RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428918.1

CDH23-AS1-201, CDH23 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CDH23-AS1, Length 378 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH23-AS1-201ENST00000428918 BARGINQ6ZT62 677 aa22.62■■□□□ 1.21
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa22.62■■□□□ 1.21
CDH23-AS1-201ENST00000428918 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa22.62■■□□□ 1.21
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PDE3BQ13370 1112 aa22.6■■□□□ 1.21
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NFAT5O94916 1531 aa22.59■■□□□ 1.21
CDH23-AS1-201ENST00000428918 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.59■■□□□ 1.21
CDH23-AS1-201ENST00000428918 COG3Q96JB2 828 aa22.59■■□□□ 1.21
CDH23-AS1-201ENST00000428918 USP54Q70EL1 1684 aa22.58■■□□□ 1.21
CDH23-AS1-201ENST00000428918 WDR17Q8IZU2 1322 aa22.58■■□□□ 1.21
CDH23-AS1-201ENST00000428918 AXIN2Q9Y2T1 843 aa22.57■■□□□ 1.2
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FAM182BQ5T319 152 aa22.56■■□□□ 1.2
CDH23-AS1-201ENST00000428918 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.56■■□□□ 1.2
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ABCC6O95255 1503 aa22.56■■□□□ 1.2
CDH23-AS1-201ENST00000428918 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa22.56■■□□□ 1.2
CDH23-AS1-201ENST00000428918 OVOS2Q6IE36 1432 aa22.56■■□□□ 1.2
CDH23-AS1-201ENST00000428918 COL18A1P39060 1754 aa22.55■■□□□ 1.2
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FAM196AQ6ZSG2 479 aa22.54■■□□□ 1.2
CDH23-AS1-201ENST00000428918 BAG6P46379 1132 aa22.53■■□□□ 1.2
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LTN1O94822 1766 aa22.52■■□□□ 1.2
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DEFB132Q7Z7B7 95 aa22.51■■□□□ 1.19
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CARD10Q9BWT7 1032 aa22.51■■□□□ 1.19
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RGPD5Q99666 1765 aa22.5■■□□□ 1.19
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DDB1Q16531 1140 aa22.5■■□□□ 1.19
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RGPD1P0DJD0 1748 aa22.49■■□□□ 1.19
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CCDC7Q96M83 1385 aa22.49■■□□□ 1.19
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
CDH23-AS1-201ENST00000428918 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GGNBP2Q9H3C7 697 aa22.48■■□□□ 1.19
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NLRP2Q9NX02 1062 aa22.48■■□□□ 1.19
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ERBB3P21860 1342 aa22.48■■□□□ 1.19
CDH23-AS1-201ENST00000428918 EP400Q96L91 3159 aa22.48■■□□□ 1.19
CDH23-AS1-201ENST00000428918 AMPHP49418 695 aa22.47■■□□□ 1.19
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ANKRD24Q8TF21 1146 aa22.47■■□□□ 1.19
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FYB1O15117 783 aa22.46■■□□□ 1.19
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MYOM1P52179 1685 aa22.46■■□□□ 1.19
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TRIM37O94972 964 aa22.45■■□□□ 1.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NSD3Q9BZ95 1437 aa22.45■■□□□ 1.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa22.44■■□□□ 1.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 IP6K1Q92551 441 aa22.44■■□□□ 1.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KIF20BQ96Q89 1820 aa22.43■■□□□ 1.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LRRC37A3O60309 1634 aa22.43■■□□□ 1.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MAP3K19Q56UN5 1328 aa22.43■■□□□ 1.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 WNK3Q9BYP7 1800 aa22.43■■□□□ 1.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 EXOC5O00471 708 aa22.42■■□□□ 1.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 APBA3O96018 575 aa22.41■■□□□ 1.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CGNL1Q0VF96 1302 aa22.4■■□□□ 1.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HOXC9P31274 260 aa22.4■■□□□ 1.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CARD14Q9BXL6 1004 aa22.4■■□□□ 1.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RTL1A6NKG5 1358 aa22.39■■□□□ 1.18
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
CDH23-AS1-201ENST00000428918 IL2RBP14784 551 aa22.38■■□□□ 1.17
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FBLN1P23142 703 aa22.38■■□□□ 1.17
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DISP2A7MBM2 1401 aa22.38■■□□□ 1.17
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TNS2Q63HR2 1409 aa22.36■■□□□ 1.17
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PARD3Q8TEW0 1356 aa22.34■■□□□ 1.17
CDH23-AS1-201ENST00000428918 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FLT4P35916 1363 aa22.32■■□□□ 1.16
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KIF24Q5T7B8 1368 aa22.31■■□□□ 1.16
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PANK3Q9H999 370 aa22.31■■□□□ 1.16
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PEAK1Q9H792 1746 aa22.31■■□□□ 1.16
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CAMKK2Q96RR4 588 aa22.29■■□□□ 1.16
CDH23-AS1-201ENST00000428918 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
CDH23-AS1-201ENST00000428918 INSRP06213 1382 aa22.28■■□□□ 1.16
CDH23-AS1-201ENST00000428918 BCL9O00512 1426 aa22.28■■□□□ 1.16
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa22.26■■□□□ 1.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa22.26■■□□□ 1.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KNSTRNQ9Y448 316 aa22.26■■□□□ 1.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa22.26■■□□□ 1.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NBPF14Q5TI25 921 aa22.25■■□□□ 1.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NSD2O96028 1365 aa22.25■■□□□ 1.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SBF2Q86WG5 1849 aa22.24■■□□□ 1.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa22.24■■□□□ 1.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KIF7Q2M1P5 1343 aa22.24■■□□□ 1.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NBPF6Q5VWK0 638 aa22.23■■□□□ 1.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NBPF4Q96M43 638 aa22.23■■□□□ 1.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PLSCR1O15162 318 aa22.22■■□□□ 1.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 USHBP1Q8N6Y0 703 aa22.22■■□□□ 1.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ACSBG1Q96GR2 724 aa22.22■■□□□ 1.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RGPD2P0DJD1 1756 aa22.21■■□□□ 1.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TATP17735 454 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MORC1Q86VD1 984 aa22.21■■□□□ 1.15
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RREB1Q92766 1687 aa22.2■■□□□ 1.14
CDH23-AS1-201ENST00000428918 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.19■■□□□ 1.14
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa22.19■■□□□ 1.14
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MEGF6O75095 1541 aa22.18■■□□□ 1.14
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