RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		24.48	■■□□□ 1.51
USP19-210	ENST00000465902	CCDC125	Q86Z20	511 aa		24.48	■■□□□ 1.51
USP19-210	ENST00000465902	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		24.48	■■□□□ 1.51
USP19-210	ENST00000465902	EP400	Q96L91	3159 aa		24.48	■■□□□ 1.51
USP19-210	ENST00000465902	PANK3	Q9H999	370 aa		24.47	■■□□□ 1.51
USP19-210	ENST00000465902	USP35	Q9P2H5	1018 aa		24.46	■■□□□ 1.51
USP19-210	ENST00000465902	COL18A1	P39060	1754 aa		24.45	■■□□□ 1.5
USP19-210	ENST00000465902	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		24.45	■■□□□ 1.5
USP19-210	ENST00000465902	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		24.45	■■□□□ 1.5
USP19-210	ENST00000465902	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	24.44	■■□□□ 1.5
USP19-210	ENST00000465902	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	24.44	■■□□□ 1.5
USP19-210	ENST00000465902	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		24.43	■■□□□ 1.5
USP19-210	ENST00000465902	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		24.43	■■□□□ 1.5
USP19-210	ENST00000465902	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	24.42	■■□□□ 1.5
USP19-210	ENST00000465902	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		24.41	■■□□□ 1.5
USP19-210	ENST00000465902	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		24.41	■■□□□ 1.5
USP19-210	ENST00000465902	FBLN1	P23142	703 aa		24.41	■■□□□ 1.5
USP19-210	ENST00000465902	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		24.41	■■□□□ 1.5
USP19-210	ENST00000465902	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		24.4	■■□□□ 1.5
USP19-210	ENST00000465902	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		24.39	■■□□□ 1.49
USP19-210	ENST00000465902	CCDC7	Q96M83	1385 aa		24.38	■■□□□ 1.49
USP19-210	ENST00000465902	AMPH	P49418	695 aa		24.37	■■□□□ 1.49
USP19-210	ENST00000465902	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		24.36	■■□□□ 1.49
USP19-210	ENST00000465902	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	24.36	■■□□□ 1.49
USP19-210	ENST00000465902	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		24.36	■■□□□ 1.49
USP19-210	ENST00000465902	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		24.35	■■□□□ 1.49
USP19-210	ENST00000465902	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		24.35	■■□□□ 1.49
USP19-210	ENST00000465902	CRB1	P82279	1406 aa		24.35	■■□□□ 1.49
USP19-210	ENST00000465902	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	24.35	■■□□□ 1.49
USP19-210	ENST00000465902	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		24.35	■■□□□ 1.49
USP19-210	ENST00000465902	ABCC6	O95255	1503 aa		24.35	■■□□□ 1.49
USP19-210	ENST00000465902	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	24.34	■■□□□ 1.49
USP19-210	ENST00000465902	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		24.33	■■□□□ 1.49
USP19-210	ENST00000465902	IP6K1	Q92551	441 aa		24.33	■■□□□ 1.49
USP19-210	ENST00000465902	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	24.33	■■□□□ 1.49
USP19-210	ENST00000465902	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	24.32	■■□□□ 1.48
USP19-210	ENST00000465902	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		24.32	■■□□□ 1.48
USP19-210	ENST00000465902	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	24.31	■■□□□ 1.48
USP19-210	ENST00000465902	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	24.31	■■□□□ 1.48
USP19-210	ENST00000465902	HOXC9	P31274	260 aa		24.3	■■□□□ 1.48
USP19-210	ENST00000465902	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		24.3	■■□□□ 1.48
USP19-210	ENST00000465902	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		24.3	■■□□□ 1.48
USP19-210	ENST00000465902	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	24.29	■■□□□ 1.48
USP19-210	ENST00000465902	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	24.29	■■□□□ 1.48
USP19-210	ENST00000465902	ERBB3	P21860	1342 aa		24.29	■■□□□ 1.48
USP19-210	ENST00000465902	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		24.28	■■□□□ 1.48
USP19-210	ENST00000465902	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		24.28	■■□□□ 1.48
USP19-210	ENST00000465902	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		24.27	■■□□□ 1.48
USP19-210	ENST00000465902	MORC1	Q86VD1	984 aa		24.27	■■□□□ 1.48
USP19-210	ENST00000465902	NSD2	O96028	1365 aa		24.27	■■□□□ 1.48
USP19-210	ENST00000465902	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	24.25	■■□□□ 1.47
USP19-210	ENST00000465902	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		24.25	■■□□□ 1.47
USP19-210	ENST00000465902	RTL1	A6NKG5	1358 aa		24.25	■■□□□ 1.47
USP19-210	ENST00000465902	PDE3B	Q13370	1112 aa		24.24	■■□□□ 1.47
USP19-210	ENST00000465902	FAM182B	Q5T319	152 aa		24.23	■■□□□ 1.47
USP19-210	ENST00000465902	PEAK1	Q9H792	1746 aa		24.23	■■□□□ 1.47
USP19-210	ENST00000465902	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		24.23	■■□□□ 1.47
USP19-210	ENST00000465902	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		24.23	■■□□□ 1.47
USP19-210	ENST00000465902	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	24.22	■■□□□ 1.47
USP19-210	ENST00000465902	FLT4	P35916	1363 aa		24.22	■■□□□ 1.47
USP19-210	ENST00000465902	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		24.22	■■□□□ 1.47
USP19-210	ENST00000465902	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	24.21	■■□□□ 1.47
USP19-210	ENST00000465902	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	24.21	■■□□□ 1.47
USP19-210	ENST00000465902	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	24.21	■■□□□ 1.47
USP19-210	ENST00000465902	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	24.2	■■□□□ 1.46
USP19-210	ENST00000465902	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	24.2	■■□□□ 1.46
USP19-210	ENST00000465902	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	24.2	■■□□□ 1.46
USP19-210	ENST00000465902	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		24.19	■■□□□ 1.46
USP19-210	ENST00000465902	BAG6	P46379	1132 aa		24.19	■■□□□ 1.46
USP19-210	ENST00000465902	DDB1	Q16531	1140 aa		24.19	■■□□□ 1.46
USP19-210	ENST00000465902	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		24.19	■■□□□ 1.46
USP19-210	ENST00000465902	POLK	Q9UBT6	870 aa		24.19	■■□□□ 1.46
USP19-210	ENST00000465902	INSR	P06213	1382 aa		24.18	■■□□□ 1.46
USP19-210	ENST00000465902	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		24.16	■■□□□ 1.46
USP19-210	ENST00000465902	LRRC37A3	O60309	1634 aa		24.15	■■□□□ 1.46
USP19-210	ENST00000465902	EXOC5	O00471	708 aa		24.15	■■□□□ 1.46
USP19-210	ENST00000465902	IL2RB	P14784	551 aa		24.15	■■□□□ 1.46
USP19-210	ENST00000465902	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		24.13	■■□□□ 1.45
USP19-210	ENST00000465902	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		24.13	■■□□□ 1.45
USP19-210	ENST00000465902	NBPF4	Q96M43	638 aa		24.13	■■□□□ 1.45
USP19-210	ENST00000465902	DISP2	A7MBM2	1401 aa		24.12	■■□□□ 1.45
USP19-210	ENST00000465902	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		24.12	■■□□□ 1.45
USP19-210	ENST00000465902	TRIM37	O94972	964 aa		24.11	■■□□□ 1.45
USP19-210	ENST00000465902	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	24.11	■■□□□ 1.45
USP19-210	ENST00000465902	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		24.07	■■□□□ 1.44
USP19-210	ENST00000465902	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		24.07	■■□□□ 1.44
USP19-210	ENST00000465902	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		24.07	■■□□□ 1.44
USP19-210	ENST00000465902	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	24.06	■■□□□ 1.44
USP19-210	ENST00000465902	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	24.06	■■□□□ 1.44
USP19-210	ENST00000465902	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		24.06	■■□□□ 1.44
USP19-210	ENST00000465902	TNS2	Q63HR2	1409 aa		24.06	■■□□□ 1.44
USP19-210	ENST00000465902	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	24.05	■■□□□ 1.44
USP19-210	ENST00000465902	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		24.05	■■□□□ 1.44
USP19-210	ENST00000465902	APBA3	O96018	575 aa		24.04	■■□□□ 1.44
USP19-210	ENST00000465902	MTHFS	P49914	203 aa		24.04	■■□□□ 1.44
USP19-210	ENST00000465902	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	24.03	■■□□□ 1.44
USP19-210	ENST00000465902	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	24.03	■■□□□ 1.44
USP19-210	ENST00000465902	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	24.03	■■□□□ 1.44
USP19-210	ENST00000465902	EYA1	Q99502	592 aa		24.03	■■□□□ 1.44
USP19-210	ENST00000465902	MEGF6	O75095	1541 aa		24.02	■■□□□ 1.44

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