RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476817.1

CTBP2-208, Transcript of C-terminal binding protein 2, human

TSL 3

Gene CTBP2, Length 705 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTBP2-208	ENST00000476817	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	29.38	■■■□□ 2.29
CTBP2-208	ENST00000476817	NFAT5	O94916	1531 aa		29.37	■■■□□ 2.29
CTBP2-208	ENST00000476817	PDE3B	Q13370	1112 aa		29.36	■■■□□ 2.29
CTBP2-208	ENST00000476817	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		29.36	■■■□□ 2.29
CTBP2-208	ENST00000476817	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		29.35	■■■□□ 2.29
CTBP2-208	ENST00000476817	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		29.35	■■■□□ 2.29
CTBP2-208	ENST00000476817	BAG6	P46379	1132 aa		29.34	■■■□□ 2.29
CTBP2-208	ENST00000476817	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		29.34	■■■□□ 2.29
CTBP2-208	ENST00000476817	TMF1	P82094	1093 aa		29.33	■■■□□ 2.29
CTBP2-208	ENST00000476817	USP54	Q70EL1	1684 aa		29.31	■■■□□ 2.28
CTBP2-208	ENST00000476817	TRIM37	O94972	964 aa		29.29	■■■□□ 2.28
CTBP2-208	ENST00000476817	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		29.28	■■■□□ 2.28
CTBP2-208	ENST00000476817	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	29.28	■■■□□ 2.28
CTBP2-208	ENST00000476817	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		29.27	■■■□□ 2.28
CTBP2-208	ENST00000476817	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		29.27	■■■□□ 2.28
CTBP2-208	ENST00000476817	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		29.26	■■■□□ 2.27
CTBP2-208	ENST00000476817	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		29.26	■■■□□ 2.27
CTBP2-208	ENST00000476817	RGPD5	Q99666	1765 aa		29.26	■■■□□ 2.27
CTBP2-208	ENST00000476817	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	29.25	■■■□□ 2.27
CTBP2-208	ENST00000476817	ABCC6	O95255	1503 aa		29.25	■■■□□ 2.27
CTBP2-208	ENST00000476817	DISP2	A7MBM2	1401 aa		29.25	■■■□□ 2.27
CTBP2-208	ENST00000476817	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		29.25	■■■□□ 2.27
CTBP2-208	ENST00000476817	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	29.24	■■■□□ 2.27
CTBP2-208	ENST00000476817	DDB1	Q16531	1140 aa		29.22	■■■□□ 2.27
CTBP2-208	ENST00000476817	CDCA8	Q53HL2	280 aa		29.22	■■■□□ 2.27
CTBP2-208	ENST00000476817	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	29.22	■■■□□ 2.27
CTBP2-208	ENST00000476817	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	29.21	■■■□□ 2.27
CTBP2-208	ENST00000476817	APBA3	O96018	575 aa		29.2	■■■□□ 2.26
CTBP2-208	ENST00000476817	ERBB3	P21860	1342 aa		29.2	■■■□□ 2.26
CTBP2-208	ENST00000476817	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	29.19	■■■□□ 2.26
CTBP2-208	ENST00000476817	COG3	Q96JB2	828 aa		29.19	■■■□□ 2.26
CTBP2-208	ENST00000476817	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		29.19	■■■□□ 2.26
CTBP2-208	ENST00000476817	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		29.18	■■■□□ 2.26
CTBP2-208	ENST00000476817	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	29.18	■■■□□ 2.26
CTBP2-208	ENST00000476817	LRRC37A3	O60309	1634 aa		29.17	■■■□□ 2.26
CTBP2-208	ENST00000476817	CCDC7	Q96M83	1385 aa		29.17	■■■□□ 2.26
CTBP2-208	ENST00000476817	LTN1	O94822	1766 aa		29.16	■■■□□ 2.26
CTBP2-208	ENST00000476817	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		29.15	■■■□□ 2.26
CTBP2-208	ENST00000476817	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		29.15	■■■□□ 2.26
CTBP2-208	ENST00000476817	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		29.15	■■■□□ 2.26
CTBP2-208	ENST00000476817	FYB1	O15117	783 aa		29.14	■■■□□ 2.26
CTBP2-208	ENST00000476817	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	29.14	■■■□□ 2.26
CTBP2-208	ENST00000476817	IP6K1	Q92551	441 aa		29.14	■■■□□ 2.26
CTBP2-208	ENST00000476817	FBLN1	P23142	703 aa		29.13	■■■□□ 2.25
CTBP2-208	ENST00000476817	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		29.13	■■■□□ 2.25
CTBP2-208	ENST00000476817	PEAK1	Q9H792	1746 aa		29.12	■■■□□ 2.25
CTBP2-208	ENST00000476817	EXOC5	O00471	708 aa		29.12	■■■□□ 2.25
CTBP2-208	ENST00000476817	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	29.1	■■■□□ 2.25
CTBP2-208	ENST00000476817	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		29.1	■■■□□ 2.25
CTBP2-208	ENST00000476817	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		29.1	■■■□□ 2.25
CTBP2-208	ENST00000476817	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		29.1	■■■□□ 2.25
CTBP2-208	ENST00000476817	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		29.08	■■■□□ 2.25
CTBP2-208	ENST00000476817	BCL9	O00512	1426 aa		29.06	■■■□□ 2.24
CTBP2-208	ENST00000476817	HOXC9	P31274	260 aa		29.06	■■■□□ 2.24
CTBP2-208	ENST00000476817	AMPH	P49418	695 aa		29.06	■■■□□ 2.24
CTBP2-208	ENST00000476817	IL2RB	P14784	551 aa		29.05	■■■□□ 2.24
CTBP2-208	ENST00000476817	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		29.05	■■■□□ 2.24
CTBP2-208	ENST00000476817	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	29.05	■■■□□ 2.24
CTBP2-208	ENST00000476817	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	29.04	■■■□□ 2.24	6e-7	■■■■□ 25.7
CTBP2-208	ENST00000476817	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	29.04	■■■□□ 2.24
CTBP2-208	ENST00000476817	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	29.04	■■■□□ 2.24
CTBP2-208	ENST00000476817	TNS2	Q63HR2	1409 aa		29.03	■■■□□ 2.24
CTBP2-208	ENST00000476817	MYOM1	P52179	1685 aa		29.03	■■■□□ 2.24
CTBP2-208	ENST00000476817	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	29.03	■■■□□ 2.24
CTBP2-208	ENST00000476817	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	29.02	■■■□□ 2.24
CTBP2-208	ENST00000476817	SBF2	Q86WG5	1849 aa		29.01	■■■□□ 2.23
CTBP2-208	ENST00000476817	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		29	■■■□□ 2.23
CTBP2-208	ENST00000476817	PLSCR1	O15162	318 aa		28.99	■■■□□ 2.23
CTBP2-208	ENST00000476817	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		28.98	■■■□□ 2.23
CTBP2-208	ENST00000476817	RREB1	Q92766	1687 aa		28.98	■■■□□ 2.23
CTBP2-208	ENST00000476817	RTL1	A6NKG5	1358 aa		28.98	■■■□□ 2.23
CTBP2-208	ENST00000476817	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		28.94	■■■□□ 2.22
CTBP2-208	ENST00000476817	NBPF14	Q5TI25	921 aa		28.94	■■■□□ 2.22
CTBP2-208	ENST00000476817	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	28.93	■■■□□ 2.22
CTBP2-208	ENST00000476817	KCNQ2	O43526	872 aa		28.93	■■■□□ 2.22
CTBP2-208	ENST00000476817	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		28.93	■■■□□ 2.22
CTBP2-208	ENST00000476817	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		28.91	■■■□□ 2.22
CTBP2-208	ENST00000476817	PROM2	Q8N271	834 aa		28.91	■■■□□ 2.22
CTBP2-208	ENST00000476817	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		28.91	■■■□□ 2.22
CTBP2-208	ENST00000476817	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		28.9	■■■□□ 2.22
CTBP2-208	ENST00000476817	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		28.9	■■■□□ 2.22
CTBP2-208	ENST00000476817	NBPF4	Q96M43	638 aa		28.9	■■■□□ 2.22
CTBP2-208	ENST00000476817	LRP5	O75197	1615 aa		28.89	■■■□□ 2.22
CTBP2-208	ENST00000476817	INSR	P06213	1382 aa		28.88	■■■□□ 2.21
CTBP2-208	ENST00000476817	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		28.88	■■■□□ 2.21
CTBP2-208	ENST00000476817	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	28.88	■■■□□ 2.21
CTBP2-208	ENST00000476817	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		28.88	■■■□□ 2.21
CTBP2-208	ENST00000476817	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	28.88	■■■□□ 2.21
CTBP2-208	ENST00000476817	FLT4	P35916	1363 aa		28.88	■■■□□ 2.21
CTBP2-208	ENST00000476817	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		28.87	■■■□□ 2.21
CTBP2-208	ENST00000476817	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	28.86	■■■□□ 2.21
CTBP2-208	ENST00000476817	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		28.85	■■■□□ 2.21
CTBP2-208	ENST00000476817	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		28.84	■■■□□ 2.21
CTBP2-208	ENST00000476817	PANK3	Q9H999	370 aa		28.84	■■■□□ 2.21
CTBP2-208	ENST00000476817	NHS	Q6T4R5	1651 aa		28.83	■■■□□ 2.21
CTBP2-208	ENST00000476817	TXNRD1	Q16881	649 aa		28.83	■■■□□ 2.21
CTBP2-208	ENST00000476817	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
CTBP2-208	ENST00000476817	MEGF6	O75095	1541 aa		28.83	■■■□□ 2.21
CTBP2-208	ENST00000476817	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	28.82	■■■□□ 2.2
CTBP2-208	ENST00000476817	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	28.8	■■■□□ 2.2

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