RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459627.1

SH3BP5-208, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-208ENST00000459627 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa33.37■■■□□ 2.93
SH3BP5-208ENST00000459627 POLR3GLQ9BT43 218 aa33.36■■■□□ 2.93
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SH3BP5-208ENST00000459627 OVOS2Q6IE36 1432 aa33.35■■■□□ 2.93
SH3BP5-208ENST00000459627 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP33.34■■■□□ 2.93
SH3BP5-208ENST00000459627 CDCA8Q53HL2 280 aa33.34■■■□□ 2.93
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SH3BP5-208ENST00000459627 KIF7Q2M1P5 1343 aa32.97■■■□□ 2.87
SH3BP5-208ENST00000459627 RTL1A6NKG5 1358 aa32.96■■■□□ 2.87
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SH3BP5-208ENST00000459627 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP32.84■■■□□ 2.85
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SH3BP5-208ENST00000459627 RREB1Q92766 1687 aa32.78■■■□□ 2.84
SH3BP5-208ENST00000459627 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa32.78■■■□□ 2.84
SH3BP5-208ENST00000459627 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP32.78■■■□□ 2.84
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SH3BP5-208ENST00000459627 MORC1Q86VD1 984 aa32.77■■■□□ 2.84
SH3BP5-208ENST00000459627 NUP188Q5SRE5 1749 aa32.76■■■□□ 2.83
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SH3BP5-208ENST00000459627 NSD2O96028 1365 aa32.74■■■□□ 2.83
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