RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475330.1

CBX1P5-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 5, humanhuman

BASIC

Gene CBX1P5, Length 559 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P5-201ENST00000475330 SLC6A16Q9GZN6 736 aa9.5□□□□□ -0.89
CBX1P5-201ENST00000475330 ASXL2Q76L83 1435 aa9.49□□□□□ -0.89
CBX1P5-201ENST00000475330 VAC14Q08AM6 782 aa9.49□□□□□ -0.89
CBX1P5-201ENST00000475330 FKBPLQ9UIM3 349 aa9.49□□□□□ -0.89
CBX1P5-201ENST00000475330 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa9.49□□□□□ -0.89
CBX1P5-201ENST00000475330 GLMNQ92990 594 aa9.48□□□□□ -0.89
CBX1P5-201ENST00000475330 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
CBX1P5-201ENST00000475330 EVA1BQ9NVM1 165 aa9.48□□□□□ -0.89
CBX1P5-201ENST00000475330 SERPINA10Q9UK55 444 aa9.48□□□□□ -0.89
CBX1P5-201ENST00000475330 PTPRGP23470 1445 aa9.48□□□□□ -0.89
CBX1P5-201ENST00000475330 ABCC2Q92887 1545 aa9.47□□□□□ -0.89
CBX1P5-201ENST00000475330 KCNH2Q12809 1159 aa9.47□□□□□ -0.89
CBX1P5-201ENST00000475330 SPNS2Q8IVW8 549 aa9.47□□□□□ -0.89
CBX1P5-201ENST00000475330 HOMEZQ8IX15 550 aa9.47□□□□□ -0.89
CBX1P5-201ENST00000475330 NKX2-3Q8TAU0 364 aa9.47□□□□□ -0.89
CBX1P5-201ENST00000475330 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
CBX1P5-201ENST00000475330 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa9.46□□□□□ -0.89
CBX1P5-201ENST00000475330 CUL7Q14999 1698 aa9.46□□□□□ -0.89
CBX1P5-201ENST00000475330 CCDC24Q8N4L8 307 aa9.46□□□□□ -0.9
CBX1P5-201ENST00000475330 ARMC2Q8NEN0 867 aa9.46□□□□□ -0.9
CBX1P5-201ENST00000475330 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
CBX1P5-201ENST00000475330 PLB1Q6P1J6 1458 aa9.46□□□□□ -0.9
CBX1P5-201ENST00000475330 S1PR4O95977 384 aa9.45□□□□□ -0.9
CBX1P5-201ENST00000475330 KCNC4Q03721 635 aa9.44□□□□□ -0.9
CBX1P5-201ENST00000475330 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
CBX1P5-201ENST00000475330 IGF1RP08069 1367 aa9.43□□□□□ -0.9
CBX1P5-201ENST00000475330 ZBBXA8MT70 800 aa9.43□□□□□ -0.9
CBX1P5-201ENST00000475330 SOX11P35716 441 aa9.43□□□□□ -0.9
CBX1P5-201ENST00000475330 NR1H3Q13133 447 aa9.43□□□□□ -0.9
CBX1P5-201ENST00000475330 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa9.43□□□□□ -0.9
CBX1P5-201ENST00000475330 NBPF14Q5TI25 921 aa9.43□□□□□ -0.9
CBX1P5-201ENST00000475330 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa9.42□□□□□ -0.9
CBX1P5-201ENST00000475330 TNIKQ9UKE5 1360 aa9.42□□□□□ -0.9
CBX1P5-201ENST00000475330 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
CBX1P5-201ENST00000475330 FBXO45P0C2W1 286 aa9.42□□□□□ -0.9
CBX1P5-201ENST00000475330 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP9.42□□□□□ -0.9
CBX1P5-201ENST00000475330 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa9.42□□□□□ -0.9
CBX1P5-201ENST00000475330 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP9.42□□□□□ -0.9
CBX1P5-201ENST00000475330 UNC93B1Q9H1C4 597 aa9.42□□□□□ -0.9
CBX1P5-201ENST00000475330 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
CBX1P5-201ENST00000475330 SEMA3FQ13275 785 aa9.4□□□□□ -0.9
CBX1P5-201ENST00000475330 KDM5BQ9UGL1 1544 aa9.4□□□□□ -0.91
CBX1P5-201ENST00000475330 TEX14Q8IWB6 1497 aa9.4□□□□□ -0.91
CBX1P5-201ENST00000475330 UACAQ9BZF9 1416 aa9.39□□□□□ -0.91
CBX1P5-201ENST00000475330 PTK2Q05397 1052 aa9.39□□□□□ -0.91
CBX1P5-201ENST00000475330 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
CBX1P5-201ENST00000475330 PDXDC2PQ6P474 469 aa9.39□□□□□ -0.91
CBX1P5-201ENST00000475330 ALG2Q9H553 416 aa9.39□□□□□ -0.91
CBX1P5-201ENST00000475330 GPSM3Q9Y4H4 160 aa9.39□□□□□ -0.91
CBX1P5-201ENST00000475330 GGCXP38435 758 aa9.38□□□□□ -0.91
CBX1P5-201ENST00000475330 KIF21BO75037 1637 aa9.38□□□□□ -0.91
CBX1P5-201ENST00000475330 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
CBX1P5-201ENST00000475330 DISP1Q96F81 1524 aa9.36□□□□□ -0.91
CBX1P5-201ENST00000475330 LMTK3Q96Q04 1460 aa9.36□□□□□ -0.91
CBX1P5-201ENST00000475330 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa9.36□□□□□ -0.91
CBX1P5-201ENST00000475330 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa9.36□□□□□ -0.91
CBX1P5-201ENST00000475330 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
CBX1P5-201ENST00000475330 ILDR2Q71H61 639 aa9.35□□□□□ -0.91
CBX1P5-201ENST00000475330 ZNF592Q92610 1267 aa9.35□□□□□ -0.91
CBX1P5-201ENST00000475330 RNF223E7ERA6 249 aa9.34□□□□□ -0.91
CBX1P5-201ENST00000475330 LINC01559Q495D7 138 aa9.34□□□□□ -0.91
CBX1P5-201ENST00000475330 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa9.34□□□□□ -0.91
CBX1P5-201ENST00000475330 BAP1Q92560 729 aa9.34□□□□□ -0.91
CBX1P5-201ENST00000475330 IQGAP2Q13576 1575 aa9.33□□□□□ -0.92
CBX1P5-201ENST00000475330 ADAMTSL3P82987 1691 aa9.33□□□□□ -0.92
CBX1P5-201ENST00000475330 MMRN1Q13201 1228 aa9.33□□□□□ -0.92
CBX1P5-201ENST00000475330 AGERQ15109 404 aa9.33□□□□□ -0.92
CBX1P5-201ENST00000475330 ZBTB33Q86T24 672 aa9.33□□□□□ -0.92
CBX1P5-201ENST00000475330 ANKLE1Q8NAG6 615 aa9.33□□□□□ -0.92
CBX1P5-201ENST00000475330 ADAM32Q8TC27 787 aa9.33□□□□□ -0.92
CBX1P5-201ENST00000475330 OCSTAMPQ9BR26 566 aa9.33□□□□□ -0.92
CBX1P5-201ENST00000475330 CARD14Q9BXL6 1004 aa9.33□□□□□ -0.92
CBX1P5-201ENST00000475330 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa9.33□□□□□ -0.92
CBX1P5-201ENST00000475330 PTPRMP28827 1452 aa9.33□□□□□ -0.92
CBX1P5-201ENST00000475330 KIF27Q86VH2 1401 aa9.32□□□□□ -0.92
CBX1P5-201ENST00000475330 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa9.32□□□□□ -0.92
CBX1P5-201ENST00000475330 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa9.32□□□□□ -0.92
CBX1P5-201ENST00000475330 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
CBX1P5-201ENST00000475330 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
CBX1P5-201ENST00000475330 ZNF511Q8NB15 262 aa9.32□□□□□ -0.92
CBX1P5-201ENST00000475330 UCN2Q96RP3 112 aa9.32□□□□□ -0.92
CBX1P5-201ENST00000475330 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa9.32□□□□□ -0.92
CBX1P5-201ENST00000475330 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa9.32□□□□□ -0.92
CBX1P5-201ENST00000475330 WDR7Q9Y4E6 1490 aa9.32□□□□□ -0.92
CBX1P5-201ENST00000475330 CD109Q6YHK3 1445 aa9.31□□□□□ -0.92
CBX1P5-201ENST00000475330 CFAP43Q8NDM7 1665 aa9.3□□□□□ -0.92
CBX1P5-201ENST00000475330 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
CBX1P5-201ENST00000475330 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
CBX1P5-201ENST00000475330 PPP1R18Q6NYC8 613 aa9.3□□□□□ -0.92
CBX1P5-201ENST00000475330 FOXJ1Q92949 421 aa9.3□□□□□ -0.92
CBX1P5-201ENST00000475330 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
CBX1P5-201ENST00000475330 TRIM32Q13049 653 aa9.29□□□□□ -0.92
CBX1P5-201ENST00000475330 CFAP70Q5T0N1 1121 aa9.29□□□□□ -0.92
CBX1P5-201ENST00000475330 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa9.29□□□□□ -0.92
CBX1P5-201ENST00000475330 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CBX1P5-201ENST00000475330 RFX1P22670 979 aa9.28□□□□□ -0.92
CBX1P5-201ENST00000475330 PLA2G2CQ5R387 149 aa9.28□□□□□ -0.92
CBX1P5-201ENST00000475330 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
CBX1P5-201ENST00000475330 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
CBX1P5-201ENST00000475330 ARAP3Q8WWN8 1544 aa9.27□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 85 ms