RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469068.1

FGFR3-206, Transcript of fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

TSL 3

Gene FGFR3, Length 821 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3-206ENST00000469068 CAMKK2Q96RR4 588 aa22.17■■□□□ 1.14
FGFR3-206ENST00000469068 NUP188Q5SRE5 1749 aa22.17■■□□□ 1.14
FGFR3-206ENST00000469068 TTC21AQ8NDW8 1320 aa22.16■■□□□ 1.14
FGFR3-206ENST00000469068 SOX12O15370 315 aa22.16■■□□□ 1.14
FGFR3-206ENST00000469068 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa22.15■■□□□ 1.14
FGFR3-206ENST00000469068 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa22.15■■□□□ 1.14
FGFR3-206ENST00000469068 OVOS2Q6IE36 1432 aa22.15■■□□□ 1.14
FGFR3-206ENST00000469068 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa22.15■■□□□ 1.14
FGFR3-206ENST00000469068 PEAK1Q9H792 1746 aa22.14■■□□□ 1.14
FGFR3-206ENST00000469068 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.13
FGFR3-206ENST00000469068 KCNH5Q8NCM2 988 aa22.14■■□□□ 1.13
FGFR3-206ENST00000469068 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa22.14■■□□□ 1.13
FGFR3-206ENST00000469068 NFAT5O94916 1531 aa22.14■■□□□ 1.13
FGFR3-206ENST00000469068 CD163L1Q9NR16 1453 aa22.14■■□□□ 1.13
FGFR3-206ENST00000469068 WDR17Q8IZU2 1322 aa22.13■■□□□ 1.13
FGFR3-206ENST00000469068 TESK2Q96S53 571 aa22.13■■□□□ 1.13
FGFR3-206ENST00000469068 RGPD5Q99666 1765 aa22.12■■□□□ 1.13
FGFR3-206ENST00000469068 ABCC6O95255 1503 aa22.11■■□□□ 1.13
FGFR3-206ENST00000469068 ARHGEF25Q86VW2 580 aa22.11■■□□□ 1.13
FGFR3-206ENST00000469068 AXIN2Q9Y2T1 843 aa22.11■■□□□ 1.13
FGFR3-206ENST00000469068 USP54Q70EL1 1684 aa22.11■■□□□ 1.13
FGFR3-206ENST00000469068 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
FGFR3-206ENST00000469068 DDB1Q16531 1140 aa22.1■■□□□ 1.13
FGFR3-206ENST00000469068 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
FGFR3-206ENST00000469068 USP47Q96K76 1375 aa22.1■■□□□ 1.13
FGFR3-206ENST00000469068 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
FGFR3-206ENST00000469068 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa22.08■■□□□ 1.13
FGFR3-206ENST00000469068 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa22.08■■□□□ 1.13
FGFR3-206ENST00000469068 NME9Q86XW9 330 aa22.08■■□□□ 1.13
FGFR3-206ENST00000469068 A0A1W2PP64 1363 aa22.08■■□□□ 1.12
FGFR3-206ENST00000469068 SBF2Q86WG5 1849 aa22.07■■□□□ 1.12
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FGFR3-206ENST00000469068 TERF2IPQ9NYB0 399 aa22.06■■□□□ 1.12
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FGFR3-206ENST00000469068 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
FGFR3-206ENST00000469068 USP31Q70CQ4 1352 aa22.04■■□□□ 1.12
FGFR3-206ENST00000469068 NBPF14Q5TI25 921 aa22.04■■□□□ 1.12
FGFR3-206ENST00000469068 LTN1O94822 1766 aa22.04■■□□□ 1.12
FGFR3-206ENST00000469068 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
FGFR3-206ENST00000469068 CARD10Q9BWT7 1032 aa22.03■■□□□ 1.12
FGFR3-206ENST00000469068 CCDC7Q96M83 1385 aa22.02■■□□□ 1.12
FGFR3-206ENST00000469068 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.02■■□□□ 1.12
FGFR3-206ENST00000469068 TNS2Q63HR2 1409 aa22.01■■□□□ 1.11
FGFR3-206ENST00000469068 TMF1P82094 1093 aa22.01■■□□□ 1.11
FGFR3-206ENST00000469068 BCL9O00512 1426 aa22■■□□□ 1.11
FGFR3-206ENST00000469068 SLC24A1O60721 1099 aa22■■□□□ 1.11
FGFR3-206ENST00000469068 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
FGFR3-206ENST00000469068 NINLQ9Y2I6 1382 aa21.99■■□□□ 1.11
FGFR3-206ENST00000469068 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
FGFR3-206ENST00000469068 ERBB3P21860 1342 aa21.98■■□□□ 1.11
FGFR3-206ENST00000469068 PLSCR1O15162 318 aa21.96■■□□□ 1.11
FGFR3-206ENST00000469068 PTF1AQ7RTS3 328 aa21.96■■□□□ 1.11
FGFR3-206ENST00000469068 EXOC5O00471 708 aa21.95■■□□□ 1.1
FGFR3-206ENST00000469068 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa21.95■■□□□ 1.1
FGFR3-206ENST00000469068 NLRP2Q9NX02 1062 aa21.94■■□□□ 1.1
FGFR3-206ENST00000469068 NHSQ6T4R5 1651 aa21.94■■□□□ 1.1
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FGFR3-206ENST00000469068 ANKRD24Q8TF21 1146 aa21.91■■□□□ 1.1
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FGFR3-206ENST00000469068 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
FGFR3-206ENST00000469068 CDCA8Q53HL2 280 aa21.9■■□□□ 1.1
FGFR3-206ENST00000469068 SPON1Q9HCB6 807 aa21.9■■□□□ 1.1
FGFR3-206ENST00000469068 MYOM1P52179 1685 aa21.9■■□□□ 1.1
FGFR3-206ENST00000469068 IL2RBP14784 551 aa21.89■■□□□ 1.09
FGFR3-206ENST00000469068 FBLN1P23142 703 aa21.89■■□□□ 1.09
FGFR3-206ENST00000469068 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
FGFR3-206ENST00000469068 KCNQ2O43526 872 aa21.87■■□□□ 1.09
FGFR3-206ENST00000469068 GGNBP2Q9H3C7 697 aa21.87■■□□□ 1.09
FGFR3-206ENST00000469068 POLR3GLQ9BT43 218 aa21.86■■□□□ 1.09
FGFR3-206ENST00000469068 TXNRD1Q16881 649 aa21.85■■□□□ 1.09
FGFR3-206ENST00000469068 PROM2Q8N271 834 aa21.85■■□□□ 1.09
FGFR3-206ENST00000469068 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
FGFR3-206ENST00000469068 ACSBG1Q96GR2 724 aa21.85■■□□□ 1.09
FGFR3-206ENST00000469068 KIF20BQ96Q89 1820 aa21.85■■□□□ 1.09
FGFR3-206ENST00000469068 FYB1O15117 783 aa21.84■■□□□ 1.09
FGFR3-206ENST00000469068 MAP3K19Q56UN5 1328 aa21.83■■□□□ 1.09
FGFR3-206ENST00000469068 IP6K1Q92551 441 aa21.83■■□□□ 1.09
FGFR3-206ENST00000469068 STK32BQ9NY57 414 aa21.83■■□□□ 1.09
FGFR3-206ENST00000469068 BTAF1O14981 1849 aa21.83■■□□□ 1.08
FGFR3-206ENST00000469068 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
FGFR3-206ENST00000469068 NSD3Q9BZ95 1437 aa21.81■■□□□ 1.08
FGFR3-206ENST00000469068 AMPHP49418 695 aa21.81■■□□□ 1.08
FGFR3-206ENST00000469068 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP21.81■■□□□ 1.08
FGFR3-206ENST00000469068 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
FGFR3-206ENST00000469068 CARD14Q9BXL6 1004 aa21.81■■□□□ 1.08
FGFR3-206ENST00000469068 PAPPAQ13219 1627 aa21.8■■□□□ 1.08
FGFR3-206ENST00000469068 HOXC9P31274 260 aa21.8■■□□□ 1.08
FGFR3-206ENST00000469068 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
FGFR3-206ENST00000469068 RTL1A6NKG5 1358 aa21.78■■□□□ 1.08
FGFR3-206ENST00000469068 ZBTB7AO95365 584 aa21.78■■□□□ 1.08
FGFR3-206ENST00000469068 SLC15A2Q16348 729 aa21.78■■□□□ 1.08
FGFR3-206ENST00000469068 RGPD2P0DJD1 1756 aa21.77■■□□□ 1.08
FGFR3-206ENST00000469068 DOT1LQ8TEK3 1739 aa21.76■■□□□ 1.07
FGFR3-206ENST00000469068 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
FGFR3-206ENST00000469068 SHANK3Q9BYB0 1731 aa21.75■■□□□ 1.07
FGFR3-206ENST00000469068 MEGF6O75095 1541 aa21.74■■□□□ 1.07
FGFR3-206ENST00000469068 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
FGFR3-206ENST00000469068 DCAF8L1A6NGE4 600 aa21.72■■□□□ 1.07
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