RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472598.5

SYP-205, Transcript of synaptophysin, humanhuman

TSL 3

Gene SYP, Length 761 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-205ENST00000472598 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
SYP-205ENST00000472598 KCNH5Q8NCM2 988 aa26.08■■□□□ 1.77
SYP-205ENST00000472598 CD163L1Q9NR16 1453 aa26.08■■□□□ 1.77
SYP-205ENST00000472598 TTC21AQ8NDW8 1320 aa26.08■■□□□ 1.77
SYP-205ENST00000472598 MON2Q7Z3U7 1717 aa26.08■■□□□ 1.76
SYP-205ENST00000472598 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa26.07■■□□□ 1.76
SYP-205ENST00000472598 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
SYP-205ENST00000472598 DISP2A7MBM2 1401 aa26.06■■□□□ 1.76
SYP-205ENST00000472598 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa26.05■■□□□ 1.76
SYP-205ENST00000472598 COL18A1P39060 1754 aa26.05■■□□□ 1.76
SYP-205ENST00000472598 NME9Q86XW9 330 aa26.04■■□□□ 1.76
SYP-205ENST00000472598 WDR17Q8IZU2 1322 aa26.04■■□□□ 1.76
SYP-205ENST00000472598 DDB1Q16531 1140 aa26.03■■□□□ 1.76
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SYP-205ENST00000472598 RGPD5Q99666 1765 aa26■■□□□ 1.75
SYP-205ENST00000472598 MYOM1P52179 1685 aa25.99■■□□□ 1.75
SYP-205ENST00000472598 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
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SYP-205ENST00000472598 SLC24A1O60721 1099 aa25.97■■□□□ 1.75
SYP-205ENST00000472598 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
SYP-205ENST00000472598 PTF1AQ7RTS3 328 aa25.97■■□□□ 1.75
SYP-205ENST00000472598 CARD10Q9BWT7 1032 aa25.97■■□□□ 1.75
SYP-205ENST00000472598 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
SYP-205ENST00000472598 A0A1W2PP64 1363 aa25.95■■□□□ 1.75
SYP-205ENST00000472598 NFAT5O94916 1531 aa25.95■■□□□ 1.74
SYP-205ENST00000472598 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP25.95■■□□□ 1.74
SYP-205ENST00000472598 USP31Q70CQ4 1352 aa25.95■■□□□ 1.74
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SYP-205ENST00000472598 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
SYP-205ENST00000472598 TERF2IPQ9NYB0 399 aa25.93■■□□□ 1.74
SYP-205ENST00000472598 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa25.93■■□□□ 1.74
SYP-205ENST00000472598 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa25.93■■□□□ 1.74
SYP-205ENST00000472598 OVOS2Q6IE36 1432 aa25.93■■□□□ 1.74
SYP-205ENST00000472598 NINLQ9Y2I6 1382 aa25.93■■□□□ 1.74
SYP-205ENST00000472598 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
SYP-205ENST00000472598 EXOC5O00471 708 aa25.92■■□□□ 1.74
SYP-205ENST00000472598 NBPF14Q5TI25 921 aa25.92■■□□□ 1.74
SYP-205ENST00000472598 USP54Q70EL1 1684 aa25.91■■□□□ 1.74
SYP-205ENST00000472598 LRRC37A3O60309 1634 aa25.91■■□□□ 1.74
SYP-205ENST00000472598 LRP5O75197 1615 aa25.91■■□□□ 1.74
SYP-205ENST00000472598 NLRP2Q9NX02 1062 aa25.9■■□□□ 1.74
SYP-205ENST00000472598 PEAK1Q9H792 1746 aa25.89■■□□□ 1.74
SYP-205ENST00000472598 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
SYP-205ENST00000472598 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
SYP-205ENST00000472598 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa25.86■■□□□ 1.73
SYP-205ENST00000472598 PLSCR1O15162 318 aa25.86■■□□□ 1.73
SYP-205ENST00000472598 ANKRD24Q8TF21 1146 aa25.86■■□□□ 1.73
SYP-205ENST00000472598 CCDC7Q96M83 1385 aa25.85■■□□□ 1.73
SYP-205ENST00000472598 RREB1Q92766 1687 aa25.85■■□□□ 1.73
SYP-205ENST00000472598 FBLN1P23142 703 aa25.85■■□□□ 1.73
SYP-205ENST00000472598 CDCA8Q53HL2 280 aa25.85■■□□□ 1.73
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SYP-205ENST00000472598 NUP188Q5SRE5 1749 aa25.85■■□□□ 1.73
SYP-205ENST00000472598 ERBB3P21860 1342 aa25.85■■□□□ 1.73
SYP-205ENST00000472598 WNK3Q9BYP7 1800 aa25.84■■□□□ 1.73
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SYP-205ENST00000472598 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
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SYP-205ENST00000472598 IL2RBP14784 551 aa25.79■■□□□ 1.72
SYP-205ENST00000472598 IP6K1Q92551 441 aa25.79■■□□□ 1.72
SYP-205ENST00000472598 COG3Q96JB2 828 aa25.79■■□□□ 1.72
SYP-205ENST00000472598 ABCC6O95255 1503 aa25.78■■□□□ 1.72
SYP-205ENST00000472598 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
SYP-205ENST00000472598 BCL9O00512 1426 aa25.77■■□□□ 1.72
SYP-205ENST00000472598 KIF20BQ96Q89 1820 aa25.76■■□□□ 1.71
SYP-205ENST00000472598 TXNRD1Q16881 649 aa25.75■■□□□ 1.71
SYP-205ENST00000472598 CARD14Q9BXL6 1004 aa25.75■■□□□ 1.71
SYP-205ENST00000472598 TNS2Q63HR2 1409 aa25.74■■□□□ 1.71
SYP-205ENST00000472598 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
SYP-205ENST00000472598 MAP3K19Q56UN5 1328 aa25.73■■□□□ 1.71
SYP-205ENST00000472598 AMPHP49418 695 aa25.73■■□□□ 1.71
SYP-205ENST00000472598 POLR3GLQ9BT43 218 aa25.73■■□□□ 1.71
SYP-205ENST00000472598 GGNBP2Q9H3C7 697 aa25.73■■□□□ 1.71
SYP-205ENST00000472598 SPON1Q9HCB6 807 aa25.73■■□□□ 1.71
SYP-205ENST00000472598 NSD3Q9BZ95 1437 aa25.71■■□□□ 1.71
SYP-205ENST00000472598 FYB1O15117 783 aa25.71■■□□□ 1.71
SYP-205ENST00000472598 HOXC9P31274 260 aa25.71■■□□□ 1.71
SYP-205ENST00000472598 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
SYP-205ENST00000472598 KAT6BQ8WYB5 2073 aa25.71■■□□□ 1.71
SYP-205ENST00000472598 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
SYP-205ENST00000472598 KIF7Q2M1P5 1343 aa25.69■■□□□ 1.7
SYP-205ENST00000472598 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
SYP-205ENST00000472598 STK32BQ9NY57 414 aa25.67■■□□□ 1.7
SYP-205ENST00000472598 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
SYP-205ENST00000472598 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa25.67■■□□□ 1.7
SYP-205ENST00000472598 ZBTB7AO95365 584 aa25.66■■□□□ 1.7
SYP-205ENST00000472598 SLC15A2Q16348 729 aa25.64■■□□□ 1.7
SYP-205ENST00000472598 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
SYP-205ENST00000472598 NBPF6Q5VWK0 638 aa25.62■■□□□ 1.69
SYP-205ENST00000472598 USHBP1Q8N6Y0 703 aa25.62■■□□□ 1.69
SYP-205ENST00000472598 NBPF4Q96M43 638 aa25.62■■□□□ 1.69
SYP-205ENST00000472598 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa25.61■■□□□ 1.69
SYP-205ENST00000472598 PANK3Q9H999 370 aa25.61■■□□□ 1.69
SYP-205ENST00000472598 NHSQ6T4R5 1651 aa25.6■■□□□ 1.69
SYP-205ENST00000472598 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.6■■□□□ 1.69
SYP-205ENST00000472598 RGPD2P0DJD1 1756 aa25.59■■□□□ 1.69
SYP-205ENST00000472598 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa25.59■■□□□ 1.69
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