	■■■□□ 2.7
PSME4-208	ENST00000481518	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		31.92	■■■□□ 2.7
PSME4-208	ENST00000481518	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		31.92	■■■□□ 2.7
PSME4-208	ENST00000481518	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	31.88	■■■□□ 2.69
PSME4-208	ENST00000481518	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	31.86	■■■□□ 2.69
PSME4-208	ENST00000481518	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		31.86	■■■□□ 2.69
PSME4-208	ENST00000481518	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	31.86	■■■□□ 2.69
PSME4-208	ENST00000481518	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		31.85	■■■□□ 2.69
PSME4-208	ENST00000481518	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		31.84	■■■□□ 2.69
PSME4-208	ENST00000481518	INSR	P06213	1382 aa		31.83	■■■□□ 2.69
PSME4-208	ENST00000481518	FLT4	P35916	1363 aa		31.83	■■■□□ 2.69
PSME4-208	ENST00000481518	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		31.83	■■■□□ 2.69
PSME4-208	ENST00000481518	NHS	Q6T4R5	1651 aa		31.83	■■■□□ 2.69
PSME4-208	ENST00000481518	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		31.82	■■■□□ 2.68
PSME4-208	ENST00000481518	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		31.82	■■■□□ 2.68
PSME4-208	ENST00000481518	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		31.81	■■■□□ 2.68
PSME4-208	ENST00000481518	MEGF6	O75095	1541 aa		31.81	■■■□□ 2.68
PSME4-208	ENST00000481518	PLSCR1	O15162	318 aa		31.81	■■■□□ 2.68
PSME4-208	ENST00000481518	KCNQ2	O43526	872 aa		31.81	■■■□□ 2.68
PSME4-208	ENST00000481518	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		31.81	■■■□□ 2.68
PSME4-208	ENST00000481518	NBPF4	Q96M43	638 aa		31.81	■■■□□ 2.68
PSME4-208	ENST00000481518	PANK3	Q9H999	370 aa		31.8	■■■□□ 2.68
PSME4-208	ENST00000481518	LRP5	O75197	1615 aa		31.79	■■■□□ 2.68
PSME4-208	ENST00000481518	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	31.79	■■■□□ 2.68
PSME4-208	ENST00000481518	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		31.79	■■■□□ 2.68
PSME4-208	ENST00000481518	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		31.78	■■■□□ 2.68
PSME4-208	ENST00000481518	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		31.78	■■■□□ 2.68
PSME4-208	ENST00000481518	PROM2	Q8N271	834 aa		31.75	■■■□□ 2.67
PSME4-208	ENST00000481518	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	31.75	■■■□□ 2.67
PSME4-208	ENST00000481518	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	31.72	■■■□□ 2.67
PSME4-208	ENST00000481518	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	31.72	■■■□□ 2.67
PSME4-208	ENST00000481518	NBPF14	Q5TI25	921 aa		31.71	■■■□□ 2.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.6 ms