RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468247.1

RERE-210, Transcript of arginine-glutamic acid dipeptide repeats, humanhuman

TSL 2

Gene RERE, Length 414 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RERE-210ENST00000468247 RGPD5Q99666 1765 aa29.55■■■□□ 2.32
RERE-210ENST00000468247 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
RERE-210ENST00000468247 PDE3BQ13370 1112 aa29.55■■■□□ 2.32
RERE-210ENST00000468247 FAM196AQ6ZSG2 479 aa29.55■■■□□ 2.32
RERE-210ENST00000468247 USP54Q70EL1 1684 aa29.55■■■□□ 2.32
RERE-210ENST00000468247 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
RERE-210ENST00000468247 USP47Q96K76 1375 aa29.54■■■□□ 2.32
RERE-210ENST00000468247 WDR17Q8IZU2 1322 aa29.54■■■□□ 2.32
RERE-210ENST00000468247 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa29.54■■■□□ 2.32
RERE-210ENST00000468247 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
RERE-210ENST00000468247 TRIM37O94972 964 aa29.53■■■□□ 2.32
RERE-210ENST00000468247 TERF2IPQ9NYB0 399 aa29.53■■■□□ 2.32
RERE-210ENST00000468247 DISP2A7MBM2 1401 aa29.5■■■□□ 2.31
RERE-210ENST00000468247 LRRC37A3O60309 1634 aa29.48■■■□□ 2.31
RERE-210ENST00000468247 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa29.47■■■□□ 2.31
RERE-210ENST00000468247 OVOS2Q6IE36 1432 aa29.47■■■□□ 2.31
RERE-210ENST00000468247 NINLQ9Y2I6 1382 aa29.47■■■□□ 2.31
RERE-210ENST00000468247 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa29.46■■■□□ 2.31
RERE-210ENST00000468247 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
RERE-210ENST00000468247 CLSPNQ9HAW4 1339 aa29.45■■■□□ 2.31
RERE-210ENST00000468247 ABCC6O95255 1503 aa29.45■■■□□ 2.31
RERE-210ENST00000468247 CARD10Q9BWT7 1032 aa29.45■■■□□ 2.31
RERE-210ENST00000468247 WNK3Q9BYP7 1800 aa29.45■■■□□ 2.3
RERE-210ENST00000468247 SLC24A1O60721 1099 aa29.44■■■□□ 2.3
RERE-210ENST00000468247 CAMKK2Q96RR4 588 aa29.44■■■□□ 2.3
RERE-210ENST00000468247 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa29.44■■■□□ 2.3
RERE-210ENST00000468247 APBA3O96018 575 aa29.43■■■□□ 2.3
RERE-210ENST00000468247 TMF1P82094 1093 aa29.43■■■□□ 2.3
RERE-210ENST00000468247 PEAK1Q9H792 1746 aa29.42■■■□□ 2.3
RERE-210ENST00000468247 LTN1O94822 1766 aa29.42■■■□□ 2.3
RERE-210ENST00000468247 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
RERE-210ENST00000468247 DDB1Q16531 1140 aa29.42■■■□□ 2.3
RERE-210ENST00000468247 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa29.4■■■□□ 2.3
RERE-210ENST00000468247 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa29.39■■■□□ 2.3
RERE-210ENST00000468247 ERBB3P21860 1342 aa29.39■■■□□ 2.3
RERE-210ENST00000468247 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP29.37■■■□□ 2.29
RERE-210ENST00000468247 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
RERE-210ENST00000468247 CCDC7Q96M83 1385 aa29.36■■■□□ 2.29
RERE-210ENST00000468247 FBLN1P23142 703 aa29.35■■■□□ 2.29
RERE-210ENST00000468247 PTF1AQ7RTS3 328 aa29.34■■■□□ 2.29
RERE-210ENST00000468247 ANKRD24Q8TF21 1146 aa29.34■■■□□ 2.29
RERE-210ENST00000468247 COG3Q96JB2 828 aa29.33■■■□□ 2.29
RERE-210ENST00000468247 NLRP2Q9NX02 1062 aa29.33■■■□□ 2.29
RERE-210ENST00000468247 PARD3Q8TEW0 1356 aa29.32■■■□□ 2.28
RERE-210ENST00000468247 SBF2Q86WG5 1849 aa29.31■■■□□ 2.28
RERE-210ENST00000468247 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
RERE-210ENST00000468247 RREB1Q92766 1687 aa29.31■■■□□ 2.28
RERE-210ENST00000468247 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP29.3■■■□□ 2.28
RERE-210ENST00000468247 IP6K1Q92551 441 aa29.3■■■□□ 2.28
RERE-210ENST00000468247 MAP3K19Q56UN5 1328 aa29.29■■■□□ 2.28
RERE-210ENST00000468247 FYB1O15117 783 aa29.29■■■□□ 2.28
RERE-210ENST00000468247 EXOC5O00471 708 aa29.28■■■□□ 2.28
RERE-210ENST00000468247 CDCA8Q53HL2 280 aa29.28■■■□□ 2.28
RERE-210ENST00000468247 GGNBP2Q9H3C7 697 aa29.28■■■□□ 2.28
RERE-210ENST00000468247 TNS2Q63HR2 1409 aa29.28■■■□□ 2.28
RERE-210ENST00000468247 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
RERE-210ENST00000468247 NUP188Q5SRE5 1749 aa29.27■■■□□ 2.28
RERE-210ENST00000468247 MYOM1P52179 1685 aa29.27■■■□□ 2.28
RERE-210ENST00000468247 BCL9O00512 1426 aa29.27■■■□□ 2.28
RERE-210ENST00000468247 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP29.26■■■□□ 2.27
RERE-210ENST00000468247 CARD14Q9BXL6 1004 aa29.25■■■□□ 2.27
RERE-210ENST00000468247 HOXC9P31274 260 aa29.24■■■□□ 2.27
RERE-210ENST00000468247 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
RERE-210ENST00000468247 IL2RBP14784 551 aa29.23■■■□□ 2.27
RERE-210ENST00000468247 LRP5O75197 1615 aa29.23■■■□□ 2.27
RERE-210ENST00000468247 AMPHP49418 695 aa29.21■■■□□ 2.27
RERE-210ENST00000468247 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
RERE-210ENST00000468247 PLSCR1O15162 318 aa29.19■■■□□ 2.26
RERE-210ENST00000468247 KIF20BQ96Q89 1820 aa29.18■■■□□ 2.26
RERE-210ENST00000468247 NSD3Q9BZ95 1437 aa29.18■■■□□ 2.26
RERE-210ENST00000468247 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
RERE-210ENST00000468247 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa29.17■■■□□ 2.26
RERE-210ENST00000468247 KCNQ2O43526 872 aa29.17■■■□□ 2.26
RERE-210ENST00000468247 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
RERE-210ENST00000468247 RTL1A6NKG5 1358 aa29.15■■■□□ 2.26
RERE-210ENST00000468247 PROM2Q8N271 834 aa29.15■■■□□ 2.26
RERE-210ENST00000468247 RGPD2P0DJD1 1756 aa29.14■■■□□ 2.26
RERE-210ENST00000468247 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.26
RERE-210ENST00000468247 NBPF14Q5TI25 921 aa29.14■■■□□ 2.26
RERE-210ENST00000468247 ACSBG1Q96GR2 724 aa29.14■■■□□ 2.26
RERE-210ENST00000468247 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP29.11■■■□□ 2.251e-6■■■□□ 17.3
RERE-210ENST00000468247 POLR3GLQ9BT43 218 aa29.11■■■□□ 2.25
RERE-210ENST00000468247 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
RERE-210ENST00000468247 NHSQ6T4R5 1651 aa29.11■■■□□ 2.25
RERE-210ENST00000468247 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa29.09■■■□□ 2.25
RERE-210ENST00000468247 NBPF6Q5VWK0 638 aa29.09■■■□□ 2.25
RERE-210ENST00000468247 NBPF4Q96M43 638 aa29.09■■■□□ 2.25
RERE-210ENST00000468247 MEGF6O75095 1541 aa29.08■■■□□ 2.25
RERE-210ENST00000468247 USHBP1Q8N6Y0 703 aa29.07■■■□□ 2.24
RERE-210ENST00000468247 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
RERE-210ENST00000468247 TXNRD1Q16881 649 aa29.06■■■□□ 2.24
RERE-210ENST00000468247 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa29.05■■■□□ 2.24
RERE-210ENST00000468247 INSRP06213 1382 aa29.04■■■□□ 2.24
RERE-210ENST00000468247 FLT4P35916 1363 aa29.04■■■□□ 2.24
RERE-210ENST00000468247 SHANK3Q9BYB0 1731 aa29.02■■■□□ 2.24
RERE-210ENST00000468247 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
RERE-210ENST00000468247 BTAF1O14981 1849 aa29.01■■■□□ 2.23
RERE-210ENST00000468247 KIF24Q5T7B8 1368 aa29.01■■■□□ 2.23
RERE-210ENST00000468247 CGNL1Q0VF96 1302 aa29■■■□□ 2.23
RERE-210ENST00000468247 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 169.8 ms