RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473511.5

MIB2-208, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, human

TSL 5

Gene MIB2, Length 1,332 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MIB2-208	ENST00000473511	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		31.87	■■■□□ 2.69
MIB2-208	ENST00000473511	USP54	Q70EL1	1684 aa		31.87	■■■□□ 2.69
MIB2-208	ENST00000473511	CRB1	P82279	1406 aa		31.86	■■■□□ 2.69
MIB2-208	ENST00000473511	CDCA8	Q53HL2	280 aa		31.85	■■■□□ 2.69
MIB2-208	ENST00000473511	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		31.85	■■■□□ 2.69
MIB2-208	ENST00000473511	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		31.83	■■■□□ 2.69
MIB2-208	ENST00000473511	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	31.82	■■■□□ 2.68
MIB2-208	ENST00000473511	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	31.82	■■■□□ 2.68
MIB2-208	ENST00000473511	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		31.82	■■■□□ 2.68
MIB2-208	ENST00000473511	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		31.82	■■■□□ 2.68
MIB2-208	ENST00000473511	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		31.81	■■■□□ 2.68
MIB2-208	ENST00000473511	RGPD5	Q99666	1765 aa		31.8	■■■□□ 2.68
MIB2-208	ENST00000473511	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		31.79	■■■□□ 2.68
MIB2-208	ENST00000473511	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		31.78	■■■□□ 2.68
MIB2-208	ENST00000473511	PDE3B	Q13370	1112 aa		31.76	■■■□□ 2.68
MIB2-208	ENST00000473511	ABCC6	O95255	1503 aa		31.76	■■■□□ 2.68
MIB2-208	ENST00000473511	COG3	Q96JB2	828 aa		31.75	■■■□□ 2.67
MIB2-208	ENST00000473511	LTN1	O94822	1766 aa		31.75	■■■□□ 2.67
MIB2-208	ENST00000473511	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	31.74	■■■□□ 2.67
MIB2-208	ENST00000473511	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	31.73	■■■□□ 2.67
MIB2-208	ENST00000473511	MYOM1	P52179	1685 aa		31.72	■■■□□ 2.67
MIB2-208	ENST00000473511	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		31.72	■■■□□ 2.67
MIB2-208	ENST00000473511	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	31.71	■■■□□ 2.67
MIB2-208	ENST00000473511	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		31.71	■■■□□ 2.67
MIB2-208	ENST00000473511	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		31.7	■■■□□ 2.66
MIB2-208	ENST00000473511	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		31.7	■■■□□ 2.66
MIB2-208	ENST00000473511	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		31.68	■■■□□ 2.66
MIB2-208	ENST00000473511	FYB1	O15117	783 aa		31.68	■■■□□ 2.66
MIB2-208	ENST00000473511	BAG6	P46379	1132 aa		31.68	■■■□□ 2.66
MIB2-208	ENST00000473511	ERBB3	P21860	1342 aa		31.68	■■■□□ 2.66
MIB2-208	ENST00000473511	FBLN1	P23142	703 aa		31.67	■■■□□ 2.66
MIB2-208	ENST00000473511	LRRC37A3	O60309	1634 aa		31.67	■■■□□ 2.66
MIB2-208	ENST00000473511	TRIM37	O94972	964 aa		31.66	■■■□□ 2.66
MIB2-208	ENST00000473511	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		31.65	■■■□□ 2.66
MIB2-208	ENST00000473511	DDB1	Q16531	1140 aa		31.65	■■■□□ 2.66
MIB2-208	ENST00000473511	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		31.65	■■■□□ 2.66
MIB2-208	ENST00000473511	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		31.65	■■■□□ 2.66
MIB2-208	ENST00000473511	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		31.65	■■■□□ 2.66
MIB2-208	ENST00000473511	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		31.64	■■■□□ 2.66
MIB2-208	ENST00000473511	CCDC7	Q96M83	1385 aa		31.63	■■■□□ 2.65
MIB2-208	ENST00000473511	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		31.63	■■■□□ 2.65
MIB2-208	ENST00000473511	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	31.62	■■■□□ 2.65
MIB2-208	ENST00000473511	IP6K1	Q92551	441 aa		31.62	■■■□□ 2.65
MIB2-208	ENST00000473511	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	31.62	■■■□□ 2.65
MIB2-208	ENST00000473511	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	31.61	■■■□□ 2.65
MIB2-208	ENST00000473511	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		31.61	■■■□□ 2.65
MIB2-208	ENST00000473511	DISP2	A7MBM2	1401 aa		31.61	■■■□□ 2.65
MIB2-208	ENST00000473511	AMPH	P49418	695 aa		31.59	■■■□□ 2.65
MIB2-208	ENST00000473511	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	31.59	■■■□□ 2.65
MIB2-208	ENST00000473511	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		31.58	■■■□□ 2.65
MIB2-208	ENST00000473511	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	31.57	■■■□□ 2.64
MIB2-208	ENST00000473511	HOXC9	P31274	260 aa		31.56	■■■□□ 2.64
MIB2-208	ENST00000473511	APBA3	O96018	575 aa		31.55	■■■□□ 2.64
MIB2-208	ENST00000473511	PEAK1	Q9H792	1746 aa		31.54	■■■□□ 2.64
MIB2-208	ENST00000473511	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	31.54	■■■□□ 2.64
MIB2-208	ENST00000473511	EXOC5	O00471	708 aa		31.52	■■■□□ 2.64
MIB2-208	ENST00000473511	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	31.51	■■■□□ 2.64
MIB2-208	ENST00000473511	RTL1	A6NKG5	1358 aa		31.51	■■■□□ 2.63
MIB2-208	ENST00000473511	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	31.5	■■■□□ 2.63
MIB2-208	ENST00000473511	IL2RB	P14784	551 aa		31.5	■■■□□ 2.63
MIB2-208	ENST00000473511	TNS2	Q63HR2	1409 aa		31.5	■■■□□ 2.63
MIB2-208	ENST00000473511	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		31.49	■■■□□ 2.63
MIB2-208	ENST00000473511	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		31.48	■■■□□ 2.63
MIB2-208	ENST00000473511	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	31.47	■■■□□ 2.63
MIB2-208	ENST00000473511	PANK3	Q9H999	370 aa		31.44	■■■□□ 2.62
MIB2-208	ENST00000473511	SBF2	Q86WG5	1849 aa		31.43	■■■□□ 2.62
MIB2-208	ENST00000473511	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		31.43	■■■□□ 2.62
MIB2-208	ENST00000473511	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	31.42	■■■□□ 2.62
MIB2-208	ENST00000473511	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		31.42	■■■□□ 2.62
MIB2-208	ENST00000473511	FLT4	P35916	1363 aa		31.42	■■■□□ 2.62
MIB2-208	ENST00000473511	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		31.41	■■■□□ 2.62
MIB2-208	ENST00000473511	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		31.41	■■■□□ 2.62
MIB2-208	ENST00000473511	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		31.41	■■■□□ 2.62
MIB2-208	ENST00000473511	BCL9	O00512	1426 aa		31.41	■■■□□ 2.62
MIB2-208	ENST00000473511	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	31.4	■■■□□ 2.62
MIB2-208	ENST00000473511	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	31.39	■■■□□ 2.62
MIB2-208	ENST00000473511	INSR	P06213	1382 aa		31.38	■■■□□ 2.61
MIB2-208	ENST00000473511	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	31.38	■■■□□ 2.61
MIB2-208	ENST00000473511	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		31.37	■■■□□ 2.61
MIB2-208	ENST00000473511	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		31.37	■■■□□ 2.61
MIB2-208	ENST00000473511	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		31.37	■■■□□ 2.61
MIB2-208	ENST00000473511	NBPF4	Q96M43	638 aa		31.37	■■■□□ 2.61
MIB2-208	ENST00000473511	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		31.35	■■■□□ 2.61
MIB2-208	ENST00000473511	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	31.35	■■■□□ 2.61
MIB2-208	ENST00000473511	RREB1	Q92766	1687 aa		31.34	■■■□□ 2.61
MIB2-208	ENST00000473511	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	31.34	■■■□□ 2.61
MIB2-208	ENST00000473511	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		31.34	■■■□□ 2.61
MIB2-208	ENST00000473511	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	31.33	■■■□□ 2.61
MIB2-208	ENST00000473511	MEGF6	O75095	1541 aa		31.33	■■■□□ 2.61
MIB2-208	ENST00000473511	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		31.32	■■■□□ 2.6
MIB2-208	ENST00000473511	KCNQ2	O43526	872 aa		31.31	■■■□□ 2.6
MIB2-208	ENST00000473511	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		31.31	■■■□□ 2.6
MIB2-208	ENST00000473511	PLSCR1	O15162	318 aa		31.29	■■■□□ 2.6
MIB2-208	ENST00000473511	POLK	Q9UBT6	870 aa		31.29	■■■□□ 2.6
MIB2-208	ENST00000473511	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	31.28	■■■□□ 2.6
MIB2-208	ENST00000473511	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		31.27	■■■□□ 2.6
MIB2-208	ENST00000473511	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		31.27	■■■□□ 2.6
MIB2-208	ENST00000473511	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	31.27	■■■□□ 2.6
MIB2-208	ENST00000473511	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		31.27	■■■□□ 2.6
MIB2-208	ENST00000473511	NHS	Q6T4R5	1651 aa		31.27	■■■□□ 2.6

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