RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452514.6

MEG3-211, Transcript of maternally expressed 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene MEG3, Length 461 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEG3-211ENST00000452514 AXIN2Q9Y2T1 843 aa24.41■■□□□ 1.5
MEG3-211ENST00000452514 RGPD5Q99666 1765 aa24.41■■□□□ 1.5
MEG3-211ENST00000452514 GLI3P10071 1580 aa24.41■■□□□ 1.5
MEG3-211ENST00000452514 MAP3K19Q56UN5 1328 aa24.4■■□□□ 1.5
MEG3-211ENST00000452514 RXRBP28702 533 aa24.38■■□□□ 1.49
MEG3-211ENST00000452514 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
MEG3-211ENST00000452514 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
MEG3-211ENST00000452514 STRN4Q9NRL3 753 aa24.38■■□□□ 1.49
MEG3-211ENST00000452514 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa24.38■■□□□ 1.49
MEG3-211ENST00000452514 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
MEG3-211ENST00000452514 PEAK1Q9H792 1746 aa24.37■■□□□ 1.49
MEG3-211ENST00000452514 RTL1A6NKG5 1358 aa24.37■■□□□ 1.49
MEG3-211ENST00000452514 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
MEG3-211ENST00000452514 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
MEG3-211ENST00000452514 EVA1CP58658 441 aa24.35■■□□□ 1.49
MEG3-211ENST00000452514 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
MEG3-211ENST00000452514 IP6K1Q92551 441 aa24.35■■□□□ 1.49
MEG3-211ENST00000452514 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa24.35■■□□□ 1.49
MEG3-211ENST00000452514 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa24.35■■□□□ 1.49
MEG3-211ENST00000452514 MORC1Q86VD1 984 aa24.34■■□□□ 1.49
MEG3-211ENST00000452514 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
MEG3-211ENST00000452514 HOXC9P31274 260 aa24.33■■□□□ 1.49
MEG3-211ENST00000452514 AMPHP49418 695 aa24.33■■□□□ 1.49
MEG3-211ENST00000452514 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.48
MEG3-211ENST00000452514 KIF24Q5T7B8 1368 aa24.32■■□□□ 1.48
MEG3-211ENST00000452514 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
MEG3-211ENST00000452514 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
MEG3-211ENST00000452514 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa24.32■■□□□ 1.48
MEG3-211ENST00000452514 RGS12O14924 1447 aa24.32■■□□□ 1.48
MEG3-211ENST00000452514 CRB1P82279 1406 aa24.32■■□□□ 1.48
MEG3-211ENST00000452514 ERBB3P21860 1342 aa24.32■■□□□ 1.48
MEG3-211ENST00000452514 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa24.32■■□□□ 1.48
MEG3-211ENST00000452514 WDR17Q8IZU2 1322 aa24.32■■□□□ 1.48
MEG3-211ENST00000452514 FLT4P35916 1363 aa24.3■■□□□ 1.48
MEG3-211ENST00000452514 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
MEG3-211ENST00000452514 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
MEG3-211ENST00000452514 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
MEG3-211ENST00000452514 POLKQ9UBT6 870 aa24.3■■□□□ 1.48
MEG3-211ENST00000452514 ANKRD24Q8TF21 1146 aa24.28■■□□□ 1.48
MEG3-211ENST00000452514 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
MEG3-211ENST00000452514 INSRP06213 1382 aa24.27■■□□□ 1.48
MEG3-211ENST00000452514 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa24.26■■□□□ 1.47
MEG3-211ENST00000452514 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa24.26■■□□□ 1.47
MEG3-211ENST00000452514 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa24.26■■□□□ 1.47
MEG3-211ENST00000452514 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
MEG3-211ENST00000452514 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa24.25■■□□□ 1.47
MEG3-211ENST00000452514 USP35Q9P2H5 1018 aa24.25■■□□□ 1.47
MEG3-211ENST00000452514 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
MEG3-211ENST00000452514 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
MEG3-211ENST00000452514 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
MEG3-211ENST00000452514 TCP11L2Q8N4U5 519 aa24.24■■□□□ 1.47
MEG3-211ENST00000452514 SOCS7O14512 581 aa24.23■■□□□ 1.47
MEG3-211ENST00000452514 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
MEG3-211ENST00000452514 CARD10Q9BWT7 1032 aa24.23■■□□□ 1.47
MEG3-211ENST00000452514 WNK3Q9BYP7 1800 aa24.23■■□□□ 1.47
MEG3-211ENST00000452514 BARGINQ6ZT62 677 aa24.22■■□□□ 1.47
MEG3-211ENST00000452514 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
MEG3-211ENST00000452514 NLRP2Q9NX02 1062 aa24.21■■□□□ 1.47
MEG3-211ENST00000452514 RGPD2P0DJD1 1756 aa24.21■■□□□ 1.47
MEG3-211ENST00000452514 SEPT12Q8IYM1 358 aa24.2■■□□□ 1.46
MEG3-211ENST00000452514 BRWD3Q6RI45 1802 aa24.19■■□□□ 1.46
MEG3-211ENST00000452514 DISP2A7MBM2 1401 aa24.18■■□□□ 1.46
MEG3-211ENST00000452514 PARD3Q8TEW0 1356 aa24.17■■□□□ 1.46
MEG3-211ENST00000452514 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
MEG3-211ENST00000452514 MTHFSP49914 203 aa24.16■■□□□ 1.46
MEG3-211ENST00000452514 LRRC37A3O60309 1634 aa24.15■■□□□ 1.46
MEG3-211ENST00000452514 A0A0G2JS52 829 aa24.15■■□□□ 1.46
MEG3-211ENST00000452514 MYT1Q01538 1121 aa24.15■■□□□ 1.46
MEG3-211ENST00000452514 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
MEG3-211ENST00000452514 NBPF6Q5VWK0 638 aa24.14■■□□□ 1.45
MEG3-211ENST00000452514 NBPF4Q96M43 638 aa24.14■■□□□ 1.45
MEG3-211ENST00000452514 NCAPD2Q15021 1401 aa24.13■■□□□ 1.45
MEG3-211ENST00000452514 PPP2R1AP30153 589 aa24.11■■□□□ 1.45
MEG3-211ENST00000452514 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
MEG3-211ENST00000452514 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
MEG3-211ENST00000452514 USHBP1Q8N6Y0 703 aa24.1■■□□□ 1.45
MEG3-211ENST00000452514 IL2RBP14784 551 aa24.09■■□□□ 1.45
MEG3-211ENST00000452514 RGPD1P0DJD0 1748 aa24.08■■□□□ 1.45
MEG3-211ENST00000452514 KRT27Q7Z3Y8 459 aa24.08■■□□□ 1.45
MEG3-211ENST00000452514 EYA1Q99502 592 aa24.08■■□□□ 1.45
MEG3-211ENST00000452514 MEGF6O75095 1541 aa24.08■■□□□ 1.45
MEG3-211ENST00000452514 TNS2Q63HR2 1409 aa24.07■■□□□ 1.44
MEG3-211ENST00000452514 IGSF1Q8N6C5 1336 aa24.07■■□□□ 1.44
MEG3-211ENST00000452514 IL13P35225 146 aa24.06■■□□□ 1.44
MEG3-211ENST00000452514 RALBP1Q15311 655 aa24.06■■□□□ 1.44
MEG3-211ENST00000452514 DDB1Q16531 1140 aa24.05■■□□□ 1.44
MEG3-211ENST00000452514 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa24.04■■□□□ 1.44
MEG3-211ENST00000452514 PDE3BQ13370 1112 aa24.02■■□□□ 1.44
MEG3-211ENST00000452514 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
MEG3-211ENST00000452514 FAM182BQ5T319 152 aa24.01■■□□□ 1.43
MEG3-211ENST00000452514 SHANK3Q9BYB0 1731 aa24.01■■□□□ 1.43
MEG3-211ENST00000452514 EXOC5O00471 708 aa24■■□□□ 1.43
MEG3-211ENST00000452514 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa24■■□□□ 1.43
MEG3-211ENST00000452514 CFAP53Q96M91 514 aa24■■□□□ 1.43
MEG3-211ENST00000452514 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
MEG3-211ENST00000452514 PKD1L3Q7Z443 1732 aa23.98■■□□□ 1.43
MEG3-211ENST00000452514 TATP17735 454 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
MEG3-211ENST00000452514 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
MEG3-211ENST00000452514 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
MEG3-211ENST00000452514 KDRP35968 1356 aa23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.2 ms