RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446904.5

SH3BP4-206, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 829 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-206ENST00000446904 DDB1Q16531 1140 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP4-206ENST00000446904 PARD3Q8TEW0 1356 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4-206ENST00000446904 NME9Q86XW9 330 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4-206ENST00000446904 COL18A1P39060 1754 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4-206ENST00000446904 AKAP12Q02952 1782 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4-206ENST00000446904 LRP5O75197 1615 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4-206ENST00000446904 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4-206ENST00000446904 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4-206ENST00000446904 OVOS2Q6IE36 1432 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4-206ENST00000446904 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4-206ENST00000446904 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4-206ENST00000446904 MSH5O43196 834 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4-206ENST00000446904 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4-206ENST00000446904 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4-206ENST00000446904 CARD10Q9BWT7 1032 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4-206ENST00000446904 NFAT5O94916 1531 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4-206ENST00000446904 CD163L1Q9NR16 1453 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4-206ENST00000446904 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4-206ENST00000446904 USP31Q70CQ4 1352 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4-206ENST00000446904 NBPF14Q5TI25 921 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP4-206ENST00000446904 PTF1AQ7RTS3 328 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP4-206ENST00000446904 TERF2IPQ9NYB0 399 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP4-206ENST00000446904 LRRC37A3O60309 1634 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP4-206ENST00000446904 MON2Q7Z3U7 1717 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4-206ENST00000446904 PEAK1Q9H792 1746 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4-206ENST00000446904 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4-206ENST00000446904 TESK2Q96S53 571 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4-206ENST00000446904 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4-206ENST00000446904 NLRP2Q9NX02 1062 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4-206ENST00000446904 A0A1W2PP64 1363 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP4-206ENST00000446904 EXOC5O00471 708 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4-206ENST00000446904 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4-206ENST00000446904 CCDC7Q96M83 1385 aa14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4-206ENST00000446904 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SH3BP4-206ENST00000446904 RGPD5Q99666 1765 aa14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4-206ENST00000446904 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
SH3BP4-206ENST00000446904 NUP188Q5SRE5 1749 aa14.52□□□□□ -0.08
SH3BP4-206ENST00000446904 RREB1Q92766 1687 aa14.52□□□□□ -0.08
SH3BP4-206ENST00000446904 ABCC6O95255 1503 aa14.52□□□□□ -0.08
SH3BP4-206ENST00000446904 ERBB3P21860 1342 aa14.52□□□□□ -0.08
SH3BP4-206ENST00000446904 PLSCR1O15162 318 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP4-206ENST00000446904 ANKRD24Q8TF21 1146 aa14.52□□□□□ -0.09
SH3BP4-206ENST00000446904 BCL9O00512 1426 aa14.5□□□□□ -0.09
SH3BP4-206ENST00000446904 WNK3Q9BYP7 1800 aa14.5□□□□□ -0.09
SH3BP4-206ENST00000446904 TNS2Q63HR2 1409 aa14.49□□□□□ -0.09
SH3BP4-206ENST00000446904 PROM2Q8N271 834 aa14.49□□□□□ -0.09
SH3BP4-206ENST00000446904 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SH3BP4-206ENST00000446904 USP54Q70EL1 1684 aa14.49□□□□□ -0.09
SH3BP4-206ENST00000446904 NINLQ9Y2I6 1382 aa14.48□□□□□ -0.09
SH3BP4-206ENST00000446904 SBF2Q86WG5 1849 aa14.48□□□□□ -0.09
SH3BP4-206ENST00000446904 KCNQ2O43526 872 aa14.48□□□□□ -0.09
SH3BP4-206ENST00000446904 IL2RBP14784 551 aa14.48□□□□□ -0.09
SH3BP4-206ENST00000446904 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC24A1O60721 1099 aa14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4-206ENST00000446904 IP6K1Q92551 441 aa14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4-206ENST00000446904 ACSBG1Q96GR2 724 aa14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4-206ENST00000446904 COG3Q96JB2 828 aa14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4-206ENST00000446904 SPON1Q9HCB6 807 aa14.47□□□□□ -0.09
SH3BP4-206ENST00000446904 FBLN1P23142 703 aa14.46□□□□□ -0.09
SH3BP4-206ENST00000446904 TXNRD1Q16881 649 aa14.46□□□□□ -0.09
SH3BP4-206ENST00000446904 USP47Q96K76 1375 aa14.46□□□□□ -0.1
SH3BP4-206ENST00000446904 LTN1O94822 1766 aa14.45□□□□□ -0.1
SH3BP4-206ENST00000446904 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
SH3BP4-206ENST00000446904 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
SH3BP4-206ENST00000446904 MAP3K19Q56UN5 1328 aa14.44□□□□□ -0.1
SH3BP4-206ENST00000446904 TMF1P82094 1093 aa14.44□□□□□ -0.1
SH3BP4-206ENST00000446904 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP14.43□□□□□ -0.1
SH3BP4-206ENST00000446904 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa14.43□□□□□ -0.1
SH3BP4-206ENST00000446904 AMPHP49418 695 aa14.43□□□□□ -0.1
SH3BP4-206ENST00000446904 STK32BQ9NY57 414 aa14.43□□□□□ -0.1
SH3BP4-206ENST00000446904 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa14.43□□□□□ -0.1
SH3BP4-206ENST00000446904 ZBTB7AO95365 584 aa14.42□□□□□ -0.1
SH3BP4-206ENST00000446904 HOXC9P31274 260 aa14.42□□□□□ -0.1
SH3BP4-206ENST00000446904 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP14.42□□□□□ -0.1
SH3BP4-206ENST00000446904 GGNBP2Q9H3C7 697 aa14.42□□□□□ -0.1
SH3BP4-206ENST00000446904 FYB1O15117 783 aa14.41□□□□□ -0.1
SH3BP4-206ENST00000446904 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP14.41□□□□□ -0.1
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC15A2Q16348 729 aa14.4□□□□□ -0.1
SH3BP4-206ENST00000446904 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP14.39□□□□□ -0.11
SH3BP4-206ENST00000446904 NHSQ6T4R5 1651 aa14.39□□□□□ -0.11
SH3BP4-206ENST00000446904 KAT6BQ8WYB5 2073 aa14.38□□□□□ -0.11
SH3BP4-206ENST00000446904 CDCA8Q53HL2 280 aa14.38□□□□□ -0.11
SH3BP4-206ENST00000446904 PCGF6Q9BYE7 350 aa14.38□□□□□ -0.11
SH3BP4-206ENST00000446904 PTGER2P43116 358 aa14.37□□□□□ -0.11
SH3BP4-206ENST00000446904 USHBP1Q8N6Y0 703 aa14.37□□□□□ -0.11
SH3BP4-206ENST00000446904 CASZ1Q86V15 1759 aa14.37□□□□□ -0.11
SH3BP4-206ENST00000446904 RTL1A6NKG5 1358 aa14.36□□□□□ -0.11
SH3BP4-206ENST00000446904 NBPF6Q5VWK0 638 aa14.36□□□□□ -0.11
SH3BP4-206ENST00000446904 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP14.36□□□□□ -0.11
SH3BP4-206ENST00000446904 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP14.36□□□□□ -0.11
SH3BP4-206ENST00000446904 NBPF4Q96M43 638 aa14.36□□□□□ -0.11
SH3BP4-206ENST00000446904 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP14.35□□□□□ -0.11
SH3BP4-206ENST00000446904 CARD14Q9BXL6 1004 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP4-206ENST00000446904 LRRC4BQ9NT99 713 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP4-206ENST00000446904 MEGF6O75095 1541 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP4-206ENST00000446904 BTAF1O14981 1849 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4-206ENST00000446904 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF827Q17R98 1081 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4-206ENST00000446904 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 126.6 ms