RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439372.5

ATP6AP1-204, Transcript of ATPase H+ transporting accessory protein 1, human

TSL 4

Gene ATP6AP1, Length 604 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP6AP1-204	ENST00000439372	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	31.53	■■■□□ 2.64
ATP6AP1-204	ENST00000439372	ABCC6	O95255	1503 aa		31.53	■■■□□ 2.64
ATP6AP1-204	ENST00000439372	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	31.52	■■■□□ 2.64
ATP6AP1-204	ENST00000439372	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		31.51	■■■□□ 2.64
ATP6AP1-204	ENST00000439372	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	31.51	■■■□□ 2.63
ATP6AP1-204	ENST00000439372	STRN4	Q9NRL3	753 aa		31.51	■■■□□ 2.63
ATP6AP1-204	ENST00000439372	PEAK1	Q9H792	1746 aa		31.5	■■■□□ 2.63
ATP6AP1-204	ENST00000439372	GLI3	P10071	1580 aa		31.5	■■■□□ 2.63
ATP6AP1-204	ENST00000439372	VPS72	Q15906	364 aa		31.49	■■■□□ 2.63
ATP6AP1-204	ENST00000439372	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	31.47	■■■□□ 2.63
ATP6AP1-204	ENST00000439372	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	31.47	■■■□□ 2.63
ATP6AP1-204	ENST00000439372	MORC1	Q86VD1	984 aa		31.46	■■■□□ 2.63
ATP6AP1-204	ENST00000439372	EVA1C	P58658	441 aa		31.45	■■■□□ 2.63
ATP6AP1-204	ENST00000439372	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		31.44	■■■□□ 2.62
ATP6AP1-204	ENST00000439372	RXRB	P28702	533 aa		31.44	■■■□□ 2.62
ATP6AP1-204	ENST00000439372	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	31.44	■■■□□ 2.62
ATP6AP1-204	ENST00000439372	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	31.44	■■■□□ 2.62
ATP6AP1-204	ENST00000439372	ILDR2	Q71H61	639 aa		31.44	■■■□□ 2.62
ATP6AP1-204	ENST00000439372	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	31.44	■■■□□ 2.62
ATP6AP1-204	ENST00000439372	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	31.44	■■■□□ 2.62
ATP6AP1-204	ENST00000439372	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		31.44	■■■□□ 2.62
ATP6AP1-204	ENST00000439372	AMPH	P49418	695 aa		31.43	■■■□□ 2.62
ATP6AP1-204	ENST00000439372	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	31.43	■■■□□ 2.62
ATP6AP1-204	ENST00000439372	IP6K1	Q92551	441 aa		31.43	■■■□□ 2.62
ATP6AP1-204	ENST00000439372	HOXC9	P31274	260 aa		31.42	■■■□□ 2.62
ATP6AP1-204	ENST00000439372	RTL1	A6NKG5	1358 aa		31.42	■■■□□ 2.62
ATP6AP1-204	ENST00000439372	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		31.41	■■■□□ 2.62
ATP6AP1-204	ENST00000439372	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		31.41	■■■□□ 2.62
ATP6AP1-204	ENST00000439372	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	31.41	■■■□□ 2.62
ATP6AP1-204	ENST00000439372	POLK	Q9UBT6	870 aa		31.39	■■■□□ 2.62
ATP6AP1-204	ENST00000439372	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		31.38	■■■□□ 2.61
ATP6AP1-204	ENST00000439372	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		31.37	■■■□□ 2.61
ATP6AP1-204	ENST00000439372	CRB1	P82279	1406 aa		31.37	■■■□□ 2.61
ATP6AP1-204	ENST00000439372	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		31.37	■■■□□ 2.61
ATP6AP1-204	ENST00000439372	RGS12	O14924	1447 aa		31.36	■■■□□ 2.61
ATP6AP1-204	ENST00000439372	FLT4	P35916	1363 aa		31.36	■■■□□ 2.61
ATP6AP1-204	ENST00000439372	ERBB3	P21860	1342 aa		31.36	■■■□□ 2.61
ATP6AP1-204	ENST00000439372	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		31.36	■■■□□ 2.61
ATP6AP1-204	ENST00000439372	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	31.35	■■■□□ 2.61
ATP6AP1-204	ENST00000439372	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		31.35	■■■□□ 2.61
ATP6AP1-204	ENST00000439372	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	31.35	■■■□□ 2.61
ATP6AP1-204	ENST00000439372	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		31.35	■■■□□ 2.61
ATP6AP1-204	ENST00000439372	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	31.34	■■■□□ 2.61
ATP6AP1-204	ENST00000439372	USP35	Q9P2H5	1018 aa		31.34	■■■□□ 2.61
ATP6AP1-204	ENST00000439372	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	31.33	■■■□□ 2.61
ATP6AP1-204	ENST00000439372	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	31.33	■■■□□ 2.61
ATP6AP1-204	ENST00000439372	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		31.33	■■■□□ 2.61
ATP6AP1-204	ENST00000439372	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		31.33	■■■□□ 2.61
ATP6AP1-204	ENST00000439372	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		31.32	■■■□□ 2.6
ATP6AP1-204	ENST00000439372	INSR	P06213	1382 aa		31.31	■■■□□ 2.6
ATP6AP1-204	ENST00000439372	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	31.3	■■■□□ 2.6
ATP6AP1-204	ENST00000439372	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		31.3	■■■□□ 2.6
ATP6AP1-204	ENST00000439372	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		31.29	■■■□□ 2.6
ATP6AP1-204	ENST00000439372	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		31.27	■■■□□ 2.6
ATP6AP1-204	ENST00000439372	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		31.27	■■■□□ 2.6
ATP6AP1-204	ENST00000439372	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		31.26	■■■□□ 2.59
ATP6AP1-204	ENST00000439372	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	31.25	■■■□□ 2.59
ATP6AP1-204	ENST00000439372	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		31.24	■■■□□ 2.59
ATP6AP1-204	ENST00000439372	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		31.23	■■■□□ 2.59
ATP6AP1-204	ENST00000439372	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	31.23	■■■□□ 2.59
ATP6AP1-204	ENST00000439372	MTHFS	P49914	203 aa		31.22	■■■□□ 2.59
ATP6AP1-204	ENST00000439372	RALBP1	Q15311	655 aa		31.22	■■■□□ 2.59
ATP6AP1-204	ENST00000439372	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		31.21	■■■□□ 2.59
ATP6AP1-204	ENST00000439372		A0A0G2JS52	829 aa		31.21	■■■□□ 2.59
ATP6AP1-204	ENST00000439372	MYT1	Q01538	1121 aa		31.21	■■■□□ 2.59
ATP6AP1-204	ENST00000439372	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	31.21	■■■□□ 2.59
ATP6AP1-204	ENST00000439372	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		31.19	■■■□□ 2.58
ATP6AP1-204	ENST00000439372	NBPF4	Q96M43	638 aa		31.19	■■■□□ 2.58
ATP6AP1-204	ENST00000439372	DISP2	A7MBM2	1401 aa		31.18	■■■□□ 2.58
ATP6AP1-204	ENST00000439372	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	31.18	■■■□□ 2.58
ATP6AP1-204	ENST00000439372	PPP2R1A	P30153	589 aa		31.17	■■■□□ 2.58
ATP6AP1-204	ENST00000439372	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		31.17	■■■□□ 2.58
ATP6AP1-204	ENST00000439372	LRRC37A3	O60309	1634 aa		31.16	■■■□□ 2.58
ATP6AP1-204	ENST00000439372	ANP32C	O43423	234 aa		31.14	■■■□□ 2.58
ATP6AP1-204	ENST00000439372	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	31.14	■■■□□ 2.58
ATP6AP1-204	ENST00000439372	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	31.13	■■■□□ 2.57
ATP6AP1-204	ENST00000439372	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		31.11	■■■□□ 2.57
ATP6AP1-204	ENST00000439372	NCAPD2	Q15021	1401 aa		31.11	■■■□□ 2.57
ATP6AP1-204	ENST00000439372	EYA1	Q99502	592 aa		31.11	■■■□□ 2.57
ATP6AP1-204	ENST00000439372	MEGF6	O75095	1541 aa		31.08	■■■□□ 2.57
ATP6AP1-204	ENST00000439372	IL2RB	P14784	551 aa		31.08	■■■□□ 2.57
ATP6AP1-204	ENST00000439372	IL13	P35225	146 aa		31.08	■■■□□ 2.57
ATP6AP1-204	ENST00000439372	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		31.08	■■■□□ 2.57
ATP6AP1-204	ENST00000439372	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	31.08	■■■□□ 2.57
ATP6AP1-204	ENST00000439372	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	31.07	■■■□□ 2.56
ATP6AP1-204	ENST00000439372	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	31.06	■■■□□ 2.56
ATP6AP1-204	ENST00000439372	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		31.05	■■■□□ 2.56
ATP6AP1-204	ENST00000439372	CFAP53	Q96M91	514 aa		31.05	■■■□□ 2.56
ATP6AP1-204	ENST00000439372	DDB1	Q16531	1140 aa		31.04	■■■□□ 2.56
ATP6AP1-204	ENST00000439372	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	31.03	■■■□□ 2.56
ATP6AP1-204	ENST00000439372	FAM182B	Q5T319	152 aa		31.03	■■■□□ 2.56
ATP6AP1-204	ENST00000439372	TNS2	Q63HR2	1409 aa		31.03	■■■□□ 2.56
ATP6AP1-204	ENST00000439372	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		31.03	■■■□□ 2.56
ATP6AP1-204	ENST00000439372	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		31.01	■■■□□ 2.55
ATP6AP1-204	ENST00000439372	PDE3B	Q13370	1112 aa		31.01	■■■□□ 2.55
ATP6AP1-204	ENST00000439372	EXOC5	O00471	708 aa		30.99	■■■□□ 2.55
ATP6AP1-204	ENST00000439372	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		30.99	■■■□□ 2.55
ATP6AP1-204	ENST00000439372	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		30.98	■■■□□ 2.55
ATP6AP1-204	ENST00000439372	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		30.98	■■■□□ 2.55
ATP6AP1-204	ENST00000439372	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	30.97	■■■□□ 2.55

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