RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481211.1

NISCH-208, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 557 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-208ENST00000481211 COL18A1P39060 1754 aa17.48■□□□□ 0.39
NISCH-208ENST00000481211 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP17.47■□□□□ 0.39
NISCH-208ENST00000481211 NUDCQ9Y266 331 aa17.47■□□□□ 0.39
NISCH-208ENST00000481211 LMO7Q8WWI1 1683 aa17.47■□□□□ 0.39
NISCH-208ENST00000481211 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.39
NISCH-208ENST00000481211 PLEKHG5O94827 1062 aa17.45■□□□□ 0.38
NISCH-208ENST00000481211 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
NISCH-208ENST00000481211 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa17.44■□□□□ 0.38
NISCH-208ENST00000481211 NWD2Q9ULI1 1742 aa17.44■□□□□ 0.38
NISCH-208ENST00000481211 ZBTB7CA1YPR0 619 aa17.43■□□□□ 0.38
NISCH-208ENST00000481211 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
NISCH-208ENST00000481211 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
NISCH-208ENST00000481211 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
NISCH-208ENST00000481211 ERBB3P21860 1342 aa17.43■□□□□ 0.38
NISCH-208ENST00000481211 FAM83GA6ND36 823 aa17.42■□□□□ 0.38
NISCH-208ENST00000481211 IL13P35225 146 aa17.42■□□□□ 0.38
NISCH-208ENST00000481211 LRP6O75581 1613 aa17.42■□□□□ 0.38
NISCH-208ENST00000481211 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP17.41■□□□□ 0.38
NISCH-208ENST00000481211 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP17.41■□□□□ 0.38
NISCH-208ENST00000481211 CHRNA2Q15822 529 aa17.41■□□□□ 0.38
NISCH-208ENST00000481211 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP17.41■□□□□ 0.38
NISCH-208ENST00000481211 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP17.41■□□□□ 0.38
NISCH-208ENST00000481211 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa17.41■□□□□ 0.38
NISCH-208ENST00000481211 SLIT2O94813 1529 aa17.41■□□□□ 0.38
NISCH-208ENST00000481211 PLCH1Q4KWH8 1693 aa17.4■□□□□ 0.38
NISCH-208ENST00000481211 ADAMTS2O95450 1211 aa17.4■□□□□ 0.38
NISCH-208ENST00000481211 ANKRD24Q8TF21 1146 aa17.4■□□□□ 0.38
NISCH-208ENST00000481211 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa17.4■□□□□ 0.38
NISCH-208ENST00000481211 RGPD1P0DJD0 1748 aa17.39■□□□□ 0.37
NISCH-208ENST00000481211 CCDC184Q52MB2 194 aa17.39■□□□□ 0.37
NISCH-208ENST00000481211 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
NISCH-208ENST00000481211 AXIN2Q9Y2T1 843 aa17.39■□□□□ 0.37
NISCH-208ENST00000481211 WDR17Q8IZU2 1322 aa17.39■□□□□ 0.37
NISCH-208ENST00000481211 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
NISCH-208ENST00000481211 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
NISCH-208ENST00000481211 IGSF1Q8N6C5 1336 aa17.38■□□□□ 0.37
NISCH-208ENST00000481211 NCAPD2Q15021 1401 aa17.38■□□□□ 0.37
NISCH-208ENST00000481211 BTG4Q9NY30 223 aa17.37■□□□□ 0.37
NISCH-208ENST00000481211 NRAPQ86VF7 1730 aa17.37■□□□□ 0.37
NISCH-208ENST00000481211 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
NISCH-208ENST00000481211 RGPD5Q99666 1765 aa17.37■□□□□ 0.37
NISCH-208ENST00000481211 EVA1CP58658 441 aa17.36■□□□□ 0.37
NISCH-208ENST00000481211 NGLY1Q96IV0 654 aa17.36■□□□□ 0.37
NISCH-208ENST00000481211 KDRP35968 1356 aa17.36■□□□□ 0.37
NISCH-208ENST00000481211 CRB1P82279 1406 aa17.36■□□□□ 0.37
NISCH-208ENST00000481211 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
NISCH-208ENST00000481211 FCHSD2O94868 740 aa17.35■□□□□ 0.37
NISCH-208ENST00000481211 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
NISCH-208ENST00000481211 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa17.35■□□□□ 0.37
NISCH-208ENST00000481211 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP17.35■□□□□ 0.37
NISCH-208ENST00000481211 C8orf37Q96NL8 207 aa17.35■□□□□ 0.37
NISCH-208ENST00000481211 UNC5CLQ8IV45 518 aa17.34■□□□□ 0.37
NISCH-208ENST00000481211 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
NISCH-208ENST00000481211 EYA1Q99502 592 aa17.34■□□□□ 0.37
NISCH-208ENST00000481211 CARD10Q9BWT7 1032 aa17.33■□□□□ 0.36
NISCH-208ENST00000481211 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa17.32■□□□□ 0.36
NISCH-208ENST00000481211 BCL9LQ86UU0 1499 aa17.31■□□□□ 0.36
NISCH-208ENST00000481211 NEFMP07197 916 aa17.31■□□□□ 0.36
NISCH-208ENST00000481211 NBPF6Q5VWK0 638 aa17.31■□□□□ 0.36
NISCH-208ENST00000481211 FAM9BQ8IZU0 186 aa17.31■□□□□ 0.36
NISCH-208ENST00000481211 NBPF4Q96M43 638 aa17.31■□□□□ 0.36
NISCH-208ENST00000481211 NLRP2Q9NX02 1062 aa17.31■□□□□ 0.36
NISCH-208ENST00000481211 ADAMTS8Q9UP79 889 aa17.31■□□□□ 0.36
NISCH-208ENST00000481211 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
NISCH-208ENST00000481211 VPS72Q15906 364 aa17.3■□□□□ 0.36
NISCH-208ENST00000481211 SULT6B1Q6IMI4 303 aa17.3■□□□□ 0.36
NISCH-208ENST00000481211 STRN4Q9NRL3 753 aa17.3■□□□□ 0.36
NISCH-208ENST00000481211 USP21Q9UK80 565 aa17.3■□□□□ 0.36
NISCH-208ENST00000481211 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
NISCH-208ENST00000481211 RSPH6AQ9H0K4 717 aa17.29■□□□□ 0.36
NISCH-208ENST00000481211 AFF2P51816 1311 aa17.28■□□□□ 0.36
NISCH-208ENST00000481211 NGEFQ8N5V2 710 aa17.28■□□□□ 0.36
NISCH-208ENST00000481211 RUNDC1Q96C34 613 aa17.28■□□□□ 0.36
NISCH-208ENST00000481211 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
NISCH-208ENST00000481211 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa17.27■□□□□ 0.36
NISCH-208ENST00000481211 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa17.27■□□□□ 0.36
NISCH-208ENST00000481211 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa17.27■□□□□ 0.36
NISCH-208ENST00000481211 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.36
NISCH-208ENST00000481211 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP17.27■□□□□ 0.36
NISCH-208ENST00000481211 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP17.27■□□□□ 0.36
NISCH-208ENST00000481211 RGPD2P0DJD1 1756 aa17.27■□□□□ 0.35
NISCH-208ENST00000481211 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa17.26■□□□□ 0.35
NISCH-208ENST00000481211 HMOX1P09601 288 aa17.26■□□□□ 0.35
NISCH-208ENST00000481211 PRKAR2BP31323 418 aa17.26■□□□□ 0.35
NISCH-208ENST00000481211 TCP11L2Q8N4U5 519 aa17.26■□□□□ 0.35
NISCH-208ENST00000481211 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa17.26■□□□□ 0.35
NISCH-208ENST00000481211 PLEKHF1Q96S99 279 aa17.26■□□□□ 0.35
NISCH-208ENST00000481211 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP17.26■□□□□ 0.35
NISCH-208ENST00000481211 ATRNO75882 1429 aa17.26■□□□□ 0.35
NISCH-208ENST00000481211 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
NISCH-208ENST00000481211 AMOTQ4VCS5 1084 aa17.25■□□□□ 0.35
NISCH-208ENST00000481211 BARGINQ6ZT62 677 aa17.25■□□□□ 0.35
NISCH-208ENST00000481211 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP17.25■□□□□ 0.35
NISCH-208ENST00000481211 AEBP1Q8IUX7 1158 aa17.25■□□□□ 0.35
NISCH-208ENST00000481211 TATP17735 454 aaPredicted RBP17.24■□□□□ 0.35
NISCH-208ENST00000481211 DISP2A7MBM2 1401 aa17.23■□□□□ 0.35
NISCH-208ENST00000481211 IL2RBP14784 551 aa17.23■□□□□ 0.35
NISCH-208ENST00000481211 USHBP1Q8N6Y0 703 aa17.23■□□□□ 0.35
NISCH-208ENST00000481211 WNK3Q9BYP7 1800 aa17.23■□□□□ 0.35
NISCH-208ENST00000481211 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa17.22■□□□□ 0.35
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