RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464957.1

CPTP-202, Transcript of ceramide-1-phosphate transfer protein, humanhuman

TSL 2

Gene CPTP, Length 1,101 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPTP-202ENST00000464957 WDR17Q8IZU2 1322 aa43.25■■■■■ 4.51
CPTP-202ENST00000464957 TTC21AQ8NDW8 1320 aa43.25■■■■■ 4.51
CPTP-202ENST00000464957 AXIN2Q9Y2T1 843 aa43.25■■■■■ 4.51
CPTP-202ENST00000464957 LRRC37A3O60309 1634 aa43.24■■■■■ 4.51
CPTP-202ENST00000464957 ARHGEF25Q86VW2 580 aa43.22■■■■■ 4.51
CPTP-202ENST00000464957 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP43.21■■■■■ 4.51
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CPTP-202ENST00000464957 PEAK1Q9H792 1746 aa43.19■■■■■ 4.5
CPTP-202ENST00000464957 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP43.17■■■■■ 4.5
CPTP-202ENST00000464957 WNK3Q9BYP7 1800 aa43.15■■■■■ 4.5
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CPTP-202ENST00000464957 SBF2Q86WG5 1849 aa43.11■■■■■ 4.49
CPTP-202ENST00000464957 CARD10Q9BWT7 1032 aa43.11■■■■■ 4.49
CPTP-202ENST00000464957 CARD11Q9BXL7 1154 aa43.11■■■■■ 4.49
CPTP-202ENST00000464957 PLSCR1O15162 318 aa43.1■■■■■ 4.49
CPTP-202ENST00000464957 NFAT5O94916 1531 aa43.09■■■■■ 4.49
CPTP-202ENST00000464957 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP43.09■■■■■ 4.49
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CPTP-202ENST00000464957 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP43.08■■■■■ 4.49
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CPTP-202ENST00000464957 TMC1Q8TDI8 760 aa43.05■■■■■ 4.48
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CPTP-202ENST00000464957 EXOC5O00471 708 aa43.03■■■■■ 4.48
CPTP-202ENST00000464957 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP43.03■■■■■ 4.48
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CPTP-202ENST00000464957 PTF1AQ7RTS3 328 aa43.02■■■■■ 4.48
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CPTP-202ENST00000464957 KCNQ2O43526 872 aa43■■■■■ 4.47
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CPTP-202ENST00000464957 USP31Q70CQ4 1352 aa42.99■■■■■ 4.47
CPTP-202ENST00000464957 NME9Q86XW9 330 aa42.97■■■■■ 4.47
CPTP-202ENST00000464957 TONSLQ96HA7 1378 aa42.97■■■■■ 4.47
CPTP-202ENST00000464957 CD163L1Q9NR16 1453 aa42.94■■■■■ 4.47
CPTP-202ENST00000464957 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa42.93■■■■■ 4.46
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CPTP-202ENST00000464957 USP54Q70EL1 1684 aa42.92■■■■■ 4.46
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CPTP-202ENST00000464957 ANKRD24Q8TF21 1146 aa42.83■■■■■ 4.45
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CPTP-202ENST00000464957 STK32BQ9NY57 414 aa42.82■■■■■ 4.45
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CPTP-202ENST00000464957 FYB1O15117 783 aa42.37■■■■■ 4.37
CPTP-202ENST00000464957 DOT1LQ8TEK3 1739 aa42.35■■■■■ 4.37
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