RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428075.5

TRIOBP-209, Transcript of TRIO and F-actin binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene TRIOBP, Length 931 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBP-209ENST00000428075 TRIM37O94972 964 aa39.48■■■■□ 3.91
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TRIOBP-209ENST00000428075 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP39.47■■■■□ 3.91
TRIOBP-209ENST00000428075 WDR17Q8IZU2 1322 aa39.46■■■■□ 3.91
TRIOBP-209ENST00000428075 USP54Q70EL1 1684 aa39.46■■■■□ 3.91
TRIOBP-209ENST00000428075 RGPD5Q99666 1765 aa39.46■■■■□ 3.91
TRIOBP-209ENST00000428075 A0A1W2PP64 1363 aa39.46■■■■□ 3.91
TRIOBP-209ENST00000428075 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa39.44■■■■□ 3.9
TRIOBP-209ENST00000428075 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP39.44■■■■□ 3.9
TRIOBP-209ENST00000428075 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP39.42■■■■□ 3.9
TRIOBP-209ENST00000428075 CAMKK2Q96RR4 588 aa39.39■■■■□ 3.9
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TRIOBP-209ENST00000428075 PEAK1Q9H792 1746 aa39.34■■■■□ 3.89
TRIOBP-209ENST00000428075 CARD10Q9BWT7 1032 aa39.34■■■■□ 3.89
TRIOBP-209ENST00000428075 USP47Q96K76 1375 aa39.33■■■■□ 3.89
TRIOBP-209ENST00000428075 WNK3Q9BYP7 1800 aa39.33■■■■□ 3.89
TRIOBP-209ENST00000428075 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP39.33■■■■□ 3.89
TRIOBP-209ENST00000428075 APBA3O96018 575 aa39.33■■■■□ 3.89
TRIOBP-209ENST00000428075 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa39.32■■■■□ 3.89
TRIOBP-209ENST00000428075 OVOS2Q6IE36 1432 aa39.32■■■■□ 3.89
TRIOBP-209ENST00000428075 NINLQ9Y2I6 1382 aa39.32■■■■□ 3.88
TRIOBP-209ENST00000428075 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa39.3■■■■□ 3.88
TRIOBP-209ENST00000428075 DDB1Q16531 1140 aa39.3■■■■□ 3.88
TRIOBP-209ENST00000428075 SLC24A1O60721 1099 aa39.28■■■■□ 3.88
TRIOBP-209ENST00000428075 PCGF6Q9BYE7 350 aa39.27■■■■□ 3.88
TRIOBP-209ENST00000428075 LTN1O94822 1766 aa39.26■■■■□ 3.88
TRIOBP-209ENST00000428075 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa39.26■■■■□ 3.88
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TRIOBP-209ENST00000428075 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP39.25■■■■□ 3.87
TRIOBP-209ENST00000428075 PARD3Q8TEW0 1356 aa39.23■■■■□ 3.87
TRIOBP-209ENST00000428075 ERBB3P21860 1342 aa39.23■■■■□ 3.87
TRIOBP-209ENST00000428075 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa39.23■■■■□ 3.87
TRIOBP-209ENST00000428075 CLSPNQ9HAW4 1339 aa39.22■■■■□ 3.87
TRIOBP-209ENST00000428075 CCDC7Q96M83 1385 aa39.21■■■■□ 3.87
TRIOBP-209ENST00000428075 TMF1P82094 1093 aa39.21■■■■□ 3.87
TRIOBP-209ENST00000428075 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP39.21■■■■□ 3.87
TRIOBP-209ENST00000428075 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa39.21■■■■□ 3.87
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TRIOBP-209ENST00000428075 SBF2Q86WG5 1849 aa39.2■■■■□ 3.87
TRIOBP-209ENST00000428075 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP39.2■■■■□ 3.87
TRIOBP-209ENST00000428075 PTF1AQ7RTS3 328 aa39.2■■■■□ 3.87
TRIOBP-209ENST00000428075 LRP5O75197 1615 aa39.16■■■■□ 3.86
TRIOBP-209ENST00000428075 ANKRD24Q8TF21 1146 aa39.16■■■■□ 3.86
TRIOBP-209ENST00000428075 BCL9O00512 1426 aa39.15■■■■□ 3.86
TRIOBP-209ENST00000428075 NUP188Q5SRE5 1749 aa39.14■■■■□ 3.86
TRIOBP-209ENST00000428075 FBLN1P23142 703 aa39.14■■■■□ 3.86
TRIOBP-209ENST00000428075 NLRP2Q9NX02 1062 aa39.14■■■■□ 3.86
TRIOBP-209ENST00000428075 EXOC5O00471 708 aa39.12■■■■□ 3.85
TRIOBP-209ENST00000428075 IP6K1Q92551 441 aa39.12■■■■□ 3.85
TRIOBP-209ENST00000428075 COG3Q96JB2 828 aa39.12■■■■□ 3.85
TRIOBP-209ENST00000428075 TNS2Q63HR2 1409 aa39.1■■■■□ 3.85
TRIOBP-209ENST00000428075 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP39.1■■■■□ 3.85
TRIOBP-209ENST00000428075 MAP3K19Q56UN5 1328 aa39.09■■■■□ 3.85
TRIOBP-209ENST00000428075 FYB1O15117 783 aa39.08■■■■□ 3.85
TRIOBP-209ENST00000428075 PLSCR1O15162 318 aa39.05■■■■□ 3.84
TRIOBP-209ENST00000428075 IL2RBP14784 551 aa39.03■■■■□ 3.84
TRIOBP-209ENST00000428075 GGNBP2Q9H3C7 697 aa39.03■■■■□ 3.84
TRIOBP-209ENST00000428075 CDCA8Q53HL2 280 aa39.02■■■■□ 3.84
TRIOBP-209ENST00000428075 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP39.02■■■■□ 3.84
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TRIOBP-209ENST00000428075 HOXC9P31274 260 aa39.01■■■■□ 3.84
TRIOBP-209ENST00000428075 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP39.01■■■■□ 3.84
TRIOBP-209ENST00000428075 MYOM1P52179 1685 aa39■■■■□ 3.83
TRIOBP-209ENST00000428075 CARD14Q9BXL6 1004 aa39■■■■□ 3.83
TRIOBP-209ENST00000428075 PROM2Q8N271 834 aa38.99■■■■□ 3.83
TRIOBP-209ENST00000428075 KCNQ2O43526 872 aa38.97■■■■□ 3.83
TRIOBP-209ENST00000428075 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP38.96■■■■□ 3.83
TRIOBP-209ENST00000428075 NBPF14Q5TI25 921 aa38.96■■■■□ 3.83
TRIOBP-209ENST00000428075 AMPHP49418 695 aa38.95■■■■□ 3.83
TRIOBP-209ENST00000428075 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP38.94■■■■□ 3.82
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TRIOBP-209ENST00000428075 RTL1A6NKG5 1358 aa38.9■■■■□ 3.82
TRIOBP-209ENST00000428075 KIF20BQ96Q89 1820 aa38.89■■■■□ 3.82
TRIOBP-209ENST00000428075 ACSBG1Q96GR2 724 aa38.89■■■■□ 3.82
TRIOBP-209ENST00000428075 NHSQ6T4R5 1651 aa38.89■■■■□ 3.82
TRIOBP-209ENST00000428075 RGPD2P0DJD1 1756 aa38.89■■■■□ 3.82
TRIOBP-209ENST00000428075 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP38.88■■■■□ 3.81
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TRIOBP-209ENST00000428075 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP38.79■■■■□ 3.8
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TRIOBP-209ENST00000428075 INSRP06213 1382 aa38.77■■■■□ 3.8
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TRIOBP-209ENST00000428075 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP38.75■■■■□ 3.79
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TRIOBP-209ENST00000428075 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP38.72■■■■□ 3.79
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